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次世代シーケンサーを用いた胃癌・GIST患者末梢血中腫瘍由来浮遊DNAの検出

研究課題

研究課題/領域番号 26461977
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 消化器外科学
研究機関大阪大学

研究代表者

黒川 幸典  大阪大学, 医学系研究科, 助教 (10470197)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2016年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードctDNA / 次世代シーケンサー / 胃癌 / GIST
研究成果の概要

胃癌およびイマチニブ耐性GISTの持つ変異について、末梢血中に浮遊している腫瘍由来のDNA断片(ctDNA)として検出できるかどうか検討した。
胃癌症例6例に対して血漿中に遊離しているDNAの抽出を行い、6例中3例で腫瘍と同一のTP53変異を持つctDNAを検出できた。これら3例におけるctDNAの存在比率は病勢を反映していた。一方、イマチニブ耐性GISTの4例中3例でC-KIT exon13、1例でexon18の1塩基置換が認められた。これら腫瘍と同一のC-KIT変異を持つctDNAの存在比率は0.010-9.385%であり、この存在比率は腫瘍量や病勢との相関を認めた。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Detecting secondary c-KIT mutations in the peripheral blood of patients with imatinib-resistant gastrointestinal stromal tumor.2016

    • 著者名/発表者名
      Wada N, Kurokawa Y, Takahashi T, Hamakawa T, Hirota S, Naka T, Miyazaki Y, Makino T, Yamasaki M, Nakajima K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y.
    • 雑誌名

      Oncology

      巻: 90 号: 2 ページ: 112-117

    • DOI

      10.1159/000442948

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Monitoring gastric cancer progression with circulating tumour DNA2015

    • 著者名/発表者名
      Hamakawa T, Kukita Y, Kurokawa Y, Miyazaki Y, Takahashi T, Yamasaki M, Miyata H, Nakajima K, Taniguchi K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y, Kato K
    • 雑誌名

      British Journal of Cancer

      巻: 112 号: 2 ページ: 352-356

    • DOI

      10.1038/bjc.2014.609

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] イマチニブ耐性GIST患者の末梢血におけるC-KITの変異検索2016

    • 著者名/発表者名
      和田範子、黒川幸典、高橋剛、宮崎安弘、牧野知紀、山崎誠、中島清一、瀧口修司、森正樹、土岐祐一郎
    • 学会等名
      第71回日本消化器外科学会総会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2016-07-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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