RNAスプライシング分子異常における標的分子の探索

• 研究課題/領域番号: 26640075
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 腫瘍生物学
• 研究機関: 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター) (2015); 京都大学 (2014)
• 研究代表者: 真田 昌 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, その他 (20529044)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 骨髄異形成症候群 / MDS / RNAスプライシング / RNAシーケンス

研究成果の概要

RNAスプライシング関連遺伝子変異は、骨髄異形成症候群（MDS）の分子病態に関わると推測されるが、病型により変異遺伝子に特異性があり、病型を規定していると考えられる。MDS患者由来の造血細胞を用いてRNAシーケンスによるスプライシング異常の標的分子の探索を行った。SF3B1変異例においては、3’側のスプライシングサイトが5’側にずれる特徴的な変化が様々な遺伝子に観察され、遺伝性環状鉄芽球性貧血の原因遺伝子が含まれていた。一方、SRSF2変異例においては、通常観察されないエクソンを含む転写産物が検出され、変異例で観察される遺伝子特異的な変化が表現型の形成に関与すると推測された。

研究成果

• [雑誌論文] Aberrant splicing of U12-type introns is the hallmark of ZRSR2 mutant myelodysplastic syndrome. (2015)
  • 著者名/発表者名: Madan V, Kanojia D, Li J, Okamoto R, Sato-Otsubo A, Kohlmann A, Sanada M, Grossmann V, Sundaresan J, Shiraishi Y, Satoru M, Thol F, Ganser A, Yang H, Haferlach T, Ogawa S, Koeffler HP
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: ６ 号: 1 ページ: 6042-6042
  • DOI: 10.1038/ncomms7042
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Recurrent somatic mutations underlie corticotropin-independent Cushing's syndrome. (2014)
  • 著者名/発表者名: 7.Sato Y, Maekawa S, Ishii R, Sanada M, Morikawa T, Shiraishi Y, Yoshida K, Nagata Y, Sato-Otsubo A, Yoshizato T, Suzuki H, Shiozawa Y, Kataoka K, Kon A, Aoki K, Chiba K, Tanaka H, Kume H, Miyano S, Fukayama M, Nureki O, Homma Y, Ogawa S.
  • 雑誌名: Science 巻: ３４４ 号: 6186 ページ: 917-920
  • DOI: 10.1126/science.1252328
  • 査読あり
• [雑誌論文] Haploinsufficiency of Sf3b1 leads to compromised stem cell function but not to myelodysplasia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsunawa M, Yoshida K
  • 雑誌名: Leukemia 巻: (Epub ahead of print) 号: 9 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1038/leu.2014.73
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] クローン解析に基づく造血器腫瘍の病態理解 (2015)
  • 著者名/発表者名: 真田 昌
  • 学会等名: 日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2015-10-09
  • 招待講演
• [学会発表] Comprehensive Analysis of Alternative RNA Splicing in Myelodysplastic Syndrome (2014)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Shiozawa, Sato Sato-Otsubo, Anna Gallì, Kenichi Yoshida, Tetsuichi Yoshizato, Yusuke Sato, Keisuke Kataoka,Masashi Sanada,Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Satoru Miyano, Luca Malcovati, Mario Cazzola, and Seishi Ogawa
  • 学会等名: 55th American Society of Hematology 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: San Francisco, USA
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-09
• [学会発表] ZRSR2 Mutations Cause Dysregulated RNA Splicing in MDS (2014)
  • 著者名/発表者名: Vikas Madan, Deepika Kanojia, Li Jia, Ryoko Okamoto, Aiko Sato-Otsubo, Alexander Kohlmann, Masashi Sanada, Vera Grossmann, Janani Sundaresan, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Felicitas Thol, Arnold Ganser, Henry Yang, Torsten Haferlach, Seishi Ogawa, and H. Phillip Koeffler
  • 学会等名: 55th American Society of Hematology 2014 Annual Meeting
  • 発表場所: San Francisco, USA
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-09
• [学会発表] SF3B1 PLAYS AN IMPORTANT ROLE IN THE REGULATION OF HEMATOPOIETIC STEMS CELLS, BUT HAPLOINSUFFICIENCY OF SF3B1 MAY NOT BE SOLELY RESPONSIBLE FOR MYELODYSPLASIA (2014)
  • 著者名/発表者名: Manabu Matsunawa, Ryo Yamamoto, Masashi Sanada, Ayana Kon, Aiko Sato-Otsubo, Yusuke Shiozawa, Kenichi Yoshida, Yasunobu Nagata, Tetsuichi Yoshizato, Makoto Otsu, Kyoichi Isono, Haruhiko Koseki, Hiromitsu Nakauchi, Seishi Ogawa
  • 学会等名: The 19th Congress of European Hematology Association
  • 発表場所: Milan, Italy
  • 年月日: 2014-06-12 – 2014-06-15
• [図書] 医学のあゆみVol.249 No.10特集 がんゲノム研究の進歩ー網羅的解析からの知見 医歯薬出版 「造血器腫瘍におけるゲノム解析と臨床への展開」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 眞田 昌
  • 総ページ数: 129
  • 出版者: 医歯薬出版