がん浸潤リンパ球の抗原受容体次世代シーケンス～がん免疫システムの包括的理解～

• 研究課題/領域番号: 26710009
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 腫瘍治療学
• 研究機関: 東京医科歯科大学
• 研究代表者: 加藤 洋人 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教 (60446549)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 24,050千円 (直接経費: 18,500千円、間接経費: 5,550千円); 2016年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円); 2015年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円); 2014年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
• キーワード: 免疫ゲノム / ゲノム解析 / 腫瘍免疫 / 抗原受容体シーケンス

研究成果の概要

本研究の目的は、次世代シーケンスによってがん浸潤リンパ球の抗原受容体レパートリを網羅的に解読し、ゲノミクス的観点から腫瘍免疫の全体像を解明することであった。さらに、がん組織特異的に存在する抗原受容体配列を基盤として、新規抗がん抗体の開発を試みるなど、新しいがん治療戦略の基盤を作ることをも目的とした。以下の成果が得られた。
(1) 臨床がん症例の抗原受容体次世代シーケンス・プロトコールが樹立された。(2) がん組織中にドミナントに存在するT細胞受容体や免疫グロブリンを多数同定できた。(3) 人工発現系を用いて再構築したがん特異的免疫グロブリン分子について機能的スクリーニングを進めることができた。

研究成果

• [雑誌論文] Genomic pathobiology of gastric carcinoma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Katoh H, Ishikawa S.
  • 雑誌名: Pathol Int. 巻: 67 号: 2 ページ: 63-63
  • DOI: 10.1111/pin.12493
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 胃がん領域のゲノム病理学の進歩とゲノム個別化がん治療 (2016)
  • 著者名/発表者名: 加藤洋人、石川俊平
  • 雑誌名: 血液内科 巻: 72(4) ページ: 544-549
  • NAID: 40020854823
• [学会発表] Prediction of Antigen-Specific Immunoglobulins from Amino Acid Sequences using Semi-Supervised Deep Learning. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Konishi, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Ken Tominaga, Ryohei Suzuki, Shumpei Ishikawa.
  • 学会等名: 15th European Conference on Computational Biology
  • 発表場所: Hague, Netherlands
  • 年月日: 2016-09-03
  • 国際学会
• [学会発表] Immunogenetic Characterization of Tumor Infiltrating TCR Repertoire in the Gastric Carcinoma Environments Using Archived Histopathological Specimens. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiroto Katoh, Daisuke Komura, Hiroki Konishi, Ryohei Suzuki, Asami Yamamoto, Reiko Sato, Masashi Fukayama, Hiroyuki Aburatani, Shumpei Ishikawa.
  • 学会等名: AIRR 2016 Community Meeting
  • 発表場所: Rockville, MD, USA
  • 年月日: 2016-06-27
  • 国際学会
• [学会発表] Immunogenomic Characterization of Tumor Infiltrating TCR Repertoire in the Gastric Carcinoma Enviroments using Archived Histopathological Specimens (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Katoh, D. Komura, H. Konishi, A. Yamamoto, M. Fukayama, S. Ishikawa
  • 学会等名: 3rd Annual immungenomics 2015 Shaping the Future of Human Health
  • 発表場所: Huntsville, Alabama, USA
  • 年月日: 2015-09-28
  • 国際学会
• [学会発表] IMMUNOGENETIC PROFILING OF TUMOR INFILTRATING T CELLS AMONG HUMAN GASTRIC CANCER (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Katoh, D. Komura, H. Konishi, A. Yamamoto, M. Fukayama, S. Ishikawa
  • 学会等名: IMMUNE PROFILING IN HEALTH AND DISEASE
  • 発表場所: Seattle, Washington, USA
  • 年月日: 2015-09-09
  • 国際学会