体細胞初期化過程における内在性レトロトランスポゾンの役割

• 研究課題/領域番号: 26670137
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 医化学一般
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 山本 拓也 京都大学, iPS細胞研究所, 助教 (60546993)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2015年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: ゲノム / 発生・分化 / 発生･分化

研究成果の概要

近年の研究により、胚発生の初期過程や神経前駆細胞において、内在性レトロトランスポゾンによるゲノムの改変が高頻度で起こっていることが示唆されている。本研究では、内在性レトロトランスポゾンによるゲノム改変が体細胞初期化過程で果たす役割を明らかにするため、Retrotransposon Capture Sequencing (RC-Seq) 法を用いて、ヒトiPS細胞におけるレトロトランスポゾンの挿入箇所をゲノムワイドに同定した。さらに、体細胞初期化過程でレトロトランスポゾンの配列を新たに獲得したゲノム上の位置を明らかにし、それらの挿入箇所と体細胞初期化の関連性を調べた。