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質量分析法による金属結合タンパク質の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 26505016
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 オミクス計測科学
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所 (2015-2016)
独立行政法人理化学研究所 (2014)

研究代表者

浅川 大樹  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 分析計測標準研究部門, 主任研究員 (60584365)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードAnalytical Chemistry / Mass Spectrometry / 金属-ペプチド複合体 / タンデム質量分析 / 電子移動解離 / 電子捕獲解離 / 密度汎関数理論 / リン酸化ペプチド / 金属結合サイト
研究成果の概要

金属結合タンパク質の構造解析手法開発の基礎研究として、金属-ペプチド複合体の質量分析におけるフラグメンテーション過程について研究を行った。
まずペプチドの電子移動解離タンデム質量分析法において金属塩添加により生成する金属-ペプチド複合体をプレッカーサーイオンとして用いることでアミノ酸配列を反映する良好なスペクトルが得られることを明らかにした。このメカニズムについて検討するために計算化学を用いて、遊離プロトンを含まない金属-ペプチド複合体を計算化学により設計し、メカニズムを明らかにした。さらにこのメカニズムを応用し、リン酸基と特異的に結合する金属錯体を用いリン酸化ペプチドの配列解析法を開発した。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 産業財産権 (1件)

  • [国際共同研究] リエージュ大学(ベルギー)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Direct MALDI-MS Analysis of the Disulfide Bonds in Peptide Using Thiosalicylic Acid as a Reactive Matrix2017

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, I. Osaka
    • 雑誌名

      J. Mass Spectrom.

      巻: 52 号: 2 ページ: 127-131

    • DOI

      10.1002/jms.3906

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] High-Confidence Sequencing of Phosphopeptides by Electon Transfer Dissociation Mass Spectrometry Using Dinuclear Zinc(II) Complex2016

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, I. Osaka
    • 雑誌名

      Anal. Chem.

      巻: 88 号: 24 ページ: 12393-12402

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.6b03645

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] N–Cα Bond Cleavage of Zinc-Polyhistidine Complexes in Electron Transfer Dissociation Mediated by Zwitterion Formation. Experimental Evidence and Theoretical Analysis of the Utah-Washington Model2016

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, A. Yamashita, S. Kawai, T. Takeuchi, Y. Wada
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 120 号: 5 ページ: 891-901

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b11118

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Estimation of Peptide N-Cα Bond Cleavage Efficiency during MALDI-ISD Using a Cyclic Peptide2016

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, N. Smargiasso, E. De Pauw
    • 雑誌名

      Journal of Mass Spectrometry

      巻: 51 号: 5 ページ: 323-327

    • DOI

      10.1002/jms.3748

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Difference of Electron Capture and Transfer Dissociation Mass Spectrometry on Ni2+-, Cu2+- and Zn2+-Polyhistidine Complexes in the Absence of Remote Protons2016

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, E. De Pauw
    • 雑誌名

      Journal of the American Society for Mass Spectrometry

      巻: - 号: 7 ページ: 1165-1175

    • DOI

      10.1007/s13361-016-1395-z

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Influence of Metal-Peptide Complexation on Fragmentation and Inter-Fragment Hydrogen Migration in Electron Transfer Dissociation2014

    • 著者名/発表者名
      D. Asakawa, T. Takeuchi, A. Yamashita, Y. Wada
    • 雑誌名

      J. Am. Soc. Mass Spectrom

      巻: 25 号: 6 ページ: 1029-1039

    • DOI

      10.1007/s13361-014-0855-6

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electron transfer dissociation mass spectrometry of peptides containing free cysteine using group XII metals as a charge carrier2014

    • 著者名/発表者名
      Asakawa D, Wada Y.
    • 雑誌名

      J Phys Chem B

      巻: 118 号: 43 ページ: 12318-25

    • DOI

      10.1021/jp502818u

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Density functional theory calculation, Metal reduction, Zwitterion formation, Hydrogen radical loss, Peptide bond cleavage2016

    • 著者名/発表者名
      Daiki Asakawa, Edwin De Pauw
    • 学会等名
      64th ASMS Conference
    • 発表場所
      San Antonio, TX, USA
    • 年月日
      2016-06-05
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] プロトンを含まない亜鉛-ポリヒスチジン複合体の電子捕獲・電子移動解離過程2016

    • 著者名/発表者名
      浅川 大樹、De Pauw, Edwin
    • 学会等名
      日本質量分析学会総合討論会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)
    • 年月日
      2016-05-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 金属錯体添加を利用した電子移動解離タンデム質量分析法によるリン酸化ペプチドのアミノ酸配列解析2016

    • 著者名/発表者名
      浅川大樹、大坂一生
    • 学会等名
      新アミノ酸分析研究会第6回学術講演会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(東京都文京区)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 金属-ペプチド複合体を用いた電子移動解離質量分析法の本質解明に向けたアプローチ2015

    • 著者名/発表者名
      浅川大樹、山下明日香、和田芳直、竹内孝江
    • 学会等名
      第63回質量分析総合討論会
    • 発表場所
      茨城県つくば市
    • 年月日
      2015-06-15
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [産業財産権] 特許2016

    • 発明者名
      浅川大樹
    • 権利者名
      浅川大樹
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2016-174673
    • 出願年月日
      2016-09-07
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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