Nested Association Mappingによるイネ多収遺伝子の単離

• 研究課題/領域番号: 26712002
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 遺伝育種科学
• 研究機関: 公益財団法人岩手生物工学研究センター
• 研究代表者: 阿部 陽 公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主任研究員 (80503606)
• 研究協力者: 高木 宏樹 ; 宇津志 博恵 ; 八重樫 弘樹
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 24,310千円 (直接経費: 18,700千円、間接経費: 5,610千円); 2016年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円); 2015年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円); 2014年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
• キーワード: イネ / GWAS / NAM / 多収性 / 葉身形態 / QTL / 育種学 / 遺伝学 / アソシエーション解析 / ゲノム

研究成果の概要

東北地域の主要品種「ひとめぼれ」を共通親とし、世界の多様な遺伝資源を交配し、20組合せ計3,021 RILs (F7-F9世代）を育成した。これらは遺伝的に固定しており、全ゲノムシーケンスから得た高密度のSNPsでgenotypingされたイネNested Association Mapping集団として確立している。このイネNAM集団は、農業形質に関与する重要遺伝子領域の高精度同定を可能とする遺伝資源として有用性が高いと考える。イネ多収性に関連する形質として止葉葉身のサイズ及びSPAD値のQTLを複数同定した。

研究成果

• [雑誌論文] 次世代シークエンサーを活用した全ゲノム解析によるイネ育種 (2016)
  • 著者名/発表者名: Akira Abe, Hiroki Takagi, Satoshi Natsume, Hiroki Yaegashi, Hideko Kikuchi, Kentaro Yoshida, Shunichi Kosugi, Hiromasa Saitoh, Naoya Urasaki, Hideo Matsumura, Hiroyuki Kanzaki, and Ryohei Terauchi
  • 雑誌名: 生化学 巻: 88 号: 1 ページ: 44-53
  • DOI: 10.14952/SEIKAGAKU.2016.880044
  • ISSN: 0037-1017
  • 年月日: 2016-02-25
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Potato research achievement and challenges (2015)
  • 著者名/発表者名: Utsushi, H., Abe, A., Tamiru, M., Ogasawara, Y., Obara, T., Sato, E., Ochiai, Y., Terauchi, R. and Takagi, H.
  • 雑誌名: Ｂｒｅｅｄｉｎｇ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 65 号: 1 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1270/jsbbs.65.1
  • NAID: 130005066138
  • ISSN: 1344-7610, 1347-3735
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [学会発表] イネ Nested Association Mapping 集団による農業形質の遺伝解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 阿部陽, 高木宏樹, 八重樫弘樹, 植村亜衣子, 及川香梨, 宇津志博恵, 菊池秀子, 小笠原由美子, 清水元樹, 寺内良平
  • 学会等名: 日本育種学会第130回講演会
  • 発表場所: 鳥取大学
  • 年月日: 2016-10-07
• [学会発表] イネ組換え近交系200系統の全ゲノムシーケンス情報を用いた高密度ジェノタイピング (2015)
  • 著者名/発表者名: 及川香梨、植村亜衣子、八重樫弘樹、菊池秀子、阿部陽、寺内良平、高木宏樹
  • 学会等名: 日本育種学会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 2015-09-11
• [学会発表] 岩手県における水稲ゲノム育種の取り組み (2014)
  • 著者名/発表者名: 阿部陽
  • 学会等名: 第9回東北育種研究集会
  • 発表場所: 岩手大学
  • 年月日: 2014-11-15
  • 招待講演