酵素プローブを用いたRNA修飾部位網羅的探索の実践と応用

• 研究課題/領域番号: 26560442
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ケミカルバイオロジー
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鈴木 健夫 東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (90533125)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: RNA修飾 / 修飾酵素 / 特異的標識 / 網羅的探索 / RNA / 化学標識 / 化学修飾

研究成果の概要

RNA修飾酵素をプローブとし、RNA-修飾酵素の共有結合複合体の形成過程を利用したRNA修飾の網羅的探索法の構築を試みた。培地中の核酸アナログ分子を取り込んだHeLa細胞に対し、共有結合複合体を形成しうる修飾酵素を一過的に発現させたところ、アナログ分子の添加に依存して修飾酵素に結合したRNAが回収できることを見出した。また、RNAに酵素的前処理を行うことで特定の修飾構造の変換が促進されたという観察に基づき、新規のRNA修飾標識法の検討を進めた。

研究成果

• [雑誌論文] A single methylation of 23S rRNA triggers late steps of 50S ribosomal subunit assembly (2015)
  • 著者名/発表者名: Arai, T., Ishiguro, K., Kimura, S., Sakaguchi, Y., Suzuki, T. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 112 号: 34
  • DOI: 10.1073/pnas.1506749112
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cdk5rap1-mediated 2-methylthio modification of mitochondrial tRNAs governs protein translation and contributes to myopathy in mice and humans. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wei FY, Zhou B, Suzuki T, Miyata K, Ujihara Y, Horiguchi H, Takahashi N, Xie P, Michiue H, Fujimura A, Kaitsuka T, Matsui H, Koga Y, Mohri S, Suzuki T, Oike Y, Tomizawa K.
  • 雑誌名: Cell Metab 巻: 21 号: 3 ページ: 413-6
  • DOI: 10.1016/j.cmet.2015.01.019
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] RNAの修飾欠損と疾患 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉、浅野 奏、鈴木 健夫
  • 雑誌名: ファルマシア 巻: 51 ページ: 32-36
  • NAID: 130007447866
• [雑誌論文] Human NAT10 is an ATP-dependent RNA acetyltransferase responsible for N4-acetylcytidine formation in 18S rRNA (2014)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Ito, Sayuri Horikawa, Tateki Suzuki, Hiroki Kawauchi, Yoshikazu Tanaka, Takeo Suzuki, and Tsutomu Suzuki
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 289 号: 52 ページ: 35724-35730
  • DOI: 10.1074/jbc.c114.602698
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A single acetylation of 18S rRNA is essential for biogenesis of the small ribosomal subunit in Saccharomyces cerevisiae (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito, S., Akamatsu, Y., Noma, A., Kimura, S., Miyauchi, K., Ikeuchi, Y., Suzuki, T. and Suzuki, T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 289 号: 38 ページ: 26201-26212
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.593996
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 5-Hydroxymethylcytosine Plays a Critical Role in Glioblastomagenesis by Recruiting the CHTOP-Methylosome Complex (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Takai, Tetsu Akiyama et al.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 48-60
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.08.071
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A complete landscape of post-transcriptional modifications in mammalian mitochondrial tRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T. and Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: (in press) 号: 11 ページ: 7346-7357
  • DOI: 10.1093/nar/gku390
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] U snRNAにおけるN6-メチルアデノシン修飾の生合成と機能解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石神 宥真、大平 高之、穐近 慎一郎、鈴木 健夫、鈴木 勉
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド, 神戸市, 兵庫県
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Exploration and functional analysis of queuosine- glycosyltransferases in mammals (2015)
  • 著者名/発表者名: Xuewei Zhao, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第17回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌, 札幌市, 北海道
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] Deficiency of tRNA modification causes the development of X-linked mental retardation (2015)
  • 著者名/発表者名: Fan-Yan Wei, Yu Nagayoshi, Shoji Hirata, Takeo Suzuki, Tsutomu Suzuki, Kazuhito Tomizawa
  • 学会等名: 第17回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌, 札幌市, 北海道
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] Biogenesis of 5-taurinomethyluridine in human mitochondrial tRNAs; implication for molecular pathogenesis of mitochondrial diseases (2015)
  • 著者名/発表者名: Kana Asano, Takeo Suzuki, Fan-Yan Wei, Yoshiho Ikeuchi, Yuka Yashiro, Christin Tischner, Annette Hofer, Yoshihito Kishita, Yasushi Okazaki, Tina Wenz, Kazuhito Tomizawa, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第17回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌, 札幌市, 北海道
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] ミトコンドリアtRNAタウリン修飾の生合成と機能 (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 健夫、浅野 奏、魏 范研、富澤 一仁、池内 与志穂、鈴木 勉
  • 学会等名: 第14回日本ミトコンドリア学会年会
  • 発表場所: 九大医 百年講堂、福岡市、福岡県
  • 年月日: 2014-12-03 – 2014-12-05
• [学会発表] 哺乳類ミトコンドリアにおけるtRNA48位の5-メチルシチジン修飾酵素の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中野 紗緒里、鈴木 健夫、荒木 喜美、荒木 正健、鈴木 勉
  • 学会等名: 第14回日本ミトコンドリア学会年会
  • 発表場所: 九大医 百年講堂、福岡市、福岡県
  • 年月日: 2014-12-03 – 2014-12-05
• [学会発表] A complete landscape of post-transcriptional modifications in mammalian mitochondrial tRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T. and Suzuki, T.
  • 学会等名: The 25th tRNA conference
  • 発表場所: Kyllini, Greece
  • 年月日: 2014-09-21 – 2014-09-25
• [学会発表] Mitochondrial disease as the first instance of RNA modopathy (2014)
  • 著者名/発表者名: Takeo Suzuki, Kana Asano, Fan-Yan Wei, Kazuhito Tomizawa, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち、名古屋市、愛知県
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of the functional role of FTSJ1 related to non-syndromic X-linked intellectual disability (2014)
  • 著者名/発表者名: Shoji Hirata, Takeshi Chujo, Takeo Suzuki, Kenjyo Miyauchi, Yuichi Goto, Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: ウインクあいち、名古屋市、愛知県
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-25