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GFPラベルを用いた位置同定単粒子像解析法(GPS法)の開発

研究課題

研究課題/領域番号 26650021
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

加藤 貴之  大阪大学, 生命機能研究科, 助教 (20423155)

連携研究者 宮田 知子  大阪大学, 生命機能研究科, 特任助教 (30423156)
寺原 直矢  大阪大学, 生命機能研究科, 特任助教 (40554738)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード低温電子顕微鏡 / 単粒子解析 / 構造解析 / GFPラベル / 単粒子像解析法 / べん毛モータ / べん毛基部体
研究成果の概要

本実験では低温電子顕微鏡解析された低分解能の超分子複合体の構造から、構成分子の位置と方向を正しく同定することを目的とし、GFPのN、C末端の位置を変えたcpGFPをラベルとして用いる方法の開発を試みた。
今回べん毛回転子構成分子FliMを標的分子として、既知のFliMの部分構造を基に、cpGFPを導入する位置を12か所選定した。cpGFPラベル化FliMの発現、機能保持の有無等をウェスタンブロッティング、位相差及び蛍光顕微鏡によって確認したところ、2つの有力な候補を見出した。その蛋白質を精製したところ、ラベル化FliMが回転子から解離しており、ラベル位置の選定が非常に重要なことが明らかになった。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Three-dimensional reconstruction from electron microscopy images combined with cysteine-mediated crosslinking provide a model of T3SS needle tip complex.2015

    • 著者名/発表者名
      Cheung, M.
    • 雑誌名

      Mol. Microbiol.

      巻: 95 号: 1 ページ: 31-50

    • DOI

      10.1111/mmi.12843

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡を用いた生体超分子複合体の立体構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      加藤 貴之
    • 学会等名
      第11回「異分野キャリアを持つ医療系生命科学研究者育成支援」事業セミナー
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • 年月日
      2016-03-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] MotA複合体の電子顕微鏡による立体構造解析2016

    • 著者名/発表者名
      加藤 貴之、寺原 直矢、難波 啓一
    • 学会等名
      2015年度べん毛研究交流会
    • 発表場所
      滝の湯(山形県天童市)
    • 年月日
      2016-03-06
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 低温電子線トモグラフィーにおける電子線直接検知型カメラの効果2015

    • 著者名/発表者名
      川本 晃大, 森本 雄祐, 加藤 貴之, 難波 啓一
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] CryoEM 3D image reconstruction of the flagellar LP ring complex.2015

    • 著者名/発表者名
      Tatli, M., Miyata, T., Kato, T., Namba, K
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 単粒子解析のための分子同定用GFPラベル2015

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Terahara, N., Miyata, T., Namba, K.
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会, 金沢大学(石川県)
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-14
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] High resolution structural analysis of the flagellar hook of Salmonella.2015

    • 著者名/発表者名
      Horvath, P., Miyata, T., Takazaki, H., Kato, T., Namba, K
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 走化性シグナルCheY-Pを結合したべん毛基部体スイッチ複合体の構造2015

    • 著者名/発表者名
      Miyata, T., Kato, T., Morimoto, Y.V., Matsunami, H., Namba, K.
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] “手ぶれ補正”機能による高分解能構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      加藤 貴之、難波 啓一
    • 学会等名
      日本顕微鏡学会第71回学術講演会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2015-05-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] GFP labeling for single particle analysis with cryoEM.2015

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Terahara N., Miyata, T., Namba, K.
    • 学会等名
      HFSP Japan Meeting
    • 発表場所
      ルスツリゾート
    • 年月日
      2015-02-23 – 2015-02-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] GFP labeling for single particle analysis with cryoEM.2014

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Terahara N., Miyata, T., Namba, K.
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] The survival strategy in bacteria under the starvation stress.2014

    • 著者名/発表者名
      Kato, T., Miyata T., Ueta, M., Wada C, Kato T, Wada A., Namba K.
    • 学会等名
      2014 International Biophysics Congress
    • 発表場所
      Brisbane Convention & Exhibition Centre, Brisbane, Australia
    • 年月日
      2014-08-04 – 2014-08-06
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 難波研究室業績一覧

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/result/

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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