| 研究課題/領域番号 |
26630052
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
流体工学
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
新宅 博文 京都大学, 工学研究科, 助教 (80448050)
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| 研究分担者 |
小寺 秀俊 京都大学, 工学研究科, 教授 (20252471)
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| 研究協力者 |
Santiago Juan G. Stanford University, 教授
錦井 秀和 Stanford University, Visiting Scholar
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
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| 配分額 *注記 |
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
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| キーワード | マイクロ流路 / 電気泳動 / 一細胞 / RNA / DNA / シークエンシング / 電気穿孔 / 前処理 / マイクロ流体 / 動電現象 / 等速電気泳動法 / タンパク / PCR |
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| 研究成果の概要 |
本研究では，マイクロ流路内における細胞の電気穿孔法および動電現象を利導した単一細胞のRNAおよびDNAの同時抽出・解析技術を開発した．開発したマイクロ流体システムは，細胞膜の溶解を200 ms，抽出および分離を約1 分程度で完了し，高品質のRNAおよびDNA分子を出力できることを示した．構築したマイクロ流体システムをcytoplasmic RNAおよびnuclear RNAの並列次世代シークエンシング解析を実施し，それらの網羅解析が可能であることを示した．また，両者の対比からそれぞれの分画で変動している発現遺伝子や，イントロンの保持型に顕著な差異があることが明らかになった．
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