• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

天然有機化合物の構造解析をサポートする実践的な計算化学利用法

研究課題

研究課題/領域番号 26660093
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生物有機化学
研究機関弘前大学

研究代表者

橋本 勝  弘前大学, 農学生命科学部, 教授 (40212138)

研究分担者 根平 達夫  広島大学, 大学院総合科学研究科, 准教授 (60321692)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円)
2015年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2014年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード天然物構造決定 / スペクトル解析 / 分子起動計算予測 / 天然物 / 分子起動計算 / NMR化学シフト予想 / 密度汎関数分子軌道法 / 化学シフト計算 / 電子円二色性スペクトル計算
研究成果の概要

天然有機化合物の構造決定において、スペクトル解析は極めて重要である。多くの場合、シグナルの帰属では経験に基づく帰納的判断がなされてきた。従って特異な構造の場合、データベースの信頼性が低下する。一方、近年のコンピュータの発達によって理論に基づくスペクトル予想が可能になってきた。しかし、天然物に応用された例は多くなく、一般化させるには不十分である。そこで、NMR化学シフトおよび電子円二色性スペクトルに標的を絞り、必要な計算手法、基底関数、構造最適化アルゴリズムなどの条件の選択、最適な配座解析法の組み合わせ、精密計算が対象としうる化学構造などのscope and limitationを行う。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (21件) (うち国際共著 2件、 査読あり 20件、 オープンアクセス 12件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Homopetasinic acid isolated from Diaporthe sp. strain 1308-052016

    • 著者名/発表者名
      A Ito, I Kumagai, M Maruyama, H Maeda, A Tonouchi, T Nehira, K Kimura, M Hashimoto
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters

      巻: 57(10) 号: 10 ページ: 1117-1119

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2016.01.095

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation, absolute structures, and biological properties of cyclohelminthols I-IV from Helminthosporium velutinum yone962016

    • 著者名/発表者名
      Yuna Honmura, Shota Uesugi, Hayato Maeda, Kazuaki Tanaka, Tatsuo Nehira, Ken-ichi Kimura, Masaaki Okazaki, Masaru Hashimot
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 72 号: 10 ページ: 1400-1405

    • DOI

      10.1016/j.tet.2016.01.036

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homojesterones: vinylogous analogues of jesterone from Helminthosporium velutinum TS282016

    • 著者名/発表者名
      M Arayama, S Uesugi, K Tanaka, H Maeda, T Nehira, K Kimura, M Hashimoto
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 72(7) 号: 7 ページ: 1031-1035

    • DOI

      10.1016/j.tet.2015.12.077

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cassane diterpenoids from the roots of Caesalpinia decapetala var. japonica and structure revision of caesaljapin2016

    • 著者名/発表者名
      S. Kamikawa, S. Oshimo, E. Ohta, T. Nehira, H. Omura, and S. Ohta
    • 雑誌名

      Phytochemistry

      巻: 121 ページ: 50-57

    • DOI

      10.1016/j.phytochem.2015.10.001

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Structure Revision of Caesalpinista A and Caesalpinista B and Isolation of a New Furanoditerpenoid from the Cotyledons of Caesalpinia decapetala var. japonica2016

    • 著者名/発表者名
      S. Kamikawa, E. Ohta, T. Nehira, H. Omura, and S. Ohta
    • 雑誌名

      Helvetica Chimca Acta

      巻: 99 号: 2 ページ: 133-137

    • DOI

      10.1002/hlca.201500171

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Computation-Assisted Structural Elucidation of Epoxyroussoeone and Epoxyroussoedione Isolated from Roussoella japanensis KT16512015

    • 著者名/発表者名
      Y Honmura, H Takekawa, K Tanaka, H Maeda, T Nehira, W Hehre, M Hashimoto
    • 雑誌名

      Journal of natural products

      巻: 78(7) 号: 7 ページ: 1505-1510

    • DOI

      10.1021/np500924n

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Isolation, ECD assisted structural analyses, biosynthetic discussions, and biological activities of epi-cochlioquinones D and its derivatives2015

    • 著者名/発表者名
      M Arayama, T Nehira, H Maeda, K Tanaka, H Miyagawa, T Ueno, S Hosokawa, M Hashimoto
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 71(29) 号: 29 ページ: 4788-4794

    • DOI

      10.1016/j.tet.2015.05.044

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Achaetolide-II isolated from Helminthosporium velutinum TS282015

    • 著者名/発表者名
      M Arayama, H Maeda, K Tanaka, N Takada, T Nehira, M Hashimoto
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 71(41) 号: 41 ページ: 7900-7905

    • DOI

      10.1016/j.tet.2015.08.013

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel himachalene-type sesquiterpenes from male adults of Chinese Windmill butterfly, Byasa alcinous alcinous2015

    • 著者名/発表者名
      Hisashi Omura, Taro Noguchi, Tatsuo Nehira
    • 雑誌名

      Natural Products Researches

      巻: 29 号: 4 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1080/14786419.2015.1019352

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Niphateolide A: isolation from the marine sponge Niphates olemda and determination of its absolute configuration by an ECD analysis2015

    • 著者名/発表者名
      H. Kato, T. Nehira, K. Matsuo, T. Kawabata, Y. Kobashigawa, H. Morioka, F. Losung, R. E. P. Mangindaan, N. J. de Voogd, H. Yokosawa, S. Tsukamoto
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 71 号: 38 ページ: 6956-6960

    • DOI

      10.1016/j.tet.2015.07.009

    • NAID

      120006897988

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Taichunamides: Unprecedented Prenylated Indole Alkaloids from Aspergillus taichungensis (IBT 19404)2015

    • 著者名/発表者名
      9.Ippei Kagiyama, Hikaru Kato, Tatsuo Nehira, Jens C. Frisvad, David H. Sharman, Robert M, Williams, Sachiko Tsukamoto
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 55 号: 3 ページ: 1128-1132

    • DOI

      10.1002/anie.201509462

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Isotopic Differentiation Protocol, a Selective Extraction of C- and N-Terminal Ions in ESI-Ms/Ms De Novo Peptide Sequencing2015

    • 著者名/発表者名
      .Fujii, M.; Chiba, H.; Tamayama, N.; Kanamaru, S.; Hashimoto, M.
    • 雑誌名

      Nat. Prod. Chem. Res.

      巻: 3 号: 1 ページ: 164-164

    • DOI

      10.4172/2329-6836.1000164

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Relative and absolute structure of phomolide C2015

    • 著者名/発表者名
      Ito, A.; Maeda, H.; Tonouchi, A.; Hashimoto, M
    • 雑誌名

      Biosci. Biotech. Biochem

      巻: 79 号: 7 ページ: 1-3

    • DOI

      10.1080/09168451.2015.1015953

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation and structure elucidation of potential anti-dengue metabolites from tawa-tawa (Euphorbia hirta Linn.)2014

    • 著者名/発表者名
      Tayone, W. C.; Tayone, J. C.; Hashimoto, M
    • 雑誌名

      Walailak Journal of Science and Technology

      巻: 11 ページ: 825-832

    • DOI

      10.14456/wjst.2014.65

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Neomacrophorin I, II, and III, novel drimenyl cyclohexanes with hydroxylated butanoates from Trichoderma sp. 1212-032014

    • 著者名/発表者名
      3. Hirose, A.; Maeda, H.; Tonouchi, A.; Nehira, T.; Hashimoto, M.
    • 雑誌名

      Tetrahedron

      巻: 70 号: 7 ページ: 1458-1463

    • DOI

      10.1016/j.tet.2013.12.087

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] リンゴ果実におけるマイコパラサイト現象の生物有機化学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝
    • 雑誌名

      日本化学会生体機能関連部会ニュースレター

      巻: 28 ページ: 3-6

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Lambertellin system, the mechanism for fungal replacement of Monilinia fructigena with Lambertella corni-maris without competitive inhibition on agar media2014

    • 著者名/発表者名
      1.Hirose, A.; Kudo, S.; Murakami, T.; Tanaka, K.; Harada, K.; Hashimoto, M
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 22 号: 8 ページ: 2489-2495

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.02.051

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] absolute configuration determination via comparison of experimental and theoretical electronic circular dichroic spectra2014

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Ito, Tatsuo Nehira, Dehydroxylation of stilbenoid oligomers
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters

      巻: 55 号: 2 ページ: 314-318

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2013.10.106

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dehydroxylation of stilbenoid oligomers: absolute configuration determination via comparison of experimental and theoretical electronic circular dichroic spectra2014

    • 著者名/発表者名
      Tetsuro Ito, Tatsuo Nehira
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters

      巻: 55 号: 35 ページ: 314-318

    • DOI

      10.1016/j.tet.2014.06.074

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chiroptical molecular propeller based on hexakis(phenylethyl)benzene through the complexation-induced intramolecular transmission of local point chirality2014

    • 著者名/発表者名
      Ryo Katoono, Keiichi Kusaka, Shunsuke Kawai, Yuki Tanaka, Keisuke Hanada, Tatsuo Nehira, Kenshu Fujiwara, Takanori Suzuki
    • 雑誌名

      Prganic and Biomolecular Chemistry

      巻: 12 号: 47 ページ: 9532-9538

    • DOI

      10.1039/c4ob01601g

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Acanthomanzamines A-E with new manzamine frameworks from the marine sponge Acanthostrongylophora ingens.2014

    • 著者名/発表者名
      A. Furusato, H. Kato, T. Nehira, K. Eguchi, T. Kawabata, Y. Fujiwara, F. Losung, R. E. P. Mangindaan, N. J. de Voogd, M. Takeya, H. Yokosawa, S. Tsukamoto
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 16 号: 15 ページ: 3888-3891

    • DOI

      10.1021/ol5015569

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Cochlioquinone 化学の新展開―ECD の徹底活用と新たな生物活性考察2015

    • 著者名/発表者名
      荒山美紀、前多隼人、田中和明、根平達夫、宮川恒、上野民夫、細川誠二郎、橋本勝
    • 学会等名
      University of Saskatchewan Special Simminor
    • 発表場所
      yokohama
    • 年月日
      2015-09-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Isolation, ECD Assisted Structural Analyses, Biosynthetic Discussions, and Biological activities of epi-Cochlioquinones D and its Derivatives2015

    • 著者名/発表者名
      M. Arayama, T. Nehira, H. Maeda, K. Tanaka, H. Miyagawa, T. Ueno, S. Hosokawa, M. Hashimoto
    • 学会等名
      15th International Conference on Chiral Spectroscopy
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Bioorganic Studies on Mycoparasitism on Apple Fruites2015

    • 著者名/発表者名
      Masaru Hashimoto
    • 学会等名
      University of Saskatchewan Special Simminor
    • 発表場所
      サスカチュワン
    • 年月日
      2015-08-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Phomolide Cの相対及び絶対配置の決定2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤厚、殿内暁夫、橋本勝
    • 学会等名
      第10回化学生態学研究会
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2015-06-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 分子軌道計算支援による新規マクロフォリンの構造決定2015

    • 著者名/発表者名
      橋本勝, 本村優奈, 根平達夫
    • 学会等名
      第10回化学生態学研究会
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2015-06-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Spiroleptospholの全合成研究2015

    • 著者名/発表者名
      高橋萌子、橋本勝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年度大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Phomolide Cの相対及び絶対配置の決定2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤厚・殿内暁夫・橋本勝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年度大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規epi-cochlioquinone誘導体と その生合成前駆体の単離と構造2015

    • 著者名/発表者名
      荒山美紀、田中和明、前多隼人、根平達夫、橋本勝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2015年度大会
    • 発表場所
      岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Bioorganic Studies on Mycoparasitism on Apple Fruites2014

    • 著者名/発表者名
      Masaru Hashimoto
    • 学会等名
      Michigan State Univesity Department of Chemistry Seminor
    • 発表場所
      Michigan State University
    • 年月日
      2014-12-05
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 量子化学計算支援によるEpoxyroussoeone 類の構造決定2014

    • 著者名/発表者名
      本村優奈、狩原恭平、田中和明、前多隼人、根平達夫、Warren J. Hehrec、橋本勝
    • 学会等名
      第56回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      高知
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-17
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] リンゴ果実におけるマイコパラサイト現象の生物有機化学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝
    • 学会等名
      日本化学会東北支部、青森地区講演会
    • 発表場所
      弘前
    • 年月日
      2014-10-03
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Helminthosporium velutinum TS28が生産する新規epi-cochlioquinone誘導体2014

    • 著者名/発表者名
      荒山美紀、田中和明、橋本勝
    • 学会等名
      平成26年度 日本農芸化学会北海道支部・東北支部 合同支部大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Phomolide Cの相対及び絶対配置の決定2014

    • 著者名/発表者名
      伊藤厚、殿内暁夫、橋本勝
    • 学会等名
      平成26年度 日本農芸化学会北海道支部・東北支部 合同支部大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] MS/MSペプチド配列解析における簡便なイオン識別法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝、藤井眞、千葉洋、玉山方子
    • 学会等名
      平成26年度 日本農芸化学会北海道支部・東北支部 合同支部大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] リンゴ果実におけるマイコパラサイト現象の生物有機化学的研究2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝
    • 学会等名
      北海道大学理学部化学科講演会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Neomacrophorin類の構造決定2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝, 廣瀬あかね, 殿内暁夫, 前多隼人, 根平達夫
    • 学会等名
      第9回化学生態学研究会
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2014-06-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 量子化学計算支援によるEpoxyrousseone類の構造決定2014

    • 著者名/発表者名
      本村優奈, 狩原恭平, 田中和明, 前多隼人, 根平達夫, Warren Hehre, 橋本勝
    • 学会等名
      第9回化学生態学研究会
    • 発表場所
      函館
    • 年月日
      2014-06-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 計算機支援による天然物の構造決定2014

    • 著者名/発表者名
      橋本勝
    • 学会等名
      理研シンポジウム物質構造解析2014:MS とNMR の基礎と実践
    • 発表場所
      理化学研究所
    • 年月日
      2014-06-20
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 有機実験室

    • URL

      http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/lab/2/biochem/yuki/

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi