新規モデル脊索動物としてのオタマボヤを用いた順遺伝学的スクリーニング法の開発

• 研究課題/領域番号: 26650079
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 発生生物学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 西田 宏記 大阪大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60192689)
• 研究分担者: 小沼 健 大阪大学, 大学院理学研究科, 助教 (30632103)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2015年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: オヤマボヤ / 尾虫類 / 遺伝子導入 / DNAi / トランスジェネシス / RNAseq / 遺伝子機能阻害 / オタマボヤ / 脊索動物 / トランスジェニック / トランスポゾン / 突然変異体形成 / 胚発生 / エンハンサートラップ / 変異体形成

研究成果の概要

ワカレオタマボヤOikopleura dioicaはヒトを含む脊索動物門に属する海洋性プランクトンで、脊椎動物と共通な基本体制を持ちながらも世代時間が5日と短い。本研究では、ワカレオタマボヤを利用して、線虫やハエのように有用な研究モデル生物を作り上げることを目指した。研究の過程で遺伝子の機能を抑制するための方法としてDNAiが可能であることが判明した。この方法を用いれば、ワカレオタマボヤをもちいて発生に関わる遺伝子を容易にかつ安価にスクリーニングすることが可能となった。

研究成果

• [国際共同研究] CRBM(フランス)
• [雑誌論文] Guidelines for the nomenclature of genetic elements in tunicate genomes. (2015)
  • 著者名/発表者名: Stolfi, A., Sasakura, Y., Chalopin, D., Satou, Y., Christiaen, L., Dantec, C., Endo, T., Naville, M., Nishida, H., Swalla, B., Volff J-N, Voskoboynik, A., Dauga, D., and Lemaire, P.
  • 雑誌名: Genesis 巻: 53 号: 1 ページ: 1-14
  • DOI: 10.1002/dvg.22822
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] REGULATOR: a database of metazoan transcription factors and maternal factors for developmental studies. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wang, K., and Nishida, H.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 16 号: 1 ページ: 114-114
  • DOI: 10.1186/s12859-015-0552-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] DNA-induced gene silencing in the appendicularian Oikopleura dioica. (2015)
  • 著者名/発表者名: Omotezako, T., Onuma, T. A., and Nishida, H.
  • 雑誌名: Proc. R. Soc. B 巻: 282 号: 1807 ページ: 20150435-20150435
  • DOI: 10.1098/rspb.2015.0435
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Maternal and zygotic transcriptomes in the appendicularian, Oikopleura dioica: Novel protein-encoding genes, intra-species sequence variations, and trans-spliced RNA leader. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wang K., Omotezako T., Kishi K., Nishida H., and Onuma T. A.
  • 雑誌名: Development Genes and Evolution 巻: 225(3) 号: 3 ページ: 149-159
  • DOI: 10.1007/s00427-015-0502-7
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Polarization of PI3K activity initiated by ooplasmic segregation guides nuclear migration in the mesendoderm. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takatori, N., Oonuma, K., Nishida, H. and Saiga, H.
  • 雑誌名: Developmental Cell 巻: 35 号: 3 ページ: 333-343
  • DOI: 10.1016/j.devcel.2015.10.012
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] ANISEED 2015: a digital framework for the comparative developmental biology of ascidians. (2015)
  • 著者名/発表者名: Brozovic, Martin, Dantec, Dauga, Mendez, Simion, Percher, Laporte, Scornavacca, Di Gregorio, Fujiwara, et al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 44 号: D1 ページ: 808-818
  • DOI: 10.1093/nar/gkv966
  • NAID: 120007129589
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] DNA interference: DNA-induced gene silencing in the appendicularian Oikopleura dioica. (2015)
  • 著者名/発表者名: Omotezako, T., Onuma, T. A., and Nishida, H.
  • 雑誌名: Proc. R. Soc. B 巻: in press
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Regulation of the number of cell division rounds by tissue-specific transcription factors and Cdk inhibitor during ascidian embryogenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kuwajima, M., Kumano, G., and Nishida, H.
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 号: 3 ページ: e90188-e90188
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0090188
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transcription factor Tbx6 plays a central role in fate determination between mesenchyme and muscle in embryos of the ascidian, Halocynthia roretzi. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kumano, G., Negoro, N., and Nishida, H.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 巻: 56 号: 4 ページ: 310-322
  • DOI: 10.1111/dgd.12133
  • NAID: 40020059339
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Control of the number of cell division rounds in distinct tissues during ascidian embryogenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamada, A., and Nishida, H.
  • 雑誌名: Dev. Growth Differ. 巻: 56 号: 5 ページ: 376-386
  • DOI: 10.1111/dgd.12141
  • NAID: 40020109517
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cell lineages and fate maps in tunicates: Conservation and modification (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishida, H., and Stach, T.
  • 雑誌名: Zool. Sci. 巻: 31 号: 10 ページ: 645-652
  • DOI: 10.2108/zs140117
  • NAID: 40020231557
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Long-distance cell migrations during larval development in the appendicularian, Oikopleura dioica. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kanae Kishi, Takeshi A. Onuma, and Hiroki Nishida.
  • 雑誌名: Developmental Biology 巻: 395(2) 号: 2 ページ: 299-306
  • DOI: 10.1016/j.ydbio.2014.09.006
  • 査読あり
• [学会発表] 脊索動物ワカレオタマボヤの表皮パターニングと系譜解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岸香苗，林桃子，小沼健，西田宏記
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（新潟）
  • 年月日: 2015-09-17
• [学会発表] オタマボヤの左右対称な器官の形成は細胞系譜レベルの左右非対称性をもつ (2015)
  • 著者名/発表者名: 小沼健，林桃子，西田宏記
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（新潟）
  • 年月日: 2015-09-17
• [学会発表] オタマボヤを用いた母性と胚性のRNA-Seq (2015)
  • 著者名/発表者名: 王凱，表迫竜也，岸香苗，西田宏記，小沼健
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（新潟）
  • 年月日: 2015-09-17
• [学会発表] ワカレオタマボヤの甲状腺・内柱関連遺伝子群の発現 (2015)
  • 著者名/発表者名: 平尾早智澄，Kai Wang，小沼健，西田宏記，小笠原道生
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 朱鷺メッセ（新潟）
  • 年月日: 2015-09-17
• [学会発表] Oocyte maturation and establishment of the animal-vegetal axis in ascidians (2015)
  • 著者名/発表者名: Masumi Tokuhisa, and Hiroki Nishida
  • 学会等名: The 8th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Aomori City Cultural Hall （青森）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会
• [学会発表] Maternal and zygotic transcriptomes in the appendicularian, Oikopleura dioica: Novel protein-encoding genes, intra-species sequence variations, and trans-spliced RNA leader (2015)
  • 著者名/発表者名: Kai Wang, Tatsuya Omotezako, Kanae Kishi, Hiroki Nishida, and Takeshi A. Onuma
  • 学会等名: The 8th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Aomori City Cultural Hall （青森）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会
• [学会発表] Morphogenesis and patterning of the trunk epidermis of the appendicuralian, Oikopleura dioica (2015)
  • 著者名/発表者名: Kanae Kishi, Momoko Hayashi, Takeshi A. Onuma, Hiroki Nishida
  • 学会等名: The 8th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Aomori City Cultural Hall （青森）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会
• [学会発表] Internal and external morphology of adults of the appendicularian, Oikopleura dioica: A SEM study (2015)
  • 著者名/発表者名: Takeshi A. Onuma, Miho Isobe, Hiroki Nishida
  • 学会等名: The 8th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Aomori City Cultural Hall （青森）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会
• [学会発表] DNA interference: new gene silencing method in the appendicularian, Oikopleura dioica (2015)
  • 著者名/発表者名: Tatsuya Omotezako, Takeshi A. Onuma, and Hiroki Nishida
  • 学会等名: The 8th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Aomori City Cultural Hall （青森）
  • 年月日: 2015-07-13
  • 国際学会
• [学会発表] Oocyte maturation and establishment of the animal-vegetal axis in ascidians (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Nishida
  • 学会等名: Oocyte maturation and Fertilization Meeting IV
  • 発表場所: 東北大学浅虫海洋生物学教育研究センター（青森）
  • 年月日: 2015-06-15
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] オタマボヤを用いた母性と胚性のRNA-Seq: 新規遺伝子、種内変異、トランススプライシング (2015)
  • 著者名/発表者名: 王凱，表迫竜也，岸香苗，西田宏記，小沼健
  • 学会等名: 日本発生生物学会
  • 発表場所: International Congress Center (筑波)
  • 年月日: 2015-06-02
• [学会発表] 走査型電子顕微鏡による脊索動物ワカレオタマボヤの外部構造・内部構造の観察 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小沼健、磯部美穂、西田宏記
  • 学会等名: 日本発生生物学会
  • 発表場所: International Congress Center (筑波)
  • 年月日: 2015-06-02
• [学会発表] 脊索動物ワカレオタマボヤの表皮パターニングと系譜解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岸香苗、林桃子、小沼健、西田宏記
  • 学会等名: 日本発生生物学会
  • 発表場所: International Congress Center (筑波)
  • 年月日: 2015-06-02
• [学会発表] RNA interference and DNA interference: Two gene silencing systems in the appendicularian Oikopleura dioica (2014)
  • 著者名/発表者名: 表迫竜也、小沼健、西田宏記
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜）
  • 年月日: 2014-11-26
• [学会発表] オタマボヤを用いた発生額研究の近況 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小沼健、表迫竜也、岸香苗、西田宏記
  • 学会等名: ホヤ研究会
  • 発表場所: 筑波大学東京キャンパス（東京）
  • 年月日: 2014-10-13
• [学会発表] ワカレオタマボヤ幼生期における三種の長距離移動細胞の移動メカニズム (2014)
  • 著者名/発表者名: 岸香苗、小沼健、西田宏記
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス（仙台）
  • 年月日: 2014-09-11
• [学会発表] 脊索動物ワカレオタマボヤの左右非対称性の形成:２細胞期胚の左右割球の標識追跡 (2014)
  • 著者名/発表者名: 林桃子、小沼健、西田宏記
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス（仙台）
  • 年月日: 2014-09-11
• [学会発表] 脊索動物ワカレオタマボヤの走査型電子顕微鏡による観察 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小沼健、磯部美穂、西田宏記
  • 学会等名: 日本動物学会
  • 発表場所: 東北大学川内北キャンパス（仙台）
  • 年月日: 2014-09-11
• [備考] Hiroki NISHIDA's Laboratory
  • URL: http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/nishida/index.html
• [備考] 西田研究室ホームページ
  • URL: http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/nishida/index.html