小分子RNAに誘導されるエピゲノム変化の生化学的解析

• 研究課題/領域番号: 26710011
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: ゲノム生物学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 山中 総一郎 慶應義塾大学, 医学部, 助教 (80711845)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 24,050千円 (直接経費: 18,500千円、間接経費: 5,550千円); 2016年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円); 2015年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円); 2014年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
• キーワード: 小分子RNA / トランスポゾン / 生殖細胞 / ATAC-seq / ゲノム / CRISPR/Cas9 / リピート配列 / クロマチン / ヘテロクロマチン / piRNA / エピジェネティクス / 遺伝子発現制御

研究成果の概要

トランスポゾンとその残滓は、ヒトゲノムでは 45%もの領域を占めている。トランスポゾンの持つ転移能は個体に有害であり、特に生殖細胞におけるトランスポゾンの発現抑制は次世代への正確な遺伝情報の伝達を考えた場合に、生物にとって喫緊の課題である。私は小分子RNAがトランスポゾンの発現を生殖細胞でいかに抑制しているかに関して研究をハエとマウスを用いて行ってきた。ハエにおいては、特定ゲノム領域に存在するタンパク質群を網羅的に同定する手法を開発してきた。また、マウスにおいては精巣中に含まれる少量の生殖細胞からクロマチン状態をプロファイルし、その様態を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Misprocessed tRNA response targets piRNA clusters (2015)
  • 著者名/発表者名: Soichiro Yamanaka, Haruhiko Siomi
  • 雑誌名: EMBO J 巻: 34 号: 24 ページ: 2988-9
  • DOI: 10.15252/embj.201593322
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] piRNA clusters and open chromatin structure. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yamanaka, S., Siomi, MC. and Siomi, H.
  • 雑誌名: Mobile DNA 巻: 5 号: 1 ページ: 22-22
  • DOI: 10.1186/1759-8753-5-22
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] Developing a novel method to identify chromatin components at transposons using CRISPR/Cas9 system (2016)
  • 著者名/発表者名: Soichiro Yamanaka, Ten Li, Takeshi Kawamura, Tatsuhiko Kodama, Haruhiko Siomi
  • 学会等名: 国際RNA学会
  • 発表場所: 京都、国際会議場
  • 年月日: 2016-06-28
  • 国際学会
• [学会発表] Developing a novel method to identify chromatin components at transposons using CRISPR/Cas9 system (2016)
  • 著者名/発表者名: Soichiro Yamanaka, Ten Li, Takeshi Kawamura, Tatsuhiko Kodama, Haruhiko Siomi
  • 学会等名: RNA2016 Meeting
  • 発表場所: 国立京都国際会館(京都府京都市)
  • 年月日: 2016-06-28
  • 国際学会
• [図書] 細胞工学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山中総一郎、塩見春彦
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: 学研メディカル秀潤社
• [図書] 実験医学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山中総一郎
  • 総ページ数: 2
  • 出版者: 羊土社
• [備考] 慶應義塾大学 医学部 分子生物学教室 ホームページ
  • URL: http://siomilab.med.keio.ac.jp