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メタゲノムを用いた沿岸海洋環境におけるファージの動態と細菌叢に及ぼす影響の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26660170
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 水圏生命科学
研究機関東京海洋大学

研究代表者

佐野 元彦  東京海洋大学, 学術研究院, 教授 (00372053)

研究分担者 近藤 秀裕  東京海洋大学, 学術研究院, 准教授 (20314635)
連携研究者 廣野 育生  東京海洋大学, 学術研究院, 教授 (00270926)
研究協力者 鮫島 守  
野村 昌功  
中根 基行  
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2016年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード海洋生態 / 海洋微生物 / ファージ / マリンゲノム / メタゲノム
研究成果の概要

本研究では、メタゲノム解析を応用してクルマエビ養殖場のプランクトン・微生物叢に及ぼすバクテリオファージの影響を解明することを目的とした。メタゲノム解析を応用するための基礎的な検討を行った結果、今までほとんどブラックボックスであったエビ養殖池におけるプランクトン・微生物環境をメタゲノム解析によりモニタリングすることが可能となり、培養できないものも含めた棲息微生物全体の内訳が把握できるようになった。環境細菌に感染する新たなファージを分離し、それらのゲノム配列を登録するとともに、ファージの検出を試みたが、得られた配列は少数で、プランクトンのウイルスが大多数を占めると推測された。

報告書

(4件)
  • 2016 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 3件、 査読あり 4件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (3件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] マレーシア大学サバ校ボルネオ海洋研究所(マレーシア)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Borneo Marine Research Institute(マレーシア)

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Lytic Giant Bacteriophage pT24 Infecting Tenacibaculum sp. Isolated from Shrimp Culture Pond2017

    • 著者名/発表者名
      Ho Viet Khoa, Yuki Midorikawa, Tsubasa Uchino, Toshihiro Nakai, Goshi Kato, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Matthura Labaiden, Sataporn Direkbusarakom, Motohiko Sano
    • 雑誌名

      Genome Announcement

      巻: -

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Isolation and Characterization of Large Marine Bacteriophage (Myoviridae), VhKM4 Infecting Vibrio harveyi2017

    • 著者名/発表者名
      Tamrin M. Lal , Motohiko Sano, Julian Ransangan
    • 雑誌名

      Journal of Aquatic Animal Health

      巻: 29 号: 1 ページ: 26-30

    • DOI

      10.1080/08997659.2016.1249578

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of a giant Vibrio phage ValKK3 infecting Vibrio alginolyticus2016

    • 著者名/発表者名
      Tamrin M. Lal, Motohiko Sano, Kishio Hatai, Julian Ransangan
    • 雑誌名

      Genomics Data

      巻: 8 ページ: 37-38

    • DOI

      10.1016/j.gdata.2016.03.002

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Complete genome sequence analysis of two Pseudomonas plecoglossicida phages, potential therapeutic agents2015

    • 著者名/発表者名
      Kawato Y, Yasuike M, Nakamura Y, Shigenobu Y, Fujiwara A, Sano M, Nakai T
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 81 号: 3 ページ: 874-881

    • DOI

      10.1128/aem.03038-14

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Metagenome monitoring of biological environment in shrimp culture pond2017

    • 著者名/発表者名
      Yuki Midorikawa, Tsubasa Uchino, Yoshinori Nomura, Motoyuki Nakane, Mamoru Sameshima, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Matthura Labaiden, Sataporn Direkbusarakom, Goshi Kato and Motohiko Sano
    • 学会等名
      JSFS International Symposium on “Fisheries Science for the Future Generations
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2017-09-22
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] APPLICATION OF METAGENOMIC ANALYSIS TO BIOLOGICAL ENVIRONMENT MONITORING OF SHRIMP CULTURE POND2017

    • 著者名/発表者名
      Yuki Midorikawa, Tsubasa Uchino, Yoshinori Nomura, Motoyuki Nakane, Mamoru Sameshima, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Matthura Labaiden, Sataporn Direkbusarakom, Goshi Kato and Motohiko Sano
    • 学会等名
      10th Symposium on Diseases in Asian Aquaculture
    • 発表場所
      バリ、インドネシア
    • 年月日
      2017-08-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] メタゲノム解析によるクルマエビ養殖池の生物環境 モニタリングへ向けた基礎的研究2017

    • 著者名/発表者名
      翠川優希・内野翼・野村昌功・郡司掛博昭・ 中根基行・鮫島守・ 加藤豪司・近藤秀裕・佐野元彦
    • 学会等名
      平成29年度日本水産学会春大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2017-03-26
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2018-03-22  

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