半導体次世代シークエンサーによる消化器がんリスク集団特異的がん関連遺伝子多型解析

• 研究課題/領域番号: 26460757
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 疫学・予防医学
• 研究機関: 千葉県がんセンター(研究所)
• 研究代表者: 三上 春夫 千葉県がんセンター(研究所), がん予防センター, 部長 (10332355)
• 連携研究者: 永瀬 浩喜 千葉県がんセンター(研究所), 所長 (90322073)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 癌 / 遺伝学 / 遺伝子 / ゲノム / 人間生活環境

研究成果の概要

県内がん高発症地域の原因究明のため、胃がん発症40例、大腸がん発症43例、非がん33例についてIon Torrent PGM半導体シークエンサーによるゲノム解析を行った。さらに院内症例との比較や体細胞変異を検討することでリスクマーカー体細胞変異Signatureを同定し、がん予防、治療、予後予測への利用を目的とした。その結果アミノ酸変化により遺伝子の蛋白構造に影響を与え機能を変えることが予測される遺伝子として、胃がん2 遺伝子、大腸がん3遺伝子に着目し検討を進めている。臨床検体でも上記生殖細胞変異の一部で頻度が高いことが確認された。地域のがん予防、治療、予後予測へ繋がる結果であると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Associations between Dietary Patterns, ADRβ2 Gln27Glu and ADRβ3 Trp64Arg with Regard to Serum Triglyceride Levels: J-MICC Study. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nanri H, Nishida Y, Nakamura K, Tanaka K, Naito M, Yin G, Hamajima N, Takashima N, Suzuki S, Nindita Y, Kohno M, Uemura H, Koyama T, Hosono S, Mikami H, Kubo M, Tanaka H.
  • 雑誌名: Nutrients 巻: 8 号: 9 ページ: 545-545
  • DOI: 10.3390/nu8090545
  • NAID: 120007097697
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] "Influence of cigarette smoking and inflammatory gene polymorphisms on glycated hemoglobin in the Japanese general population" (2016)
  • 著者名/発表者名: Nishida Y, Hara M, Sakamoto T, Shinchi K, Kawai S, Naito M, Hamajima N, Kadota A, Suzuki S, Ibusuki R, Hirata A, Yamaguchi M, Kuriyama N, Oze I, Mikami H, Kubo M, Tanaka H.
  • 雑誌名: Prev. Med. Rep. 巻: 3 ページ: 288-295
  • DOI: 10.1016/j.pmedr.2016.03.010
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ALDH2 polymorphism is associated with fasting blood glucose through alcohol consumption in Japanese men. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yin G, Naito M, Wakai K, Morita E, Kawai S, Hamajima N, Suzuki S, Kita Y, Takezaki T, Tanaka K, Morita M, Uemura H, Ozaki E, Hosono S, Mikami H, Kubo M, Tanaka H; Japan Multi-institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study Group.
  • 雑誌名: Nagoya J Med Sci 巻: 78 ページ: 183-193
  • NAID: 120005756085
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Polymorphisms in CYP19A1, HSD17B1 and HSD17B2 genes and serum sex hormone level among postmenopausal Japanese women. Japan Multi-Institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study Group. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hosono S, Ito H, Oze I, Higaki Y, Morita E, Takashima N, Suzuki S, Shimatani K, Mikami H, Ohnaka K, Ozaki E. Katsuura-Kamano S, Kubo M, Nagata C, Naito M, Hamajima N, Tanaka H.
  • 雑誌名: Maturitas 巻: 62 号: 4 ページ: 394-401
  • DOI: 10.1016/j.maturitas.2015.08.003
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A variant of the CLOCK gene and related haplotypes are associated with the prevalence of type 2 diabetes in the Japanese population. Japan Multi-institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study Group. (2015)
  • 著者名/発表者名: Uemura H, Katsuura-Kamano S, Yamaguchi M, Arisawa K, Hamajima N, Hishida A, Kawai S, Oze I, Shinchi K, Takashima N, Suzuki S, Nakahata N, Mikami H, Ohnaka K, Kuriyama N, Kubo M, Tanaka H.
  • 雑誌名: J Diabetes 巻: online 号: 5 ページ: 667-676
  • DOI: 10.1111/1753-0407.12344
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Association between brain-muscle-ARNT-like protein-2 (BMAL2) gene polymorphism and type 2 diabetes mellitus in obese Japanese individuals: A cross-sectional analysis of the Japan Multi-institutional Collaborative Cohort Study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi M, Uemura H, Arisawa K, Katsuura-Kamano S, Hamajima N, Hishida A, Suma S, Oze I, Nakamura K, Takashima N, Suzuki S, Ibusuki R, Mikami H, Ohnaka K, Kuriyama N, Kubo M, Tanaka H.
  • 雑誌名: Diabetes Res. Clin. Pract. 巻: 110 号: 3 ページ: 301-308
  • DOI: 10.1016/j.diabres.2015.10.009
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Associations between polymorphisms of interleukin-6 and related cytokine genes and serum liver damage markers: a cross-sectional study in the Japan Multi-Institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto Y, Wakai K, Nakagawa H, Suma S, Sasakabe T, Sakamoto T, Takashima N, Suzuki S, Ogawa S, Ohnaka K, Kuriyama N, Arisawa K, Mikami H, Kubo M, Hosono S, Hamajima N, Tanaka H; J-MICC Study Group.
  • 雑誌名: Gene. 巻: 557 号: 2 ページ: 158-162
  • DOI: 10.1016/j.gene.2014.12.025
  • 査読あり
• [雑誌論文] GCK, GCKR polymorphisms and risk of chronic kidney disease in Japanese individuals: data from the J-MICC Study. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hishida A, Takashima N, Turin TC, Kawai S, Wakai K, Hamajima N, Hosono S, Nishida Y, Suzuki S, Nakahata N, Mikami H, Ohnaka K, Matsui D, Katsuura-Kamano S, Kubo M, Tanaka H, Kita Y.
  • 雑誌名: J Nephrol 巻: 27(2) 号: 2 ページ: 143-149
  • DOI: 10.1007/s40620-013-0025-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] A polymorphism near MC4R gene (rs17782313) is associated with serum triglyceride levels in the general Japanese population: the J-MICC Study. (2014)
  • 著者名/発表者名: Katsuura-Kamano S, Uemura H, Arisawa K, Yamaguchi M, Hamajima N, Wakai K, Okada R, Suzuki S, Taguchi N, Kita Y, Ohnaka K, Kairupan TS, Matsui D, Oze I, Mikami H, Kubo M, Tanaka H.
  • 雑誌名: Endocrine. 巻: 47 号: 1 ページ: 81-89
  • DOI: 10.1007/s12020-014-0306-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Associations between hOGG1 Ser326Cys polymorphism and increased body mass index and fasting glucose level in the Japanese general population. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hara M, Nakamura K, Nanri H, Nishida Y, Hishida A, Kawai S, Hamajima N, Kita Y, Suzuki S, Mantjoro EM, Ohnaka K, Uemura H, Matsui D, Oze I, Mikami H, Kubo M, Tanaka H; Japan Multi-Institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study Group.
  • 雑誌名: J Epidemiol. 巻: 24 ページ: 379-384
  • NAID: 130004449419
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Polymorphisms of genes involved in lipid metabolism and risk of chronic kidney disease in Japanese - cross-sectional data from the J-MICC study. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hishida A, Wakai K, Naito M, Suma S, Sasakabe T, Hamajima N, Hosono S, Horita M, Turin TC, Suzuki S, Kairupan TS, Mikami H, Ohnaka K, Watanabe I, Uemura H, Kubo M, Tanaka H; J-MICC Study Group.
  • 雑誌名: Lipids Health Dis. 巻: 13 号: 1 ページ: 162-162
  • DOI: 10.1186/1476-511x-13-162
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 前向きコホート研究による胃がん高リスク群でのアミノ酸変化を伴う多型の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 滝口伸浩、中村洋子、三上春夫、永瀬 浩喜
  • 学会等名: 第54回日本癌治療学会学術集会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2016-10-20
• [学会発表] Analysis of non-synonymous genetic variations associated with cancer risk by a prospective cohort study 前向きコホート研究によるがんの高リスク群でのアミノ酸変化を伴う多型の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: Yohko Nakamura, Yoshiaki Maru, Yasutoshi Tatsumi, Kazuhiro Okumura, Sana Yokoi, Miki Ohira,, Yoshihiro Nabeya, Satoshi Fukasawa, Jin Katayama Hiroki Nagase, Haruo Mikami
  • 学会等名: 第75回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2016-10-06
• [学会発表] 半導体次世代シークエンサーによるリスク集団特異的がん関連遺伝子多型解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、丸喜明、巽康年、横井左奈、大平美紀,、中村友紀、高山喜美子、稲田潤子、片山稔、永瀬浩喜、三上春夫
  • 学会等名: 第53回日本癌治療学会学術集会
  • 発表場所: 京都国際会館
  • 年月日: 2015-10-29
• [学会発表] 半導体次世代シークエンサーによるリスク集団特異的がん関連遺伝子多型解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村洋子、丸喜明、巽康年、横井左奈、大平美紀、中村友紀、高山喜美子、稲田潤子、田中尚武、山本尚人、鍋谷圭宏、滝口伸浩、植田健、片山稔、永瀬浩喜、三上春夫
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第60回大会
  • 発表場所: 京王プラザホテル
  • 年月日: 2015-10-14
• [学会発表] Analysis of cancer risk-associated genetic variations by using semiconductor-based next-gen sequencings in J-MICC study (2015)
  • 著者名/発表者名: Yohko Nakamura, Yoshiaki Maru, Yasutoshi Tatsumi, Sana Yokoi, Miki Ohira, Yuki Nakamura, Kimiko Takayama, Junko Inada, Jin Katayama, Hiroki Nagase, Haruo Mikami
  • 学会等名: 第74回日本癌学会学術集会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2015-10-08
• [備考] 千葉県がんセンター研究所
  • URL: http://www.pref.chiba.lg.jp/gan/kenkyujo/
• [備考] 千葉県がんセンター研究所
  • URL: http://www.pref.chiba.lg.jp/gan/kenkyujo/index.html