| 研究課題/領域番号 |
26712003
|
|---|
| 研究種目 |
若手研究(A)
|
| 配分区分 | 一部基金 |
|---|
| 研究分野 |
作物生産科学
|
|---|
| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 |
|---|
研究代表者 |
持田 恵一 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー (90387960)
|
|---|
| 研究協力者 |
櫻井 哲也 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, ユニットリーダー (90415167)
山口 由紀子 (上原 由紀子) 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, テクニカルスタッフ
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
|
| 配分額 *注記 |
22,490千円 (直接経費: 17,300千円、間接経費: 5,190千円)
2016年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円)
2015年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
2014年度: 8,970千円 (直接経費: 6,900千円、間接経費: 2,070千円)
|
|---|
| キーワード | コムギ / 異質倍数性 / トランスクリプトーム / 同祖遺伝子 / 倍数性進化 / 農林水産物 / ゲノム |
|---|
| 研究成果の概要 |
パンコムギを構成するA, B, Dゲノムのそれぞれに座上する同祖遺伝子のゲノム別の発現変動を網羅的に調べるために、公開されている700以上のRNA-seqデータを基に、同祖遺伝子毎の共発現遺伝子ネットワークを作成した。また、パンコムギの成立に伴うゲノムの異質倍数化の過程で、ゲノム機能にどのような変化が生じているかを調べるために、Aゲノム祖先種(AA)、４倍体コムギ(AABB)、パンコムギ(AABBDD)の各系統を用いて、比較トランスクリプトーム解析を行い、温度環境に応答するトランスクリプトームの変化とゲノム倍数化の関連を明らかにした。
|
