次世代シークエンサを用いた胸腺癌新規治療標的遺伝子の同定

• 研究課題/領域番号: 26461206
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 呼吸器内科学
• 研究機関: 国立研究開発法人国立がん研究センター
• 研究代表者: 藤原 豊 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医長 (70464261)
• 研究協力者: 朝尾 哲彦 ; 河野 隆志 ; 市川 仁 ; 齋藤 元伸
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2016年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2014年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
• キーワード: 胸腺癌 / 化学療法 / 遺伝子Profile / 次世代シークエンサー / thymic carcinoma / TET2 / DNA methylation / 胸腺がん / がん遺伝子 / 遺伝子増幅 / 遺伝子変異 / 遺伝子癒合 / 遺伝子融合

研究成果の概要

本研究の目的は、胸腺癌組織のゲノム・トランスクリプトーム解析により、治療標的となりうる変異・増幅・融合等の遺伝子異常の同定を行うことである。胸腺癌52例のFFPE腫瘍組織でIonAmpliseq Cancer Hotspot Panel v2によるがん遺伝子hot spotの遺伝子変異解析が行われ、7人の患者にTP53, KRAS, FBXW7, NRASの変異が同定された。腫瘍組織および正常組織の新鮮凍結組織(10例)で次世代シークエンサー解析を行い、C>T transitionsが63.4%と優位であり、TET2変異と高頻度のメチル化、mRNA発現レベルの低下の相関を認めた。

研究成果

• [雑誌論文] Medical treatment involving investigational drugs and genetic profile of thymic carcinoma. (2016)
  • 著者名/発表者名: Asao T, Fujiwara Y, Sunami K, Kitahara S, Goto Y, Kanda S, Horinouchi H, Nokihara H, Yamamoto N, Ichikawa H, Kohno T, Tsuta K, Watanabe S, Takahashi K, Ohe Y.
  • 雑誌名: Lung Cancer 巻: 93 ページ: 77-81
  • DOI: 10.1016/j.lungcan.2016.01.004
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] Retrospective analysis of 64 consecutive patients with thymic cancer (2015)
  • 著者名/発表者名: Tetsuhiko Asao, Yutaka Fujiwara, Kuniko Sunami, Shinsuke Kitahara, Shintaro Kanda, Hidehito Horinouchi, Hiroshi Nokihara, Noboru Yamamoto, Reika Iwakawa-Kawabata, Takashi Kohno, Koji Tsuta, Shun-ichi Watanabe, Hisao Asanuma, and Yuichiro Ohe
  • 学会等名: 第112回日本内科学会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2015-04-10