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大腸菌の進化実験を用いた生体リズム現象の創出

研究課題

研究課題/領域番号 26640135
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

古澤 力  国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, チームリーダー (00372631)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード変動環境 / 進化実験 / 大腸菌 / 生体リズム現象
研究成果の概要

本研究では、周期的に時間変動する環境下で大腸菌の進化実験を行い、どのような表現型と遺伝子型の変化が出現するかを解析することを目的とした。周期的に変動する炭素源や抗生物質添加といった環境下で大腸菌を植え継ぎ培養することにより、変動環境に適応した大腸菌の取得を試みた。結果として、2つの抗生物質の添加を周期的に切り替えた場合に、一方の薬剤には耐性を獲得し、もう一方への耐性獲得は抑制されるという非対称な進化ダイナミクスが見出された。このことは、環境が時間的に変動することにより、進化ダイナミクスの軌跡に複雑なバイアスがかかる場合があることを示している。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 2件、 招待講演 18件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Phenotypic convergence in bacterial adaptive evolution to ethanol stress2015

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shizmiu, Chikara Furusawa
    • 雑誌名

      BMC Evo. Biol.

      巻: 15 号: 1 ページ: 180-180

    • DOI

      10.1186/s12862-015-0454-6

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 生物システムの安定性と可塑性: 理論と実験からのアプローチ2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第34回 BMIRC研究会
    • 発表場所
      九州工業大学 飯塚キャンパス・飯塚市・福岡県
    • 年月日
      2015-12-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌進化実験と 細胞シミュレーションを用いた 適応進化ダイナミクスの解析2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場・神戸市・兵庫県
    • 年月日
      2015-12-02
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Toward Understanding of Adaptive Evolution:Computational Analysis and Experimental Evolution2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      平成27年度生命システム理論研究会
    • 発表場所
      東京医科歯科大学・文京区・東京都
    • 年月日
      2015-11-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生物システムの安定性と可塑性: 大腸菌進化実験によるアプローチ2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      山田研究会「生物と非生物をつなぐ」
    • 発表場所
      ラフォーレ修善寺・伊豆市・静岡県
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌の進化実験を用いた進化ダイナミクスの解析とその応用2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第67回日本生物工学大会
    • 発表場所
      城山観光ホテル・鹿児島市・鹿児島県
    • 年月日
      2015-10-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大自由度ダイナミクスから”生きている状態”の記述へ2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス・金沢市・石川県
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Toward Understanding of Adaptive Evolution: Computational Analysis and Experimental Evolution2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      QBiC Symposium: High-dimensional data for the design principles of life
    • 発表場所
      理化学研究所 生命システム研究センター・吹田市・大阪府
    • 年月日
      2015-08-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 適応進化ダイナミクスの解明:微生物実験と理論解析2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      東大理学部物理学科 懇話会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス・文京区・東京都
    • 年月日
      2015-07-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム解析の先に見えるもの:大腸菌進化実験の表現型・遺伝子型解析2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第4回NGS現場の会
    • 発表場所
      筑波国際会議場・つくば市・茨城県
    • 年月日
      2015-07-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 進化ダイナミクスの構成的理解~大腸菌進化実験から何が見えるか?~2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第8回Evo-devo青年の会
    • 発表場所
      名古屋大学理学南館・名古屋市・愛知県
    • 年月日
      2015-06-27
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 大腸菌進化過程の表現型・遺伝子型解析:抗生物質耐性菌の出現抑制へ向けて2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      アジレントゲノミクスフォーラム
    • 発表場所
      浅草橋ヒューリックホール・台東区・東京都
    • 年月日
      2015-06-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Phenotypic Convergence in Experimental Evolution of Antibiotic Resistant Bacteria2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      2nd Symposium on Complex Biodynamics&Networks
    • 発表場所
      鶴岡市先端研究産業支援センターレクチャーホール・鶴岡市・山形県
    • 年月日
      2015-05-11
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ゲノム解析の先に何が見えるか?~大腸菌進化実験の表現型・遺伝子型解析~2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      1030回生物科学セミナー(東京大学理学部生物学科)
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス・文京区・東京都
    • 年月日
      2015-05-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Theoretical/experimental analysis of robustness and plasticity in biological systems2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第56回植物生理学会年会シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 進化実験から見えてきたもの:微生物の適応進化過程の理解とその応用2014

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      合成生物学シンポジウム
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2014-11-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Creating stress tolerant bacterial cells by experimental evolution2014

    • 著者名/発表者名
      Chikara Furusawa
    • 学会等名
      5th Asian Symposium on Innovative Bio-production and Biorefinery
    • 発表場所
      Tainan
    • 年月日
      2014-11-09 – 2014-11-11
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 抗生物質を添加した環境での大腸菌進化実験2014

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第87回生化学会大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-16
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 代謝デザインへ向けたシステムバイオロジー2014

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 学会等名
      第105回醗酵学懇話会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2014-08-19
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] 「進化の謎をゲノムで解く」(長谷部光泰監修)2015

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 出版者
      学研メディカル秀潤社
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 生体の科学2014

    • 著者名/発表者名
      古澤力
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      医学書院
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [図書] 細胞工学2014

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明、古澤力
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      学研メディカル秀潤社
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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