空間情報の処理を担う神経ネットワークの動作原理の解明

• 研究課題/領域番号: 26830006
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 神経生理学・神経科学一般
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 豊島 有 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (10632341)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2019-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2018年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2017年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2016年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2015年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
• キーワード: システム生物学 / モデル化とシミュレーション / ライブイメージング / 神経情報処理 / 線虫

研究成果の概要

線虫は特定の塩濃度の領域へ向かう際、進行方向および垂直方向の塩濃度勾配に対して、異なる行動戦略を用いている。神経回路上では塩濃度勾配の方向の情報が時間的に多重にコードされており、こうした空間情報を分離・抽出する神経回路機構を明らかにすることを目指した。
神経活動を正確に測定するため最新のCa2+プローブを導入した。塩刺激を受容する感覚神経及び一次介在神経は、垂直方向の信号と同程度の早い周期に対して応答できることが確認できた。より多数の神経を同時に観察できるよう、4Dイメージング観察技術の整備を進めた。また線虫の走性行動について、測定した神経活動に基づいた数理モデル化に取り組んだ。

研究成果の学術的意義や社会的意義

<1. カルシウムイメージングによる神経細胞の活性測定>によって、線虫の神経活動を正確に測定するための枠組みを確立することができた。また全脳の神経活動を測定する技術を開発して、自発活動の影響を明らかにすることができた。観察された神経活動を個体間で比較したり、神経回路の視点で解釈するための技術の開発も進んでいる。また<2. 実験データに基づいた数理モデルの作成>によって、実験データに基づいた数理モデル化の枠組みを確立することができた。とくに神経活動を正確にモデル化することで、環境―神経回路―行動という多階層システムの包括的な解析が可能になった。

研究成果

• [国際共同研究] Medical Research Council(United Kingdom)
• [国際共同研究] The MRC Laboratory of Molecular Biology(United Kingdom)
• [雑誌論文] 増大特集 細胞多様性解明に資する光技術─見て,動かす Ⅲ.見えたものを理解する 線虫の4Dイメージング画像処理 (2017)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有
  • 雑誌名: 生体の科学 巻: 68 号: 5 ページ: 474-475
  • DOI: 10.11477/mf.2425200701
  • ISSN: 0370-9531, 1883-5503
  • 年月日: 2017-10-15
• [雑誌論文] SPF-CellTracker: Tracking multiple cells with strongly-correlated moves using a spatial particle filter (2017)
  • 著者名/発表者名: Hirose Osamu、Kawaguchi Shotaro、Tokunaga Terumasa、Toyoshima Yu、Teramoto Takayuki、Kuge Sayuri、Ishihara Takeshi、Iino Yuichi、Yoshida Ryo
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 巻: - 号: 6 ページ: 1-1
  • DOI: 10.1109/tcbb.2017.2782255
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Modulation of sensory information processing by a neuroglobin inCaenorhabditis elegans (2017)
  • 著者名/発表者名: Oda Shigekazu、Toyoshima Yu、de Bono Mario
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 114 号: 23
  • DOI: 10.1073/pnas.1614596114
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] 生物物理学会における多様性 (2017)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、飯野 雄一
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 57 号: 1 ページ: 001-001
  • DOI: 10.2142/biophys.57.001
  • NAID: 130005296440
  • ISSN: 0582-4052, 1347-4219
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 神経応答のモデリング ～Ca2+イメージングを用いて (2017)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 35 ページ: 875-878
• [雑誌論文] Accurate Automatic Detection of Densely Distributed Cell Nuclei in 3D Space. (2016)
  • 著者名/発表者名: Toyoshima Y, Tokunaga T, Hirose O, Kanamori M, Teramoto T, Jang MS, Kuge S, Ishihara T, Yoshida R, Iino Y.
  • 雑誌名: PLoS Comput Biol. 巻: 12 号: 6 ページ: 1-20
  • DOI: 10.1371/journal.pcbi.1004970
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] Cell identification and whole-brain activity imaging of C. elegans (2019)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: CREST"生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出"第7回領域会議
• [学会発表] 線虫の塩走性行動の包括的理解に向けた全中枢神経活動と行動の高精度同時計測 (2019)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域研究「生物移動情報学」領域会議
• [学会発表] 線虫の塩走性行動の包括的理解に向けた全中枢神経活動と行動の高精度同時計測 (2018)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域研究「生物移動情報学」領域会議
• [学会発表] 自由行動中の生物の機能的全脳計測に適した高精度な細胞追跡手法 (2018)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 研, 滝沢 拓己, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田 亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域「レゾナンスバイオ」班会議
• [学会発表] Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Hirofumi Sato, Suzu Oe, Yuko Murakami, Ken Sato, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: CeNeuro2018
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular and circuit-level analyses reveal the neural mechanisms for the experience-dependent salt chemotaxis in C. elegans. (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Iino, Hirofumi Sato, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Takashi Nagashima, Moon-Sun Jang, Stephen Wu, Manami Kanamori, Llian Mabardi, Shingo Hiroki, Suzu Oe, Yuko Murakami, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: Asia-Pacific C. elegans meeting
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 感覚統合のメカニズム (2018)
  • 著者名/発表者名: 村上 悠子, 大江 紗, 勝目 拓海, 寺本 孝行, 豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, Wu Stephan, Jang Moon Song, 佐藤 博文, 久下 小百合, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 飯野 雄一, 石原 健
  • 学会等名: 第41回日本神経科学大会
• [学会発表] 線虫C. elegansにおける化学物質に対する誘引行動と忌避行動との切り替えの神経回路機構? (2018)
  • 著者名/発表者名: 飯野 雄一, 佐藤 博文, 豊島 有, 大江 紗, ジャン ムンソン, ウ ステファン, 金森 真奈美, 國友 博文, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 石原 健
  • 学会等名: 第41回日本神経科学大会
• [学会発表] 線虫全脳イメージングのための高速三次元蛍光顕微鏡の開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 研, 三上 秀治, 豊島 有, 飯野 雄一, 合田 圭介
  • 学会等名: 第41回日本神経科学大会
• [学会発表] Simultaneous measurement of whole-brain activity and behavior toward comprehensive understanding of salt chemotaxis of C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Ken Sato, Hideharu Mikami, Stephen Wu, Hirofumi Sato, Moon-Sun Jang, Manami Kanamori, Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Keisuke Goda, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: International Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 2018
  • 国際学会
• [学会発表] Simultaneous measurement of whole-brain activity and behavior toward comprehensive understanding of salt chemotaxis of C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Suzu Oe, Yuko Murakami, Yuki Kawahara, Takayuki Teramoto, Yu Toyoshima, Terumasa Tokunaga, Stephan Wu, Osamu Hirose, Jang Moon-Sun, Hirofumi Sato, Hiroki Takizawa, Sayuri Kuge, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Yuichi Iino, Takeshi Ishihara.
  • 学会等名: International Symposium on Systems Science of Bio-Navigation 2018
  • 国際学会
• [学会発表] 線虫の全中枢神経細胞活動データに対する因果性解析II (2018)
  • 著者名/発表者名: 岩崎唯史，佐藤博文，大江紗，久下小百合，寺本孝行，徳永旭将，広瀬修，Stephen Wu, 豊島有， ジャン;ムンソン，吉田亮，飯野雄一，石原健
  • 学会等名: 日本物理学会 2018年秋季大会
• [学会発表] 線虫の味覚忌避学習に関わる神経の同定及び神経機能の解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: Jang MoonSun, 豊島有、國友博文、飯野雄一
  • 学会等名: 日本動物学会第89回札幌大会
• [学会発表] 線虫の頭部全神経のイメージングによる神経回路の動態解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 飯野 雄一, 豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 大江 紗, 村上 悠子, 久下 小百合, 広瀬 修, 徳永 旭将, 寺本 孝行, 岩崎 唯史, 吉田 亮, 石原 健
  • 学会等名: 日本動物学会第89回札幌大会
  • 招待講演
• [学会発表] Bio-image informatics for whole-brain activity imaging of C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Hirofumi Sato, Suzu Oe, Yuko Murakami, Ken Sato, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: 線虫研究の未来を創る会
• [学会発表] 線虫の全脳イメージングとその解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 石原健、豊島有、大江紗、ウー・ステファン、村上悠子、徳永旭将、金森真奈美、岩崎唯史、寺本孝行、ジャン・ムンソン、佐藤博文、吉田亮、飯野雄一
  • 学会等名: 線虫研究の未来を創る会
• [学会発表] Robustness of synaptic pathway and signaling pathway estimated from the whole-brain activity data in C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: 岩崎唯史，佐藤博文，大江紗，久下小百合，寺本孝行，徳永旭将，広瀬修，Stephen Wu, 豊島有， ジャン;ムンソン，吉田亮，飯野雄一，石原健
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会大会
• [学会発表] 塩走性行動中の線虫の全脳活動計測のための技術開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 第3回新学術領域「生物ナビゲーションのシステム科学」若手合宿
• [学会発表] Observation and Analyses of the Dynamics of the Whole Head Nervous System in C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Iino, Yu Toyoshima, Stephen Wu, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Hirofumi Sato, Jang Moon-Sun, Manami Kanamori, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: 日本神経回路学会 第28回全国大会（JNNS2018）
• [学会発表] 線虫の連合学習の記憶に基づく行動スイッチング:中枢神経回路の活動可視化による解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 大江紗, 村上悠子, 川原祐樹, 寺本孝行, 豊島有, 徳永旭将, Stephan Wu, 広瀬修, Jang Moon-Sun, 佐藤博文, 滝沢拓己, 久下小百合, 岩崎唯史, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Mechanisms of taste avoidance learning in the nematode C. elegans (2018)
  • 著者名/発表者名: Moon-Sun Jang, Hirofumi Kunitomo, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Stephen Wu, Suzu Oe, Yuishi Iwasaki, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino
  • 学会等名: The 17th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms of Taste and Olfactory Perception (ISMNTOP2018)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 4Dイメージングデータ内の密集した細胞核を正確に検出・追跡・定量する画像解析手法 (2018)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, Stephen Wu, 佐藤 研, 滝沢 拓己, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田 亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域「レゾナンスバイオ」平成29年度第二回班会議
• [学会発表] 線虫の全脳活動データに対する位相解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 岩崎唯史, 寺本孝行, 大江紗, 徳永旭将, 広瀬修, Stephen Wu, 豊島有, ジャンムンソン, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
  • 学会等名: 日本物理学会 第72回年次大会
  • 発表場所: 大阪大学 豊中キャンパス (大阪府豊中市)
  • 年月日: 2017-03-17
• [学会発表] Neuronal signaling pathways estimated from whole-brain imaging data of C. elegans (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuishi Iwasaki, Takayuki Teramoto,,Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Stephen Wu, Yu Toyoshima, Moon Sun Jang, Ryo Yoshida, Yuichi Iino, Takeshi Ishihara
  • 学会等名: 第19回国際生物物理学大会(IUPAB2017)
  • 国際学会
• [学会発表] Labeling of active neural circuits by the calcium probe CaMPARI (2017)
  • 著者名/発表者名: Keita Mori, Yu Toyoshima, Yuichi Iino
  • 学会等名: 21st International Worm Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Mathematical methods to analyze imaging data in the whole central nervous system: From noise reduction to causality detection (2017)
  • 著者名/発表者名: Y. Iwasaki, T. Teramoto, S. Oe, T. Tokunaga, O. Hirose, S. Wu, Y. Toyoshima, M. S. Jang, R. Yoshida, Y. Iino, T. Ishihara
  • 学会等名: 21st International Worm Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Identification of neurons and analysis of the neural circuit involved in the learned salt-avoidance behavior in C. elegans (2017)
  • 著者名/発表者名: Moon-Sun Jang, Yu Toyoshima, Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino
  • 学会等名: 21st International Worm Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Analyses of the mechanisms of information processing controlling behavior by whole-brain imaging in C. elegans. (2017)
  • 著者名/発表者名: Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Sayuri Kuge, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara.
  • 学会等名: 21st International Worm Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] Whole neural network analysis of C. elegans using an automated image processing pipeline (2017)
  • 著者名/発表者名: Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
  • 学会等名: 4th International Workshop on Quantitative Biology
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 機能的全脳イメージングに必要な要素技術について (2017)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, Stephen Wu, 滝沢 拓己, 佐藤 研, 徳永 旭将, 広瀬 修, 金森 真奈美, 佐藤 博文, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 三上 秀治, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域「レゾナンスバイオ」平成29年度班会議
• [学会発表] 線虫の塩走性行動の包括的理解に向けた全中枢神経活動と行動の高精度同時計測 (2017)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 佐藤 研, 三上 秀治, Stephen Wu, 佐藤 博文, Jang Moon-Sun, 金森 真奈美, 滝沢 拓己, 大江 紗, 寺本 孝行, 徳永 旭将, 広瀬 修, 合田 圭介, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 新学術領域研究「生物移動情報学」領域会議
• [学会発表] Bio-image informatics for whole brain activity imaging of C. elegans (2017)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Stephen Wu, Hiroki Takizawa, Ken Sato, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Sayuri Kuge, Hideharu Mikami, Keisuke Goda, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: CREST symposium [COMPUTATIONAL PRNCIPLES OF THE NERVOUS SYSTEM]
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Bio-image informatics for whole brain activity imaging (2017)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Stephen Wu, Hiroki Takizawa, Ken Sato, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Sayuri Kuge, Hideharu Mikami, Keisuke Goda, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: 新学術領域「レゾナンスバイオ」若手の会 Joint Young Researchers' Meeting at Academia Sinica
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 線虫の全脳イメージングによる行動を制御する情報処理機構の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 大江紗, 勝目拓海, 寺本孝行, 豊島有, 徳永旭将, Wu Stephan, 広瀬修, Moon-Sun Jang, 佐藤博文, 滝沢拓己, 久下小百合, 岩崎唯史, 吉田亮, 飯野 雄一, 石原 健
  • 学会等名: 第40回日本神経科学大会
• [学会発表] 線虫の全中枢神経イメージングによる神経活動と感覚運動情報との関連解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 飯野雄一, 豊島有, 寺本孝行, Wu Stephen, Moon-Sun Jang, 滝沢拓己, 徳永旭将, 佐藤博文, 広瀬修, 大江紗, 久下小百合, 岩崎唯史, 吉田亮, 石原健
  • 学会等名: 第40回日本神経科学大会
• [学会発表] 線虫の塩忌避学習による行動変化に関与する神経の同定及び神経回路の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: ジャン ムン ソン, 豊島有, 國友博文, 飯野雄一
  • 学会等名: 第40回日本神経科学大会
• [学会発表] 神経グロビンによる知覚変化の情報処理機構 (2017)
  • 著者名/発表者名: 小田 茂和, 豊島 有, デゥボノ マリオ
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会大会
• [学会発表] 線虫のwhole-brainイメージングデータに関する因果性解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuishi Iwasaki, Takayuki Teramoto,,Suzu Oe, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Stephen Wu, Yu Toyoshima, Moon Sun Jang, Ryo Yoshida, Yuichi Iino, Takeshi Ishihara
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会大会
• [学会発表] How taste preference is modulated in the nematode (2017)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Iino, Takashi Nagasima, Hirofumi Sato, Jang Moon-Sun, Suzu Oe), Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Stephen Wu, Ryo Yoshida, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara
  • 学会等名: The 16th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms of Taste and Olfactory Perception
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 線虫C. elegansの頭部神経系全体のGCaMP6fを用いた活動解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 大江紗, 寺本孝行, 徳永旭将, 広瀬修, 豊島有, 久下小百合, 飯野雄一, 吉田亮, 石原健
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2016-11-30
• [学会発表] 線虫のwhole-brainイメージングデータに関する位相同期解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 岩崎唯史, 寺本孝行, 大江紗, 徳永旭将, 広瀬修, Stephen Wu, 豊島有, ジャンムンソン, 吉田亮, 飯野雄一, 石原健
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会大会
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • 年月日: 2016-11-25
• [学会発表] 線虫の塩忌避学習による行動変化に関与する神経の同定及び神経回路の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: Jang Moon-Sun, 豊島 有, 国友 博文, 金森 真奈美, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会大会
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • 年月日: 2016-11-25
  • 招待講演
• [学会発表] A machine learning pipeline for whole brain imaging of Caenorhabditis elegans: cell tracking, quantification, annotation and visualization (2016)
  • 著者名/発表者名: Stephen Wu , 徳永 旭将, 広瀬 修, 豊島 有, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一, 吉田 亮
  • 学会等名: BioImage Informatics Conference 2016
  • 発表場所: Breakthrough & Discovery Theatrette, Biopolis, Singapore
  • 年月日: 2016-10-10
  • 国際学会
• [学会発表] 全脳イメージングの自動解析に向けた要素技術について (2016)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: 第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)
  • 発表場所: 東京国際交流館プラザ平成(東京都江東区)
  • 年月日: 2016-09-29
  • 招待講演
• [学会発表] Whole Brain Imaging of Caenorhabditis Elegans × Machine Learning (2016)
  • 著者名/発表者名: Stephen Wu, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino and Ryo Yoshida
  • 学会等名: 第5回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2016)
  • 発表場所: 東京国際交流館プラザ平成(東京都江東区)
  • 年月日: 2016-09-29
• [学会発表] Neural information processing by neuroglobin in Caenorhabditis elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Shigekazu Oda, Yu Toyoshima, Mario de Bono
  • 学会等名: The 17th International Conference on Systems Biology
  • 発表場所: Barcelona Palau de Congressos, Barcelona, Spain
  • 年月日: 2016-09-16
  • 国際学会
• [学会発表] Accurate automatic detection of densely distributed cell nuclei in 3D space. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yu Toyoshima, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Manami Kanamori, Takayuki Teramoto, Moon-Sun Jang, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino
  • 学会等名: CeNeuro2016
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2016-07-27
  • 国際学会
• [学会発表] Whole brain imaging reveals the roles of gap junctions for the synchronized oscillatory activity. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Ishihara, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuishi Iwasaki, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takayuki Teramoto.
  • 学会等名: CeNeuro2016
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2016-07-27
  • 国際学会
• [学会発表] Analyses of the neuronal activities of the central nervous system by GCaMP6f in C. elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Suzu Oe, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Sayuri Kuge, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara.
  • 学会等名: CeNeuro2016
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2016-07-27
  • 国際学会
• [学会発表] Correlation clustering reveals intrinsic graph structure of whole-brain imaging data (2016)
  • 著者名/発表者名: Hiromu Sakuma, Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuishi Iwasaki
  • 学会等名: CeNeuro2016
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂(愛知県名古屋市)
  • 年月日: 2016-07-27
  • 国際学会
• [学会発表] Labeling of active neural circuit by the calcium probe CaMPARI (2016)
  • 著者名/発表者名: Keita Mori，Yu Toyoshima，Yuichi Iino
  • 学会等名: 第39回日本神経科学大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2016-07-20
• [学会発表] 全脳イメージングの自動解析に向けた要素技術について (2016)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有, 徳永 旭将, 広瀬 修, 寺本 孝行, Jang Moon-Sun, 久下 小百合, 石原 健, 吉田亮, 飯野 雄一
  • 学会等名: バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
  • 発表場所: 大阪大学吹田キャンパス(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2016-06-22
• [学会発表] A machine learning pipeline for whole brain imaging of Caenorhabditis elegans: cell tracking, quantification, annotation and visualization (2016)
  • 著者名/発表者名: Stephen Wu, 徳永 旭将, 広瀬 修, 豊島 有, 寺本 孝行, 石原 健, 飯野 雄一, 吉田 亮
  • 学会等名: バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
  • 発表場所: 大阪大学吹田キャンパス(大阪府吹田市)
  • 年月日: 2016-06-22
• [学会発表] Neural coding moduladion by Neuroglobin alters the behavior of C. elegans (2016)
  • 著者名/発表者名: Shigekazu Oda, Yu Toyoshima, Mario de Bono
  • 学会等名: European Worm Meeting 2016
  • 発表場所: Max Delbruck Center, Berlin, Germany
  • 年月日: 2016-06-01
  • 国際学会
• [学会発表] 全脳イメージングに必要な要素技術について (2016)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一
  • 学会等名: CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第4回領域会議
  • 発表場所: 国立科学博物館 (東京都台東区)
  • 年月日: 2016-02-18
• [学会発表] 線虫C. elegansの頭部神経系全体のGCaMP6fを用いた活動解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 大江紗、寺本孝行、徳永旭将、広瀬修、豊島有、久下小百合、飯野雄一、吉田亮、石原健
  • 学会等名: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会)
  • 発表場所: 神戸国際会議場 (兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] Intrinsic graph structure estimation from whole-brain imaging data of C. elegans (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiromu Sakuma, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, Takeshi Ishihara, Yuishi Iwasaki
  • 学会等名: 16th International Conference on Systems Biology
  • 発表場所: Biopolis, Singapore
  • 年月日: 2015-11-23
  • 国際学会
• [学会発表] Whole-brain Ca2+ imaging of C. elegans reveals the multi-neuronal dynamics that are coordinated by global synaptic connectivity. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: JST CREST-PRESTO joint international symposium - Structural Biological Dynamics: From Molecules to Life with 60 trillion Cells -
  • 発表場所: 東京大学伊東謝恩ホール (東京都文京区)
  • 年月日: 2015-11-05
  • 国際学会
• [学会発表] Whole-brain Ca2+ imaging of C. elegans to explore the neuronal mechanisms for behavioral choice. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara.
  • 学会等名: International Symposium on Prediction and Decision Making 2015
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール (東京都文京区)
  • 年月日: 2015-10-31
  • 国際学会
• [学会発表] "Tracking multiple cells with strongly-correlated moves in a 4D live-cell imaging data (2015)
  • 著者名/発表者名: Osamu Hirose, Shotaro Kawaguchi, Terumasa Tokunaga, Takayuki Teramoto, Sayuri Kuge, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
  • 学会等名: BioImage Informatics Conference 2015
  • 発表場所: Green Auditorium (Gaithersburg, Maryland, USA)
  • 年月日: 2015-10-14
  • 国際学会
• [学会発表] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: 第38会日本神経科学大会
  • 発表場所: 神戸国際会議場(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2015-07-28
• [学会発表] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: 20th International Worm Meeting
  • 発表場所: University of California, Los Angels (Los Angeles, California, USA)
  • 年月日: 2015-06-24
  • 国際学会
• [学会発表] 空間粒子フィルタによる多数の細胞の同時追跡 (2015)
  • 著者名/発表者名: 広瀬修、川口翔太郎、徳永旭将、豊島有、寺本孝行、久下小百合、石原健、飯野雄一、吉田亮
  • 学会等名: 第21回 情報論的学習理論と機械学習(IBISML)研究会
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学 (沖縄県国頭郡)
  • 年月日: 2015-06-23
• [学会発表] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法 (2015)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一
  • 学会等名: バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ 2015
  • 発表場所: 九州大学馬出キャンパス (福岡県福岡市)
  • 年月日: 2015-06-18
• [学会発表] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法と神経細胞の自動アノテーションの試み (2015)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、Jang Moon Sun、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
  • 学会等名: CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第4回数理道場
  • 発表場所: 大阪ガス研修所 奥池ロッジ (兵庫県芦屋市)
  • 年月日: 2015-06-12
• [学会発表] Whole-brain imaging of C. elegans reveals multi-neuronal dynamics under non-stimulus condition. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Teramoto, Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Yu Toyoshima, Yuichi Iino, Ryo Yoshida, and Takeshi Ishihara
  • 学会等名: Wiring The Brain (Cold Spring Harbor Laboratory Meeting)
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory (New York, USA)
  • 年月日: 2015-03-24 – 2015-03-28
• [学会発表] 3次元的に密集した細胞核の高精度な自動認識手法 (2015)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
  • 学会等名: 定量生物学の会第7会年会
  • 発表場所: 九州大学筑紫キャンパスC-Cube(福岡県春日市)
  • 年月日: 2015-01-11 – 2015-01-12
• [学会発表] 線虫C. elegansの全中枢神経のCa2+イメージングによる刺激に対する応答と無刺激時における神経活動の計測 (2014)
  • 著者名/発表者名: 寺本 孝行、徳永 旭将、広瀬 修、豊島 有、飯野 雄一、吉田 亮、石原 健
  • 学会等名: 第37回分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 密集した細胞核の高精度な自動認識手法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
  • 学会等名: 第37回分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 密集した細胞核の高精度な自動認識手法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 豊島 有、徳永 旭将、広瀬 修、寺本 孝行、張 文瑄、久下 小百合、石原 健、吉田亮、飯野 雄一、
  • 学会等名: CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」第3回数理道場
  • 発表場所: 沖縄科学技術大学院大学シーサイドハウス(沖縄県国頭郡)
  • 年月日: 2014-10-30
• [学会発表] Automated detection and tracking of many cells by using 4D live-cell imaging data (2014)
  • 著者名/発表者名: Terumasa Tokunaga, Osamu Hirose, Shotaro Kawaguchi, Yu Toyoshima, Takayuki Teramoto, Hisaki Ikebata, Sayuri Kuge, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino, Ryo Yoshida
  • 学会等名: 第3回生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: 仙台国際センター(宮城県仙台市)
  • 年月日: 2014-10-02 – 2014-10-04
• [学会発表] 4D ライブセルイメージングデータ内の非常に多数の細胞を自動追跡するための空間粒子フィルタ手法の開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 広瀬修、川口翔太郎、徳永旭将、豊島有、寺本孝行、久下小百合、石原健、飯野雄一、吉田亮
  • 学会等名: 2014年度統計関連学会連合大会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
  • 年月日: 2014-09-13 – 2014-09-16
• [備考] 飯野研究室 研究内容
  • URL: http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/
• [備考] 密集した多数の神経細胞の活動を同時に測定する自動画像解析技術を開発
  • URL: https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2016/4863/
• [備考] 神経細胞と神経回路のシミュレーション
  • URL: http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/JResearch10_simulation.html
• [備考] 全神経回路の働きの解明
  • URL: http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JResearch/JResearch11_wholebrain.html