高深度シーケンシングによる百十歳以上長寿者のミトコンドリアDNA体細胞変異率決定

• 研究課題/領域番号: 26640126
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500)
• 研究協力者: 広瀬 信義 ; 新井 康通 ; Casingal Cristine R.
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2014年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
• キーワード: 超長寿者 / ミトコンドリア変異 / 次世代シーケンサー / ヒトゲノム配列再解析

研究成果の概要

超長寿者は遺伝要因、生活習慣などの要因で長寿となっていると考えられる。これまでさまざまな研究がなされてきたものの、超長寿の要因は未だ不明といっていい。老化メカニズムについて多数の仮説が提唱されており、その一つが『ミトコンドリア異常説』である。ミトコンドリアは細胞小器官でありエネルギー産生を司り、同時に細胞毒性を持つスーパーオキサイドも産生することが知られている。すなわち老化との関連が示唆され、長寿ではレシスタンスの存在が示唆される。
本研究ではミトコンドリアDNA配列決定により超長寿者に特徴的な遺伝子多型の検出を試みた。結論としては、超長寿者に特徴的な遺伝子変異は検出できていない。

研究成果

• [雑誌論文] Allelic Imbalance in Regulation of ANRIL through Chromatin Interaction at 9p21 Endometriosis Risk Locus. (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakaoka H, Gurumurthy A, Hayano T, Ahmadloo S, Omer WH, Yoshihara K, Yamamoto A, Kurose K, Enomoto T, Akira S, Hosomichi K,, Inoue I.
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 1 号: 4 ページ: 1-23
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005893
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel kinase fusion transcripts found in endometrial cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tamura R, Yoshihara K, Yamawaki K, Suda K, Ishiguro T, Adachi S, Okuda S, Inoue I, Verhaak RG, Enomoto T.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 5 号: 1 ページ: 18657-18657
  • DOI: 10.1038/srep18657
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of novel exonic mobile element insertions in epithelial ovarian cancers. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hayano,T., Yamada,S., Hosomichi,K., Nakaoka,H., Yoshihara,K., Adachi.S. Kashima,K., Tanaka, K and Enomoto,T.& Inoue,I.
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 号: 1 ページ: 15030-15030
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.30
  • 査読あり
• [雑誌論文] The impact of next-generation sequencing technologies on HLA research. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hosomichi K, Shiina T, Tajima A, Inoue I.
  • 雑誌名: Journal of human genetics 巻: 60 号: 11 ページ: 665-673
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.102
  • NAID: 40020655134
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Distribution of HLA haplotypes across Japanese Archipelago: similarity, difference and admixture. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakaoka H, Inoue I.
  • 雑誌名: Journal of human genetics 巻: 60 号: 11 ページ: 683-690
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.90
  • NAID: 40020655147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unique characteristics of the Ainu population in Northern Japan (2015)
  • 著者名/発表者名: Jinam TA, Kanzawa-Kiriyama H, Inoue I, Tokunaga K, Omoto K, Saitou N
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 60 号: 10 ページ: 565-571
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.79
  • NAID: 40020621361
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Aggregation of rare/low-frequency variants of the mitochondria respiratory chain-related proteins in rheumatoid arthritis patients. (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, Hosomichi K, Okudaira Y, Nakaoka H, Suzuki Y, Kuwana M, Sato S, Kaneko Y, Homma Y, Oka A, Shiina T, Inoko H, Inoue I.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 60 号: 8 ページ: 449-454
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.50
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] RNA sequencing reveals stress responses of iPSC-derived endothelial cells isolated from peripheral blood mononuclear cells of supercentenarians (2016)
  • 著者名/発表者名: Cristine R. Casingal
  • 学会等名: The 13th International Congress of Human Genetics
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2016-04-07
  • 国際学会