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シントロフィーを促進するサポーター微生物の存在とその新規微生物間相互作用の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26630250
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 土木環境システム
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

成廣 隆  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 主任研究員 (20421844)

連携研究者 玉木 秀幸  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 主任研究員 (00421842)
鎌形 洋一  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究部門付 (70356814)
研究協力者 LIU Wen-Tso  イリノイ大学, 教授
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
キーワード微生物ゲノム / 嫌気共生細菌 / メタン生成菌 / シントロフィー / 環境動態 / メタン生成アーキア / 微生物 / 廃水処理 / 微生物生態
研究成果の概要

本研究では、嫌気性共生細菌(シントロフ)とメタン生成菌の2者による微生物間相互作用である「シントロフィー」による有機物分解を促進する代謝機能を特定することを目的とし、その担い手であるシントロフとメタン生成菌や、それらが生息している環境の微生物群の代謝機能をゲノム情報から解き明かすことを試みた。長期間にわたり経代培養した集積シントロフィー培養系の微生物群集構造解析やシントロフの比較ゲノム解析から、有機酸の分解等に関与する代謝経路と、その反応を支えるエネルギー保存に関与する酵素遺伝子を特定し、これらの代謝機能がシントロフィーによる有機物分解の安定化に寄与していることが示唆された。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 4件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] イリノイ大学(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] イリノイ大学(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Genomics and Metagenomics in Microbial Ecology: Recent Advances and Challenges2017

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Kamagata Y
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 32 号: 1 ページ: 1-4

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME3201rh

    • NAID

      130005519598

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparative Genomics of Syntrophic Branched-Chain Fatty Acid Degrading Bacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Sekiguchi Y, Liu WT
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 31 号: 3 ページ: 288-292

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME16057

    • NAID

      130005265098

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Draft Genome Sequences of Methanoculleus horonobensis Strain JCM 15517, Methanoculleus thermophilus Strain DSM 2373, and Methanofollis ethanolicus Strain JCM 15103, Hydrogenotrophic Methanogens Belonging to the Family Methanomicrobiaceae.2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Kusada H, Yoneda Y, Tamaki H.
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.00199-16

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Draft Genome Sequence of Syntrophomonas wolfei subsp. methylbutyratica Strain 4J5T (JCM 14075), a Mesophilic Butyrate- and 2-Methylbutyrate-Degrading Syntroph.2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Liu WT.
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 4 号: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.00047-16

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The nexus of syntrophy-associated microbiota in anaerobic digestion revealed by long-term enrichment and community survey2015

    • 著者名/発表者名
      Narihiro, T., M.K. Nobu, N-K. Kim, Y. Kamagata, and W-T. Liu
    • 雑誌名

      Environmental Microbiology

      巻: 17 号: 5 ページ: 1707-1720

    • DOI

      10.1111/1462-2920.12616

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Comparative genomics of branched-chain fatty acid degrading syntrophs reveals multiple genes involved in β-oxidation and energy conservation system2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Sekiguchi Y, Liu WT
    • 学会等名
      16th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      モントリオール国際会議場, モントリオール, カナダ
    • 年月日
      2016-08-21
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Genome analysis of branched chain fatty acid degrading syntrophs: “Syntrophomonas wolfei subsp. methylbutyratica” strain JCM 14075T and Syntrophothermus lipocalidus strain TGB-C1T.2015

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Liu WT.
    • 学会等名
      日本微生物生態学会
    • 発表場所
      亀城プラザ(土浦市)
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] エコゲノミクスによる嫌気性廃水処理プロセスに生息する未培養微生物群の機能解明2015

    • 著者名/発表者名
      成廣 隆, Masaru K. Nobu, 鎌形洋一, Wen-Tso Liu
    • 学会等名
      第14回 LS-BT合同研究発表会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所つくばセンター
    • 年月日
      2015-02-03 – 2015-02-04
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of microbial communities in syntrophy-associated enrichments and anaerobic wastewater treatment processes2014

    • 著者名/発表者名
      Takashi Narihiro, Masaru K. Nobu, Nakyung Kim, Yoichi Kamagata, and Wen-Tso Liu
    • 学会等名
      15th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 年月日
      2014-08-04 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [図書] Anaerobic Cultivation (In Yates M, Nakatsu C, Miller R, Pillai S (ed), Manual of Environmental Microbiology, Fourth Edition)2015

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Kamagata Y
    • 総ページ数
      12
    • 出版者
      ASM Press, Washington, DC.
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2022-02-16  

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