新しいエピゲノムとしてのDNAの2次構造による転写調節

• 研究課題/領域番号: 26670171
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 人類遺伝学
• 研究機関: 藤田保健衛生大学
• 研究代表者: 倉橋 浩樹 藤田保健衛生大学, 総合医科学研究所, 教授 (30243215)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円); 2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: グアニン四重鎖 / DNA二次構造 / プロモーター / アネキシン / 多型 / 習慣流産 / エピゲノム / アネキシンV / ２次構造 / バイサルファイト法 / 2次構造

研究成果の概要

ANXA5遺伝子のプロモーターにある遺伝子多型によるハプロタイプが習慣流産と関連し、女性が高リスクのM2ハプロタイプを持つと流産のリスクが増加する。M2からのANXA5遺伝子の発現量は少なく、プロモーター活性は低い。ANXA5遺伝子のプロモーター領域の多型の位置にはG4形成のコンセンサス配列がある。野生型とM2のヘテロ接合体の胎盤由来のゲノムをバイサルファイト処理後、PCR産物を次世代シーケンサーで解析した。C>T変換パターンから、M2はG4の形成しやすさに影響し、その結果、ANXA5のプロモーター活性や発現量が低下し、胎盤内過凝固をひきおこし、流産のリスクが増加する可能性が示唆された。

研究成果

• [国際共同研究] ミュンスター大学(ドイツ)
• [雑誌論文] TUBA1A mutation can cause a hydranencephaly-likesevere form of cortical dysgenesis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yokoi S, Ishihara N, Miya F, Tsutsumi M, Yanagihara I, Fujita N, Yamamoto H, Kato M, Okamoto N, Tsunoda T, Yamasaki M, Kanemura Y, Kosaki K, Kojima S, Saitoh S, Kurahashi H, Natsume J.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 23 号: 1 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1038/srep15165
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Whole Genomic Analysis of an Unusual Human G6P[14] Rotavirus Strain Isolated from a Child with Diarrhea in Thailand: Evidence for Bovine-To-Human Interspecies Transmission and Reassortment Events (2015)
  • 著者名/発表者名: Tacharoenmuang R, Komoto S, Guntapong R, Ide T, Haga K, Katayama K, Kato T, Ouchi Y, Kurahashi H, Tsuji T, Sangkitporn S, Taniguchi K.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(9) 号: 9 ページ: 1-23
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0139381
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Emergence and Characterization of Unusual DS-1-Like G1P[8] Rotavirus Strains in Children with Diarrhea in Thailand (2015)
  • 著者名/発表者名: Komoto S, Tacharoenmuang R, Guntapong R, Ide T, Haga K, Katayama K, Kato T, Ouchi Y, Kurahashi H, Tsuji T, Sangkitporn S, Taniguchi K.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(11) 号: 11 ページ: 1-22
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0141739
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A unique TBX5 microdeletion with microinsertion detected in patient with Holt-Oram syndrome. (2015)
  • 著者名/発表者名: Morine M, et al.
  • 雑誌名: Am J Med Genet A 巻: 167 号: 12 ページ: 3192-3196
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.37359
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intragenic duplication in the PKHD1 gene in autosomal recessive polycystic kidney disease. (2015)
  • 著者名/発表者名: Miyazaki J, et al.
  • 雑誌名: BMC Med Genet 巻: 16 号: 1 ページ: 98-98
  • DOI: 10.1186/s12881-015-0245-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Preimplantation genetic diagnosis/screening by comprehensive molecular testing (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H, Kato T, Miyazaki J, Nishizawa H, Nishio E, Furukawa H, Miyamura H, Ito M, Endo T, Ouchi Y, Inagaki H, Fujii T
  • 雑誌名: Reprod Med Biol 巻: 15 号: 1 ページ: 13-19
  • DOI: 10.1007/s12522-015-0216-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nine-year follow-up in a child with chromosomal integration of human herpesvirus 6 transmitted from an unrelated donor through the Japan Marrow Donor Program (2015)
  • 著者名/発表者名: Yagasaki H, Shichino H, Shimizu N, Ohye T, Kurahashi H, Yoshikawa T, Takahashi S
  • 雑誌名: Transpl Infect Dis 巻: 17 号: 1 ページ: 160-161
  • DOI: 10.1111/tid.12338
  • 査読あり
• [雑誌論文] PCSK5 mutation in a patient with the VACTERL association (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakamura Y. et al.
  • 雑誌名: BMC Res Notes 巻: 8 号: 1 ページ: 228-228
  • DOI: 10.1186/s13104-015-1166-0
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Novel FATP4 mutations responsible for ichthyosis prematurity syndrome in a Japanese patient (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsuge I, Morishita M, Kato T, Tsutsumi M, Inagaki H, Mori Y, Yamawaki K, Inuo C, Ieda K, Ohye T, Hayakawa A, Kurahashi H
  • 雑誌名: Human Genome Variation 巻: 2 号: 1 ページ: 15003-15003
  • DOI: 10.1038/hgv.2015.3
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Age-related decrease of meiotic cohesins in human oocyte (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutsumi M, Fujiwara R, Nishizawa H, Ito M, Kogo H, Inagaki H, Ohye T, Kato T, Fujii T, Kurahashi H
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9, 号: 5 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0096710
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dual roles for the telomeric repeats in chromosomally integrated human herpesvirus-6. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohye T, Inagaki H, Ihira M, Higashimoto Y, Kato K, Oikawa J, Yagasaki H, Niizuma T, Takahashi Y, Kojima S, Yoshikawa T, Kurahashi H
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 4 号: 1 ページ: 4559-4559
  • DOI: 10.1038/srep04559
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24.13;q11.21) translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: Mishra D, Kato T, Inagaki H, Kosho T, Wakui K, Kido Y, Sakazume S, Taniguchi-Ikeda M, Morisada N, Iijima K, Fukushima Y, Emanuel BS, Kurahashi H
  • 雑誌名: Mol Cytogenet 巻: 7 号: 1 ページ: 55-55
  • DOI: 10.1186/s13039-014-0055-x
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Signature of backward replication slippage at the copy number variation junction. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohye T, Inagaki H, Ozaki M, Ikeda T, Kurahashi H
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: in press 号: 5 ページ: 247-250
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.20
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of the t(3;8) of hereditary renal cell carcinoma: A palindrome mediated translocation (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato T, Franconi CP, Sheridan MB, Hacker AM, Inagakai H, Glover TW, Arlt MF, Drabkin HA, Gemmill RM, Kurahashi H, Emanuel BS
  • 雑誌名: Cancer Genet 巻: 207 号: 4 ページ: 133-140
  • DOI: 10.1016/j.cancergen.2014.03.004
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prevalence of Emanuel syndrome: theoretical frequency and surveillance result (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohye T, Inagaki H, Kato T, Tsutsumi M, Kurahashi H
  • 雑誌名: Pediatr Int 巻: 56 号: 4 ページ: 462-466
  • DOI: 10.1111/ped.12437
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular and virological evidence of viral activation from chromosomally integrated human herpesvirus 6A in a patient with X-linked severe combined immunodeficiency (2014)
  • 著者名/発表者名: Endo A, Watanabe K, Ohye T, Suzuki K, Matsubara T, Shimizu N, Kurahashi H, Yoshikawa T, Katano H, Inoue N, Imai K, Takagi M, Morio T, Mizutani S
  • 雑誌名: Clin Infect Dis 巻: 59 号: 4 ページ: 545-548
  • DOI: 10.1093/cid/ciu323
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] An immunocompetent child with chromosomally integrated human herpesvirus 6B accidentally identified during the care of Mycoplasma pneumoniae infection (2014)
  • 著者名/発表者名: Oikawa J, Tanaka J, Yoshikawa T, Morita Y, Hishiki H, Ishiwada N, Ohye T, Kurahashi H, Kohno Y
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: 20 号: 1 ページ: 65
  • DOI: 10.1016/j.jiac.2013.07.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acute eosinophilic pneumonia occurring in a dedicator of cytokinesis 8 (DOCK8) deficient patient. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsuge I, Ito K, Ohye T, Kando N, Kondo Y, Nakajima Y, Inuo C, Kurahashi H, Urisu A
  • 雑誌名: Pediatr Pulmonol 巻: 49 号: 3
  • DOI: 10.1002/ppul.22814
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pheochromocytoma as the first manifestation of MEN2A with RET mutation S891A: report of a case (2014)
  • 著者名/発表者名: Hibi Y, Ohye T, Ogawa K, Shimizu Y, Shibata M, Kagawa C, Mizuno Y, Uchino S, Kosugi S, Kurahashi H, Iwase K
  • 雑誌名: Surg Today 巻: 44 号: 11 ページ: 2195-2200
  • DOI: 10.1007/s00595-013-0826-8
  • 査読あり
• [雑誌論文] A MEN2A family with two asymptomatic carriers affected by unilateral renal agenesis (2014)
  • 著者名/発表者名: Hibi Y, Ohye T, Ogawa K, Shimizu Y, Shibata M, Kagawa C, Mizuno Y, Kurahashi H, Iwase K
  • 雑誌名: Endocr J 巻: 61 ページ: 19-23
  • NAID: 130004443932
  • 査読あり
• [雑誌論文] Serum liver-type fatty acid-binding protein predicts recovery of graft function after kidney transplantation from donors after cardiac death (2014)
  • 著者名/発表者名: Kawai A, Kusaka M, Kitagawa F, Ishii J, Fukami N, Maruyama T, Sasaki H, Shiroki R, Kurahashi H, Hoshinaga K
  • 雑誌名: Clin Transplant 巻: 28 号: 6 ページ: 749-754
  • DOI: 10.1111/ctr.12375
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Massive parallel sequencing revealed the conformational dynamics of the non-B form DNA at the promoter (2015)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Miyamura H, Tsutsumi M, Kato T, Nishizawa H, Kurahashi H
  • 学会等名: ASHG2015
  • 発表場所: Baltimore
  • 年月日: 2015-10-06
  • 国際学会
• [学会発表] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22) (q24.13;q11.21) translocation (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H, Mishra D, Kato T, Inagaki H, Kosho T, Wakui K et al.
  • 学会等名: ESHG2015
  • 発表場所: Glasgow
  • 年月日: 2015-06-06
  • 国際学会
• [学会発表] Deep sequencing of sodium bisulfite-treated genomic DNA revealed in vivo G-quadruplex structure affecting the gene expression of ANXA5 that causes obstetric complications. (2015)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Ota S, Nishizawa H, Miyamura H, Nakahira M, Suzuki M et al.
  • 学会等名: The 11th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-05-20
  • 国際学会
• [学会発表] Breakpoint analysis of the recurrent constitutional t(8;22)(q24;q11) translocation (2015)
  • 著者名/発表者名: Kato T, Inagaki H, Mishura D, Ouchi Y, Tsutsumi M, Ohye T et al.
  • 学会等名: The 11th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2015-05-20
  • 国際学会
• [学会発表] Age-related increase of aneuploidy in human oocytes (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H
  • 学会等名: IFFS/JSRM International Meeting 2015
  • 発表場所: Yokohama
  • 年月日: 2015-04-26
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Detection of in vivo G-quadruplex structure of the ANXA5 promoter that contributes to the recurrent pregnancy loss (2014)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Ota S, Miyamura H, Tsutsumi M, Kato T, Nishizawa H, Yanagihara I, Kurahashi H
  • 学会等名: ASHG 2014
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] Two cases of lissencephaly with marked hydrocephalus caused by TUBA1A mutation (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishihara N, Yokoi S, Yamamoto H, Natsume J, Tsutsumi M, Ohye T, Kato M, Saito S, Kurahashi H. Two cases of lissencephaly with marked hydrocephalus caused by TUBA1A mutation
  • 学会等名: ASHG 2014
  • 発表場所: San Diego, CA
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] EFNB1 mutation found in patients with craniofrontonasal syndrome in a Japanese family (2014)
  • 著者名/発表者名: Kato H, Okumoto T, Yoshimura Y, Taguchi Y, Sugimoto M, Inagaki H, Kurahashi H
  • 学会等名: The 10th Asian Pacific Craniofacial Association Conference
  • 発表場所: Adelaide, Australia
  • 年月日: 2014-10-03 – 2014-10-05
• [学会発表] Cytogenetic analysis of monopronucleated (1PN) zygotes after intracytoplasmic sperm injection and conventional in-vitro fertilization (2014)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama S, Kato T, Kani C, Miyazaki J, Nishizawa H, Ochi M, Fujii T, Kurahashi H
  • 学会等名: International Society for Mild Approaches in Assisted Reproduction
  • 発表場所: Sydney, Australia
  • 年月日: 2014-09-10 – 2014-09-12
• [学会発表] Obstetric complication-associated ANXA5 promoter polymorphisms affect gene expression via G-quadruplex structure in vivo (2014)
  • 著者名/発表者名: Inagaki H, Ota S, Nishizawa H, Miyamura H, Nakahira K, Suzuki M, Tsutsumi M, Kato T, Nishiyama S, Udagawa Y, Yanagihara I, Kurahashi H
  • 学会等名: FASEB SRC, Dynamic DNA Structures in Biology
  • 発表場所: Itasca, Illinois
  • 年月日: 2014-07-20 – 2014-07-25
• [学会発表] Age-related decrease of meiotic cohesins in human oocytes (2014)
  • 著者名/発表者名: Kurahashi H, Tsutsumi M, Fujiwara R, Nishizawa H, Kogo H, Inagaki H, Ohye T, Kato T, Fujii T
  • 学会等名: Eshre 2014
  • 発表場所: Munich, Germany
  • 年月日: 2014-06-29 – 2014-07-02
• [図書] Clinical Genomics: Practical Applications in Adult Patient Care (2014)
  • 著者名/発表者名: Nisizawa H, Kurahashi H
  • 総ページ数: 928
  • 出版者: McGraw-Hill Professional
• [備考] 藤田保健衛生大学・総合医科学研究所・分子遺伝学研究部門
  • URL: http://www.fujita-hu.ac.jp/~genome/mg/
• [備考] 藤田保健衛生大学・総合医科学研究所
  • URL: http://www.fujita-hu.ac.jp/ICMS/
• [備考] 藤田保健衛生大学・疾患遺伝子網羅的解析センター
  • URL: http://www.fujita-hu.ac.jp/~gtac/
• [備考] t(11;22)
  • URL: http://www.fujita-hu.ac.jp/~genome/11&22/