| 研究課題/領域番号 |
26640092
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
腫瘍診断学
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| 研究機関 | 熊本大学 |
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研究代表者 |
大槻 純男 熊本大学, 生命科学研究部, 教授 (60323036)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
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| キーワード | プロテオミクス / 質量分析 / 溶出時間 / データベース / プロテオーミクス |
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| 研究成果の概要 |
本研究は、溶出時間の高精度な補正技術によるペプチド情報のデータベース化とシグナルとノイズの効率的な分離によって高深度定量プロテオミクス技術を開発することを目的とする。溶出時間補正およびシグナル・ノイズ分離のアルゴリズムを開発し、ヒト肝臓ミクロソームのトリプシン消化産物を用いて検証した。その結果、既存法と比較して開発法は精度よく偽陽性を除去し、濃度のタンパク質由来ペプチドを同定し比較できることが明らかとなった。また、異なる2施設間での補正精度を解析した結果、補正精度が低下するが、解析可能であることが明らかとなった。解析技術を用いて臨床検体を解析しネットワーク解析やバイオマーカー探索に応用した。
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