• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

Every gene is everywhere, but the environment selects

研究課題

研究課題/領域番号 26660152
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 水圏生産科学
研究機関東京大学

研究代表者

伊知地 稔  東京大学, 大気海洋研究所, 特任研究員 (10633894)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードメタマルチオミクス / メタゲノム / メタプロテオーム / メタメタボローム / セントラルドグマ / メタオーム / 海洋微生物生態系 / 環境適応 / メタオミクス / マルチオミクス / 西部北太平洋
研究成果の概要

本研究は、「微生物群集は環境により異なるが、遺伝子群は普遍的に存在し、環境がセントラルドグマと代謝を選択する」という仮説を時空間的に異なる海洋生態系で実証することを目的とした。 試料は、西部北太平洋の亜寒帯と亜熱帯のそれぞれで表層と中深層、斬新層で採取した。
メタゲノムの遺伝子構造は測点や深度に関係なく同様の傾向を示し、その由来微生物群集構造は異なる傾向を示した。メタプロテオームは解析途中であるが、異なる傾向を示している。メタメタボロームも異なる傾向を示した。これらの結果は、本仮説を空間的に異なる海洋生態系で実証できたことを示す。今後は、本仮説を時間的に異なる海洋生態系で実証することを目指す。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Genomic and metagenomic analysis of microbes in a soil environment affected by the 2011 Great East Japan Earthquake Tsunami2016

    • 著者名/発表者名
      Hiraoka S, Machiyama A, Ijichi M, Inoue K, Oshima K, Hattori M, Yoshizawa S, Kogure K, and Iwasaki W
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 17 号: 1 ページ: 53-53

    • DOI

      10.1186/s12864-016-2380-4

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microbial Processes in RO Membrane System2015

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Kogure, Yui Takahashi, Minoru Ijichi, Eiko Ikemoto, and Hiroshi X. Chiura
    • 雑誌名

      MEMBRANE

      巻: 40 ページ: 91-97

    • NAID

      130005069468

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 海洋微生物を対象としたメタトランスクリプトーム解析のための海洋遺伝子アーカイバシステムの開発2016

    • 著者名/発表者名
      福場辰洋、藤村玲子、金子 亮、伊知地稔、木暮一啓
    • 学会等名
      2016年度日本海洋学会春季大会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス、東京
    • 年月日
      2016-03-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Every gene is everywhere, but the environment selects2014

    • 著者名/発表者名
      伊知地稔、町山麻子、高橋唯、千浦博、伊藤世人、北出有、花田茂久、田中祐之、岩崎渉、木暮一啓
    • 学会等名
      環境微生物系学会合同大会2014
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2014-10-21 – 2014-10-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Meta-omics approach to biofilm communities on the membrane of seawater reverse osmosis system2014

    • 著者名/発表者名
      Minoru Ijichi, Asako Machiyama, Yui Takahashi, Hiroshi X. Chiura, Yohito Ito, Tamotsu Kitade, Shigehisa Hanada, Yuji Tanaka, Wataru Iwasaki and Kazuhiro Kogure
    • 学会等名
      15th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Seoul, Korea
    • 年月日
      2014-08-24 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Every gene is everywhere, but the environment selects2014

    • 著者名/発表者名
      伊知地稔、町山麻子、高橋唯、千浦博、伊藤世人、北出有、花田茂久、田中祐之、岩崎渉、木暮一啓
    • 学会等名
      第8回細菌学若手コロッセウム
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2014-08-06 – 2014-08-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi