ファミリー131に属する機能未知酵素がバイオマス分解に果たす役割の解明

• 研究課題/領域番号: 26660277
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 環境農学(含ランドスケープ科学)
• 研究機関: 東京農工大学
• 研究代表者: 殿塚 隆史 東京農工大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (50285194)
• 連携研究者: 吉田 誠 東京農工大学, 大学院農学研究院, 准教授 (30447510)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: バイオマス / 担子菌 / 糖質加水分解酵素

研究成果の概要

本研究は、糖質加水分解酵素ファミリー131に属する担子菌Coprinopsis cinerea由来の機能未知酵素であるCcGH131AおよびCcGH131Bの、構造と性質の解明を目的とする。CcGH131Aの酵母を用いた発現系を構築し、またCcGH131A触媒ドメインとリガンドとの複合体の立体構造解析を行った。CcGH131BについてはcDNA を取得し大腸菌による発現系を構築した。さらに結晶化を行い、立体構造を決定することができた。蛍光光度計により、多糖との相互作用の解析を行った。これらの結果、糖に対する特異性はCcGH131AとCcGH131Bで異なることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] A Surface Loop in the N-Terminal Domain of <i>Pedobacter heparinus </i>Heparin Lyase II is Important for Activity (2016)
  • 著者名/発表者名: Mori, M., Ichikawa, M., Kiguchi, Y., Miyazaki, T., Hattori, M., Nishikawa, A. and Tonozuka, T.
  • 雑誌名: Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 63 号: 1 ページ: 7-11
  • DOI: 10.5458/jag.jag.JAG-2015_019
  • NAID: 130005126301
  • ISSN: 1344-7882, 1880-7291
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A glycoside hydrolase family 31 dextranase with high transglucosylation activity from Flavobacterium johnsoniae (2016)
  • 著者名/発表者名: Gozu, Y., Ishizaki, Y., Hosoyama, Y., Miyazaki, T., Nishikawa, A. and Tonozuka, T.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 巻: 印刷中 号: 8 ページ: 1562-1567
  • DOI: 10.1080/09168451.2016.1182852
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural and biochemical characterization of novel bacterial α-galactosidases belonging to glycoside hydrolase family 31 (2015)
  • 著者名/発表者名: Takatsugu Miyazaki, Yuichi Ishizaki, Megumi Ichikawa, Atsushi Nishikawa and Takashi Tonozuka
  • 雑誌名: Biochemical Journal 巻: in press 号: 1 ページ: 145-158
  • DOI: 10.1042/bj20150261
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal structure and mutational analysis of isomalto-dextranase, a member of glycoside hydrolase family 27 (2015)
  • 著者名/発表者名: Okazawa, Y., Miyazaki, T., Yokoi, G., Ishizaki, Y., Nishikawa, A. and Tonozuka, T.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 290 号: 43 ページ: 26339-26349
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.680942
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The side chain of a glycosylated asparagine residue is important for the stability of isopullulanase. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takatsugu Miyazaki, Hiroyuki Yashiro, Atsushi Nishikawa and Takashi Tonozuka
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 巻: 157 号: 4 ページ: 225-234
  • DOI: 10.1093/jb/mvu065
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal structure and substrate-binding mode of GH63 mannosylglycerate hydrolase from Thermus thermophilus HB8. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takatsugu Miyazaki, Megumi Ichikawa, Hitoshi Iino, Atsushi Nishikawa and Takashi Tonozuka
  • 雑誌名: Journal of Structural Biology 巻: 190 号: 1 ページ: 21-30
  • DOI: 10.1016/j.jsb.2015.02.006
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] 担子菌Coprinopsis cinerea由来タンパク質CcGH131BのＸ線結晶構造解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 奥山舜朔、林昌宏、砂川直輝、石田卓也、五十嵐圭日子、吉田誠、西河淳、殿塚隆史
  • 学会等名: 日本農芸化学会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道札幌市白石区）
  • 年月日: 2016-03-28
• [学会発表] 担子菌Coprinopsis cinerea由来機能未知タンパク質CcGH131Aの結晶構造解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 林昌宏、奥山舜朔、田中祐太郎、田村瑞、砂川直輝、石田卓也、梅澤究、吉田誠、五十嵐圭日子、西河淳、殿塚隆史
  • 学会等名: 2015年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-03-15