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構造ロバスト性解析に基づく生体分子回路のボトムアップ設計論の構築

研究課題

研究課題/領域番号 26630195
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 制御・システム工学
研究機関東京工業大学

研究代表者

井村 順一  東京工業大学, 情報理工学(系)研究科, 教授 (50252474)

研究分担者 井上 正樹  慶應義塾大学, 理工学部, 助教 (80725680)
連携研究者 合原 一幸  東京大学, 生産技術研究所, 教授 (40167218)
鈴木 雅康  宇都宮大学, 工学部, 助教 (10456692)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード生体分子回路 / 分岐解析 / 合成生物学 / ロバスト性解析
研究成果の概要

所望の機能をもつ大規模生体分子回路のボトムアップ設計論を目指して,二つの研究課題に取り組み成果を得た.1)生体分子回路同士の接続を想定し,ロバスト性能を定量的に見積もる数値計算法を開発した.特に,細胞の運命決定を表現するスイッチ回路の設計論に計算法を利用した.2)動的システムをネットワーク接続したとき,接続前よりもロバスト性が強化される現象を発見し,現象の解析とシステムのクラスの一般化に取り組んだ.細胞の分化を表現する生体分子回路を対象として,ボトムアップ接続により機能のロバスト性が強化されていくことを,理論と数値実験の両方において確認した.

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] A computational method for robust bifurcation analysis and its application to biomolecular systems2015

    • 著者名/発表者名
      Masaki Inoue, Hikaru Ikuta, Shuichi Adachi, Jun-ichi Imura, and Kazuyuki Aihara
    • 雑誌名

      International Journal of Bifurcation and Chaos

      巻: 25-7 号: 07 ページ: 1540012-1540012

    • DOI

      10.1142/s021812741540012x

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Robust bifurcation analysis for a genetic controller design problem to cell fate control2015

    • 著者名/発表者名
      Hikaru Ikuta, Masaki Inoue, and Shuichi Adachi
    • 学会等名
      4th IFAC Conference on Analysis and Control of Chaotic Systems (CHAOS)
    • 発表場所
      首都大学東京(東京都)
    • 年月日
      2015-08-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nonlinear dynamical systems enlarges the domain of attraction with their interconnection2015

    • 著者名/発表者名
      Le T. D. Hang, Masaki Inoue, and Jun-ichi Imura
    • 学会等名
      Proc. 59th Annual Conference of the Institute of Systems, Control and Information Engineerings (ISCIE)
    • 発表場所
      中央電気倶楽部(大阪府)
    • 年月日
      2015-05-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Domain of attraction enlarged with interconnection of dynamical systems2015

    • 著者名/発表者名
      Masaki Inoue, Shuichi Adachi
    • 学会等名
      SICE International Symposium on Control Systems 2015
    • 発表場所
      東京電機大学(東京)
    • 年月日
      2015-03-04 – 2015-03-07
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Robustness analysis of genetic circuits constructed by bottom-up strategy2014

    • 著者名/発表者名
      Masaki Inoue, Takayuki Arai, Jun-ichi Imura, Kenji Kashima, Kazuyuki Aihara
    • 学会等名
      19th IFAC World Congress
    • 発表場所
      Cape Town International Convention Centre (Cape Town, South Africa)
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Instability of interconnected positive real systems2014

    • 著者名/発表者名
      Masaki Inoue, Jun-ichi Imura, Takayuki Ishizaki
    • 学会等名
      21th International Symposium on Mathematical Theory of Networks and Systems
    • 発表場所
      University of Groningen (Groningen, The Netherlands)
    • 年月日
      2014-07-07 – 2014-07-11
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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