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enChIP法を用いたミトコンドリアDNAの高次構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 26650059
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 細胞生物学
研究機関大阪大学

研究代表者

藤井 穂高  大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (30302665)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
キーワードミトコンドリア / 遺伝子座特異的クロマチン免疫沈降法 / クロマチン / enChIP / ミトコンドリアDNA / TAL / CRISPR
研究成果の概要

本研究では、申請者が開発したengineered DNA-binding molecule-mediated chromatin immunoprecipitation (enChIP) 法を用いて、分子間相互作用を保ったままmtDNAの転写調節領域を単離し、そこに結合している分子(蛋白質・RNA等)を網羅的に同定して、それらの分子がmtDNAからの遺伝子発現等の機能発現に果たす役割を解析することを計画した。こうした解析によって、mtDNAのクロマチン構造や転写制御機構の詳細を解明することを狙った。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 5件、 謝辞記載あり 5件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Biochemical Analysis of Genome Functions Using Locus-Specific Chromatin Immunoprecipitation Technologies.2016

    • 著者名/発表者名
      Fujita T, Fujii H.
    • 雑誌名

      Gene Regul Syst Bio

      巻: 10 ページ: 1-9

    • DOI

      10.4137/grsb.s32520

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Efficient sequence-specific isolation of DNA fragments and chromatin by in vitro enChIP technology using recombinant CRISPR ribonucleoproteins.2016

    • 著者名/発表者名
      Fujita T, Yuno M, Fujii H.
    • 雑誌名

      Genes Cells

      巻: 21 号: 4 ページ: 370-377

    • DOI

      10.1111/gtc.12341

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Isolation of Specific Genomic Regions and Identification of Associated Molecules by enChIP.2016

    • 著者名/発表者名
      Fujita T, Fujii H.
    • 雑誌名

      J Vis Exp

      巻: 107 号: 107

    • DOI

      10.3791/53478

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Isolation of Specific Genomic Regions and Identification of Their Associated Molecules by Engineered DNA-Binding Molecule-Mediated Chromatin Immunoprecipitation (enChIP) Using the CRISPR System and TAL Proteins.2015

    • 著者名/発表者名
      Fujita T, Fujii H.
    • 雑誌名

      Int J Mol Sci

      巻: 16 号: 9 ページ: 21802-21812

    • DOI

      10.3390/ijms160921802

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Applications of Engineered DNA-Binding Molecules Such as TAL Proteins and the CRISPR/Cas System in Biology Research.2015

    • 著者名/発表者名
      Fujita T, Fujii H.
    • 雑誌名

      Int J Mol Sci

      巻: 16 号: 10 ページ: 23143-23164

    • DOI

      10.3390/ijms161023143

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [備考] 藤井研究室ホームページ

    • URL

      http://www.biken.osaka-u.ac.jp/lab/microimm/fujii/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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