| 研究課題/領域番号 |
26660129
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
森林科学
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| 研究機関 | 秋田県立大学 |
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研究代表者 |
井上 みずき 秋田県立大学, 生物資源科学部, 助教 (80432342)
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| 研究分担者 |
蒔田 明史 秋田県立大学, 生物資源科学部, 教授 (60315596)
陶山 佳久 東北大学, 大学院農学研究科, 准教授 (60282315)
鈴木 準一郎 首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (00291237)
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| 連携研究者 |
齋藤 智之 独立行政法人森林総合研究所, 森林植生研究領域, 研究員 (00414483)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
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| キーワード | NGS / ササ / GBS / SNPs / 齢 / クローナル植物 / 次世代シーケンサー / 体細胞突然変異 / ジェネット / コアレセント理論 / Mutation Clock / 寿命 |
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| 研究成果の概要 |
齢が概ね明らかなチシマザサ（ Sasa kulirensis）を用いて、次世代シークエンサーを利用した改変GBS法によって網羅的なSNPs情報を得えることで、高精度な齢の推定方法を確立することを目的とした。
十和田湖周辺より採取した齢の異なるチシマザサを用いて、同一個体内の異なるラメットから4～8試料/個体、計24試料を解析した。共通座における個体内のSNPsの検出数には、齢や個体による差が認められなかったがSNPsの多様性は齢が古い個体でわずかに高いことが分かったことから、得られたSNPs情報が齢の推定に有用である可能性が示唆された.
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