卓上型次世代シーケンサーを用いた AMLの迅速かつ安価な予後予測システムの開発

• 研究課題/領域番号: 26670277
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 足立 壯一 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10273450)
• 研究分担者: 嶋田 明 岡山大学, 医学研究科, 講師 (70391836)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2014年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
• キーワード: 次世代シークエンサー / 予後因子 / AML / 遺伝子検査学

研究成果の概要

質の高い臨床研究は、多数の遺伝子解析が必須であり、迅速かつ安価な遺伝子解析法の開発が急務である。本研究では、小児急性骨髄性白血病（AML）の予後に関連性の高い遺伝子を選別し、卓上型次世代シーケンサーを用いて、予後予測パネルの作成を行った。小児AMLの初発、寛解、再発検体よりDNAを抽出し、Agilent社のHaloplex カスタマイズドパネルを用い、約150遺伝子を選定した。８例を解析し、４例からIKZF, KRAS, GATA1, KIT, PU.1の遺伝子異常が検出され、残りの４例からもSH2B3, SMARCB2のlarge deletionが検出された。今後、多数例で解析を行う。

研究成果

• [雑誌論文] Adverse Prognostic Impact of KIT Mutations in Childhood CBF-AML: the Results of the Japanese Pediatric Leukemia/Lymphoma Study Group AML-05 Trial. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tokumasu M, Murata C, Shimada A, Ohki K, Hayashi Y, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Nagao M, Itoh H, Kamikubo Y, Nakayama H, Kinoshita A, Tomizawa D, Taga1 T, Tawa A, Tanaka S, Heike T,and Adachi S
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 未定
  • 査読あり
• [雑誌論文] High expression of EVI1 and MEL1 is a compelling poor prognostic marker of pediatric AML. (2015)
  • 著者名/発表者名: Jo A, Mitani S, Shiba N, Hayashi Y, Hara Y, Takahashi H, Tsukimoto I, Tawa A, Horibe K, Tomizawa D, Taga T, Adachi S, Yoshida T, Ichikawa H
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 29 号: 5 ページ: 1067-1083
  • DOI: 10.1038/leu.2015.5
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] EVI1 overexpression is a poor prognostic factor in pediatric patients with mixed lineage leukemia-AF9 rearranged acute myeloid leukemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Kajihara M, Tomizawa D, Watanabe T, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Kodama K, Tokumasu M, Itoh H, Nakayama H, Kinoshita A, Taga T, Tawa A, Taki T, Shiba N, Ohki K, Hayashi Y, Yamashita Y, Shimada A, Tanaka S, Adachi S.
  • 雑誌名: Haematologica 巻: 99 号: 11 ページ: 225-227
  • DOI: 10.3324/haematol.2014.107128
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Outcome of children with relapsed acute myeloid leukemia following initial therapy under the AML99 protocol (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakayama H, Tabuchi K, Tawa A, Tsukimoto I, Tsuchida M, Morimoto A, Yabe H, Horibe K, Hanada R, Imaizumi M, Hayashi Y, Hamamoto K, Kobayashi R, Kudo K, Shimada A, Miyamura T, Moritake H, Tomizawa D, Taga T, Adachi S.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 100(2) 号: 2 ページ: 171-9
  • DOI: 10.1007/s12185-014-1616-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Prognostic implications of CEBPA mutations in pediatric acute myeloid leukemia: a report from the Japanese Pediatric Leukemia/Lymphoma Study Group. (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsuo H, Kajihara M, Tomizawa D, Watanabe T, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Kodama K, Tokumasu M, Itoh H, Nakayama H, Kinoshita A, Taga T, Tawa A, Taki T, Tanaka S, Adachi S.
  • 雑誌名: Blood Cancer J 巻: 4 号: 7 ページ: e226-e226
  • DOI: 10.1038/bcj.2014.47
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Poor prognosis associated with FAB subtypes M4 and M5 in Japanese pediatric acute myeloid leukemia patients with FLT3-ITD. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hara Y, Shiba N, Ohki K, Park M-J, Shimada A, Tomizawa D, Saito AM, Fujimoto J, Taki T, Kinoshita A, Taga T, Arakawa H, Tawa A, Horibe K, Adachi S, Hayashi Y.
  • 学会等名: 56th Annual Meeting of the American Society of Hematology
  • 発表場所: San Francisco
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-09
• [学会発表] Clinical features of patients with ASXL1 and ASXL2 mutations in pediatric acute myeloid leukemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamato G, Shiba N, Yoshida K, Ohki K, Park M-J, Hara Y, Tomizawa D, Sotomatsu M, Taga T, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y.
  • 学会等名: 56th Annual Meeting of the American Society of Hematology
  • 発表場所: San Francisco
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-09
• [学会発表] Pediatric acute megakaryoblastic leukemia without Down syndrome: a retrospective study by the International Berlin-Frankfurt-Munster Study Group (I-BFMSG). (2014)
  • 著者名/発表者名: Inaba H, Zhou Y, Abla O, Adachi S, Auvrignon A, Beverloo HB, de Bont E, Chang T-T, Creutzig U, Dastugue N, Dworzak M, Elitzur S, Fynn A, Forestier E, Hasle H, Liang D-C, Lee V, Locatelli F, Masetti R, De Moerloose B, Reinhardt D, Rodriguez L, Shen S, Taga T, Tomizawa D, Yeoh AEJ, Zimmermann M, Raimondi SC.
  • 学会等名: 56th Annual Meeting of the American Society of Hematology
  • 発表場所: San Francisco
  • 年月日: 2014-12-06 – 2014-12-09
• [学会発表] Pediatric AML with FLT3-ITD/WT, NUP98-NSD1, NPM1, and WT1 mutations affected the clinical outcome. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shimada A, Yamashita Y, Tomizawa D, Shiba N, Tawa A, Watanabe T, Yokozawa T, Kudo K, Taga T, Iwamoto S, Terui K, Moritake H, Kinoshita A, Takahashi H, Nakayama H, Koh K, Goto H, Kosaka Y, Saito AM, Fujimoto J, Horibe K, Hara Y, Oki K, Hayashi Y, Adachi S.
  • 学会等名: 第76回日本血液学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2014-10-31 – 2014-11-02
• [学会発表] The prognostic impact of high EVI1-related genes expression in pediatric acute myeloid leukemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Shiba N, Hara Y, Ohki K, Yamato G, Park M-J, Kobayashi T, Ichikawa H, Tomizawa D, Taki T, Shimada A, Sotomatsu M, Arakawa H, Horibe K, Adachi S, Tawa A, Hayashi Y.
  • 学会等名: 第76回日本血液学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2014-10-31 – 2014-11-02