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周辺環境を記憶するDNA分子システムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 26620131
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
研究機関北陸先端科学技術大学院大学

研究代表者

藤本 健造  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (90293894)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード光クロスリンク / DNA操作 / DNA鎖交換 / 光架橋 / DNA鎖置換反応
研究成果の概要

DNA分子のプログラミング能に着目し、これまでDNA分子自体に基本演算素子(AND, OR, NOT 等)が実装できることが報告されている。本研究では新規光架橋素子の合成とDNA鎖交換速度の定量評価を行うことで類似配列でありながら光架橋性人工塩基(cnvK, cnvD, cnvG)と対象シトシンの相補塩基(グアニン、イノシン、アミノプリン)を組み合わせることで固有の反応係数を有するDNA鎖交換システムが構築できることを見出した。周辺環境として照射されたエネルギーを反映したDNA鎖交換反応解析系の構築に成功した。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Critical Effect of Base Pairing of Target Pyrimidine on the Inter-strand Photo-cross-linking of DNA via 3-Cyanovinylcarbazole Nucleoside2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Minako Ooe, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 26 号: 8 ページ: 1475-1478

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.5b00352

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Photo-cross-linking using trifluorothymidine and 3-cyanovinylcarbazole induced large shifted 19F MR signal2015

    • 著者名/発表者名
      Shigetaka Nakamura, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 51 号: 59 ページ: 11765-11768

    • DOI

      10.1039/c5cc02972d

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A versatile puromycin-linker using cnvK for high-throughput in vitro selection by cDNA display2015

    • 著者名/発表者名
      Yuki Mochizuki, Takeru Suzuki, Kenzo Fujimoto, Naoto Nemoto
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology

      巻: 212 ページ: 174-180

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2015.08.020

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] DNA Photo-cross-linking using 3-Cyanovinylcarbazole Modified Oligonucleotide with Threoninol Linker2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto; Yuya Tanaka; Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Organic Letters

      巻: 17 号: 4 ページ: 936-939

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.5b00035

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Fluorine-modified bisbenzimide derivative as a molecular probe for bimodal and simultaneous detection of DNAs by 19F NMR and fluorescence2015

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 51 号: 42 ページ: 8749-8752

    • DOI

      10.1039/c5cc01995h

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] New insight of Engineering Expression System based on ultrafast DNA and RNA photo-cross-linking2015

    • 著者名/発表者名
      Shigetaka Nakamura, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      PEGS Europe 2015
    • 発表場所
      Lisbon, Portugal
    • 年月日
      2015-11-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Development about 19F chemical shift imaging of DNA conformation change2015

    • 著者名/発表者名
      Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      World Molecular Imaging Congress (WMIC2015)
    • 発表場所
      Hawaii, U.S.A
    • 年月日
      2015-09-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Photochemical regulation of DNA strand exchange using DNA photocrosslinking2014

    • 著者名/発表者名
      Shigetaka Nakamura, Hirokazu Hashimoto, Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA20)
    • 発表場所
      Kyoto Univ., Kyoto, Japan
    • 年月日
      2014-09-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Creation of DNA array structure equipped with heat resistance by ultrafast photocrosslinking using 3-cyanovintlcarbazole2014

    • 著者名/発表者名
      Kenzo Fujimoto
    • 学会等名
      XXVth IUPAC on photochemistry
    • 発表場所
      Bordeaux, France
    • 年月日
      2014-07-15
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [図書] Mofified Nucleic Acids2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sakamoto; Kenzo Fujimoto
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [産業財産権] 光架橋核酸二重鎖の光架橋を光開裂させる方法2014

    • 発明者名
      藤本健造、中村重孝
    • 権利者名
      国立大学法人 北陸先端科学技術大学院大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2014-224574
    • 出願年月日
      2014-11-04
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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