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in vivo RNA Imaging Toward Mapping the Dynamics of Gene Expression in the Plastic Brain

研究課題

研究課題/領域番号 26702038
研究種目

若手研究(A)

配分区分一部基金
研究分野 基盤・社会脳科学
研究機関京都大学

研究代表者

王 丹  京都大学, 高等研究院, 特定拠点准教授 (50615482)

研究協力者 大本 育実  
松尾 直毅  
岡本 晃充  
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
23,270千円 (直接経費: 17,900千円、間接経費: 5,370千円)
2016年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2015年度: 6,890千円 (直接経費: 5,300千円、間接経費: 1,590千円)
2014年度: 9,230千円 (直接経費: 7,100千円、間接経費: 2,130千円)
キーワードRNA imaging / synapse / neurodevelopment / RNA dynamics / motor cortex / virtual reality / spatial regulation / simulation / mathematical models / in vivo / real-time / spatiotemporal / mechanism / RNA methylation / RNA / foci dynamics / transcription
研究成果の概要

本支援では in vivo RNAイメージングで長期記憶形成の分子基盤を明らかにすることを目標にした。その成果として本来不可能であった計測イメージング技術に消光型プローブの導入によって、RNA分子のダイナミクスを生体内の1細胞レベルで観察しまた多細胞での同時計測をする技術が可能になった(NAR,2015)。さらに、神経細胞における転写因子が産物がマイクロRNAに抑制されないための細胞メカニズムを果たす分子経路の存在を明らにした(Front Mol. Neurosci, 2017)。シナプス形成と機能を制御する新しい転写後制御層を開拓した(Nat Neurosci, in press)。

報告書

(5件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (47件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 2件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 3件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (34件) (うち国際学会 15件、 招待講演 17件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [国際共同研究] The University of New Castle(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [雑誌論文] Transport Granules Bound with Nuclear Cap Binding Protein and Exon Junction Complex Are Associated with Microtubules and Spatially Separated from eIF4E Granules and P Bodies in Human Neuronal Processes2017

    • 著者名/発表者名
      Wang DO, Ninomiya K, Mori C, Koyama A, Haan M, Kitabatake M, Hagiwara M, Chida K, Takahashi SI,Ohno M, Kataoka N
    • 雑誌名

      frontiers in Molecular Biosciences

      巻: 4 ページ: 1-12

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] miRNA Enriched in Human Neuroblast Nuclei Bind the MAZ Transcription Factor and Their Precursors Contain the MAZ Consensus Motif2017

    • 著者名/発表者名
      Belinda J. Goldie, Chantel Fitzsimmons, Judith Weidenhofer, Joshua R. Atkins, Dan O. Wang, and Murray J. Cairns
    • 雑誌名

      frontiers in Molecular Neuroscience

      巻: 10 ページ: 1-13

    • NAID

      120006936396

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A modified single-cell electroporation method for molecule delivery into a motile protist, Euglena gracilis.2016

    • 著者名/発表者名
      Ohmachi M, Fujiwara Y, Muramatsu S, Yamada K, Iwata O, Suzuki K, Wang DO.
    • 雑誌名

      J Microbiol Methods.

      巻: 130 ページ: 106-111

    • DOI

      10.1016/j.mimet.2016.08.018

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ECHO-liveFISH: in vivo RNA Labeling Reveals Dynamic Regulation of Nuclear RNA Foci in Living Tissues2015

    • 著者名/発表者名
      Oomoto I, Hirano-Suzuki A, Umeshima H, Han YW, Yanagisawa H, Carlton P, Harada Y, Kengaku M, Okamoto A, Shimogori T, and Wang DO.
    • 雑誌名

      Nucl Acids. Res

      巻: 43

    • NAID

      120005619785

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Hybridization-sensitive fluorescent oligonucleotide probe conjugated with a bulky module for compartment-specific mRNA monitoring in a living cell2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi G, Yanase M, Takeda K, Sakakibara D, Sakamoto R, Wang DO, Okamoto A
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 26 号: 3 ページ: 412-417

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.5b00090

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書 2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Live-cell Imaging of Endogenous mRNAs with a Small Molecule2015

    • 著者名/発表者名
      Sato, S.*, Watanabe, M., Katsuda, Y., Murata, A., Wang, D. O., Uesugi M.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 54 号: 6 ページ: 1855-1858

    • DOI

      10.1002/anie.201410339

    • NAID

      120005619801

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualization of nucleic acids with synthetic exciton-controlled fluorescent oligonucleotide probes.2015

    • 著者名/発表者名
      Wang DO, Okamoto A
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: 1262 ページ: 69-87

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-2253-6_5

    • ISBN
      9781493922529, 9781493922536
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Plasma membrane translocation of a protein needle based on a triple-stranded β-helix motif.2014

    • 著者名/発表者名
      Sanghamitra. NJM, Inaba H, Arisaka F, Wang DO, Kanamaru S, Kitagawa S and Ueno T
    • 雑誌名

      Mol. BioSyst

      巻: 10 号: 10 ページ: 2677-2683

    • DOI

      10.1039/c4mb00293h

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and dynamic RNA imaging in neurodevelopmentle and neuropsychiatric diseases.2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      第40回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic Epitranscriptomics and Dynamic RNA Imaging in neurodevelopmentle and neuropsychiatric diseases.2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      兵庫県立大学国際シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and dynamic RNA imaging in neurodevelopmentle and neuropsychiatric diseases.2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      留日中国人生命科学協会2017年度学術大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生きた脳組織にRNA計測イメージングの開発2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      アステラス病態代謝研究会第48回研究報告会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] in vivo RNA labelling reveals dynamic regulation of ribonucleic foci in living neurons2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synaptic m6A Epitranscriptome Reveals Functional Partitioning of Localized Transcripts for Dynamic Tripartite Synapse Modulation.2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      第19回日本RNA学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synaptic Epitranscriptomics and Dynamic RNA Imaging2017

    • 著者名/発表者名
      王丹
    • 学会等名
      International Symposium on Imaging Frontier(ISIF 2017)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and RNA imaging2016

    • 著者名/発表者名
      Dan Ohtan Wang
    • 学会等名
      The 53th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      筑波
    • 年月日
      2016-11-25
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and RNA imaging2016

    • 著者名/発表者名
      Dan Ohtan Wang
    • 学会等名
      Asian Pacific Society Neuroscience Annual Meeting 2016
    • 発表場所
      Kuala Lumpur
    • 年月日
      2016-08-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and dynamic RNA imaging2016

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Development and Functions of Brain Circuit: From Molecules to Behaviour
    • 発表場所
      National Brain Research Center(India・Manesar)
    • 年月日
      2016-03-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and dynamic RNA imaging2016

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Seminar at Bordeaux neurocampus
    • 発表場所
      Bordeaux neurocampus(France・Bordeaux)
    • 年月日
      2016-03-21
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Synaptic epitranscriptomics and dynamic RNA imaging2016

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Seminar at European Molecular Biology Laboratory
    • 発表場所
      European Molecular Biology Laboratory(Germany・Heidelberg)
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A m6A epitranscriptome at mouse synapse2016

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      International Symposium for RIKEN Epigenetics Program 2016
    • 発表場所
      理化学研究所(埼玉県・和光市)
    • 年月日
      2016-02-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Real-time Imaging and Simulation Reveal Important Operating Factors for mRNP Spatial Regulation2016

    • 著者名/発表者名
      Ikumi Oomoto, Daniel Packwood, Dan Ohtan Wang
    • 学会等名
      The 21th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      京都国際会館
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Activity-dependent dynamics of mRNA expression and m6A methylation in human neuronal cells2016

    • 著者名/発表者名
      Belinda Goldie, Youqi Liao, Takayuki Ohara, Dan Ohtan Wang
    • 学会等名
      The 21th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      京都国際会館
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Toward effective detection of activity-triggered changes in gene expression in a living brain2016

    • 著者名/発表者名
      Ikumi Oomoto, Dan Ohtan Wang
    • 学会等名
      第89回日本生化学大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: towards "lightning up" gene expression upon learning and memory2015

    • 著者名/発表者名
      大本育実
    • 学会等名
      多様性から明らかにする記憶ダイナミズムの共通原理
    • 発表場所
      京都ガーデンパレス(京都府・京都市)
    • 年月日
      2015-11-04
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Fluorescent labeling and imaging RNA in living tissues2015

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Paris Symposium on Integrated Cell-Material Science
    • 発表場所
      Institute Pierre-Gilles de Gennes(France・Paris)
    • 年月日
      2015-10-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Real-time Imaging and Mathematical Simulation Reveal Important Operating Factors for RNP Spatial Regulation Dynamics2015

    • 著者名/発表者名
      大本育実
    • 学会等名
      Hierarchical Dynamics in Soft Materials and Biological Matter
    • 発表場所
      京都大学(京都府・京都市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo RNA Labeling Reveals Dynamic Regulation of Nuclear RNA Foci in Living Tissues2015

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Hierarchical Dynamics in Soft Materials and Biological Matter
    • 発表場所
      京都大学(京都府・京都市)
    • 年月日
      2015-09-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Imaging RNA in Living Neural Circuits with Hybridization-sensitive Fluorescent Probes2015

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      Symposium on Development and Disease
    • 発表場所
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2015-08-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マウス成体脳シナプスにおけるm6A-RNAのトランスクリプトーム解析2015

    • 著者名/発表者名
      Liao Youqi
    • 学会等名
      第17回日本RNA学会
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] イメージングとシミュレーションから明らかにするRNPの出現・消失の空間作動原理2015

    • 著者名/発表者名
      大本育実
    • 学会等名
      第17回日本RNA学会
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo Labeling of RNA Reveals Dynamic Regulation of ribonuclear Foci in Living Tissues2014

    • 著者名/発表者名
      大本 育実
    • 学会等名
      The 4D Nucleome 2014
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-12-17 – 2014-12-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムが導く明日の自分2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      第4回WPI合同シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-12-13
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] To "Light-up" Gene Expression in the Brain2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      The 8th International Symposium on NanoBiotechnology
    • 発表場所
      北京
    • 年月日
      2014-10-20 – 2014-10-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 神経可塑性におけるmRNAのシナプス局在及び発現制御2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      第36回日本生物学的精神医学会 第57回日本神経化学会大会
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2014-09-29 – 2014-10-01
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒト神経細胞内における翻訳休止状態の mRNA 輸送複合体2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      第16回日本RNA学会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-07-24 – 2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo Labeling of RNA Reveals Dynamic Regulation of Ribonuclear Foci in Living Tissues2014

    • 著者名/発表者名
      大本 育実
    • 学会等名
      第16回日本RNA学会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2014-07-24 – 2014-07-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo Labeling of RNA Reveals Dynamic Regulation of ribonuclear Foci in Living Tissues2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      The 37th Naito Conference "Bioimaging-a paradigm shift for the life sciences"
    • 発表場所
      ニセコ
    • 年月日
      2014-07-15 – 2014-07-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic Spatial Organization of RNA in Living Cells2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      IGM RNA Biofunction Seminar
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-07-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo Labeling of RNA Reveals Dynamic Regulation of ribonuclear Foci in Living Tissues2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      2014 FASEB Science Research Conference
    • 発表場所
      アメリカ モンタナ州
    • 年月日
      2014-07-06 – 2014-07-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ECHO-liveFISH: in vivo Labeling of RNA Reveals Dynamic Regulation of ribonuclear Foci in Living Tissues2014

    • 著者名/発表者名
      LIAO Youqi
    • 学会等名
      Gordon Research Seminar "Morecular & Cellular Neurobiology"
    • 発表場所
      香港
    • 年月日
      2014-06-28 – 2014-06-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Cellular environment-dependent RNA methylation at synapse during learning and memory2014

    • 著者名/発表者名
      王 丹
    • 学会等名
      多様性から明らかにする記憶ダイナミズムの共通原理
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-06-16 – 2014-06-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] RNA Detection2017

    • 著者名/発表者名
      Wang, Dan Ohtan
    • 総ページ数
      489
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781493972135
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [備考] 王丹助教、生きたマウス脳内の細胞内RNA活動の可視化に成功

    • URL

      http://www.icems.kyoto-u.ac.jp/j/pr/2015/06/29-nr.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.icems.kyoto-u.ac.jp/j/pr/2015/06/29-nr.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.ohtan.icems.kyoto-u.ac.jp/?page_id=10

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2019-03-29  

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