DNA損傷記憶のエピジェネティクス解析

• 研究課題/領域番号: 26550028
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 放射線・化学物質影響科学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 井倉 正枝 京都大学, 放射線生物研究センター, 研究員 (40535275)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: DNA損傷記憶 / ヒストン化学修飾 / クロマチン構造変換 / クロマチン免疫沈降

研究成果の概要

IL2-R/DRGFPカセットをU2OS細胞に安定に発現させ、I-SceIによるDNA二本鎖切断後にGFP Positive細胞をソーティングして回収した。クロマチン免疫沈降によってDNA損傷領域でのヒストンの化学修飾の状態を検討した。その結果、H2AXのリン酸化については、DNA損傷に伴い、損傷領域で増幅が確認され、その後DNA修復の完了とともに減弱していくことが明らかになった。DNA損傷領域のアセチル化を含めた他の化学修飾とDNA損傷前後でのクロマチン構造の変化は、同じくクロマチン免疫沈降法とMNaseの感受性を定量PCRの系で現在検討中である。

研究成果

• [雑誌論文] Coordinated regulation of TIP60 and PARP-1 in damaged chromatin dynamics. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ikura M
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol. 巻: Epub ahead of print 号: 10 ページ: 1595-1607
  • DOI: 10.1128/mcb.01085-15
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Disruption of DNA Damage-Response by Propyl Gallate and 9-Aminoacridine (2016)
  • 著者名/発表者名: Matsuda S
  • 雑誌名: Toxicol. Sci. 巻: 150 号: 2 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1093/toxsci/kfw039
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acetylation of Histone H2AX at Lys 5 by the TIP60 Histone Acetyltransferase Complex Is Essential for the Dynamic Binding of NBS1 to Damaged Chromatin. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ikura M
  • 雑誌名: Mol. cell. Biol. 巻: 35 号: 24 ページ: 4147-4157
  • DOI: 10.1128/mcb.00757-15
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear pyruvate kinase M2 complex serves as a transcriptional coactivator of arylhydrocarbon receptor. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shun Matsuda, Jun Adachi, Masaru Ihara, Nobuhiro Tanuma, Hiroshi Shima, Akira Kakizuka, Masae Ikura, Tsuyoshi Ikura, Tomonari Matsuda
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 44(2) 号: 2 ページ: 636-647
  • DOI: 10.1093/nar/gkv967
  • NAID: 120005818255
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] hCAS/CSE1L regulates RAD51 distribution and focus formation for homologous recombinational repair (2015)
  • 著者名/発表者名: 1.Okimoto S, Sun J, Fukuto A, Horikoshi Y, Matsuda S, Matsuda T, Ikura M, Ikura T, Machida S, Kurumizaka H, Miyamoto Y, Oka M, Yoneda Y, Kiuchi Y, Tashiro S.
  • 雑誌名: Genes Cells. 巻: 20 号: 9 ページ: 681-94
  • DOI: 10.1111/gtc.12262
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Absolute quantification of acetylation and phosphorylation of the histone variant H2AX upon ionizing radiation reveals distinct cellular responses in two cancer cell lines (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsuda S
  • 雑誌名: Radiat. Environ. Biophys. 巻: 54 号: 4 ページ: 403-411
  • DOI: 10.1007/s00411-015-0608-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-ordered chromatin containing histone H1. (2014)
  • 著者名/発表者名: Machida, S., Takaku, M., Ikura, M., Sun, J., Suzuki, H., Kobayashi, W., Kinomura, A., Osakabe, A., Tachiwana, H., Horikoshi, Y., Fukuto, A., Matsuda, R., Ura, K., Tashiro, S., Ikura, T., and Kurumizaka, H.
  • 雑誌名: Scientific Rep. 巻: 4 号: 1 ページ: 4863-4863
  • DOI: 10.1038/srep04863
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] DNA損傷応答における動的クロマチン平衡とその意義 (2015)
  • 著者名/発表者名: 井倉 毅
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] DNAチェックポイント因子Rad9の分解を促進するCdk-Plk1依存的機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 郡司未佳
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] ピルビン酸キナーゼとピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体によるアセチルCoAの治産池消モデル (2015)
  • 著者名/発表者名: 松田俊
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Histone H2AX dynamics coordinates DNA repair with chromatin reorganization (2015)
  • 著者名/発表者名: Masae Ikura
  • 学会等名: The 5th International Symposium of RIRBM, Hiroshima University
  • 発表場所: 広島市
  • 年月日: 2015-03-02 – 2015-03-03
• [学会発表] The coupling of epigenetic regulation with metabolism in cancer (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Ikura
  • 学会等名: The 30th RBC-NIRS International Symposium "Frontier Radiation Biology, Now and In the future"
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2015-02-20 – 2015-02-21
• [学会発表] The role of the pyruvate kinase M2 (PKM2) in the Arylhydrocarbon Receptor-mediated Transcription (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Ikura
  • 学会等名: 5th meeting of the Asian Forum for chromatin and chromosome Biology
  • 発表場所: Bungalow, India.
  • 年月日: 2015-01-13 – 2015-01-19
• [学会発表] The role of histone H2AX dynamics in DNA damage response (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi ikura
  • 学会等名: The 4D Nucleome 2014
  • 発表場所: 広島市
  • 年月日: 2014-12-17 – 2014-12-20
• [学会発表] Nap1 is required for the homologous recombination reaction in higher-order chromatin containing histone H1 (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Machida
  • 学会等名: The 4D Nucleome 2014
  • 発表場所: 広島市
  • 年月日: 2014-12-17 – 2014-12-20
• [学会発表] Nap1は高次クロマチンでの相同組換えを促進する (2014)
  • 著者名/発表者名: 町田晋一
  • 学会等名: 第32回 染色体ワークショップ
  • 発表場所: 広島市
  • 年月日: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [学会発表] Activation of the SUMO modification system is required for the accumulation of RAD51 at sites containing DNA damage (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Ikura
  • 学会等名: 第5回日米修復会議
  • 発表場所: 徳島県鳴門市
  • 年月日: 2014-10-28 – 2014-10-29
• [学会発表] DNA損傷応答におけるヒストンH2AX化学修飾の時空間的制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 井倉 毅
  • 学会等名: 第87回日本生化学大会
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-16
• [学会発表] Chromatin dynamics in DNA damage response (2014)
  • 著者名/発表者名: Masae Ikura
  • 学会等名: IIAS Research Conference 2014 Chromatin decoding
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2014-05-12 – 2014-05-14