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新規単分子蛍光観察法によるがん抑制因子p53のDNA探索機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26840045
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生物物理学
研究機関東北大学

研究代表者

鎌形 清人  東北大学, 多元物質科学研究所, 助教 (90432492)

研究協力者 杉山 弘  京都大学, 大学院理学研究科, 教授 (50183843)
遠藤 政幸  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 准教授 (70335389)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード蛋白質 / DNA / 1分子計測 / 1分子計測(SMD) / 遺伝子 / 単分子計測 / 天然変性蛋白質 / 探索 / 結合
研究成果の概要

p53はDNAのある部位(標的配列)へ結合することで、細胞のがん化を防ぐ。本研究では、p53の標的配列への結合の仕組み、及び、p53の特定の構造を持たない変性領域の役割の解明を行った。p53がDNA上を動く過程を一分子ごと計測した結果、標的DNA配列への結合の確率が低く、p53の修飾により結合確率が制御されることが明らかとなった。さらに、変性領域が長くなると、p53がDNAの配列を識別できなくなることが明らかとなった。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (32件) (うち国際学会 3件、 招待講演 10件)

  • [国際共同研究] University of California, Los Angeles(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] DNA結合蛋白質p53のスライディング探索の単分子蛍光観察2016

    • 著者名/発表者名
      村田崇人、伊藤優志、鎌形清人
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 56 号: 2 ページ: 109-111

    • DOI

      10.2142/biophys.56.109

    • NAID

      130005140949

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] One-dimensional sliding of p53 along DNA is accelerated in the presence of Ca(2+) or Mg(2+) at millimolar concentrations2015

    • 著者名/発表者名
      Murata A, Ito Y, Kashima R, Kanbayashi S, Nanatani K, Igarashi C, Okumura M, Inaba K, Tokino T, Takahashi S, Kamagata K
    • 雑誌名

      JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY

      巻: 427 号: 16 ページ: 2663-2678

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2015.06.016

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complexity of the folding transition of the B domain of protein A revealed by the high-speed tracking of single-molecule fluorescence time series2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Munehito Arai, Satoshi Takahashi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119 号: 20 ページ: 6081-6091

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b00414

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Where the complex things are: single molecule andensemble spectroscopic investigations of protein folding dynamics2015

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Tkahahshi, Kiyoto Kamagata, Hiroyuki Oikawa
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 36 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2015.11.006

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Direct observation of target DNA recognition of p53 mutants by single-molecule fluorescence microscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Itoh, Yuji, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Chihiro Igarashi, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Direct observation of target DNA recognition of p53 mutants by single-molecule fluorescence microscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Itoh, Yuji, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Chihiro Igarashi, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      天然変性タンパク質計算化学研究会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2016-01-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 一分子蛍光顕微鏡によるp53の標的DNA認識の直接観察2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤優志、村田崇人、坂本清志、七谷圭、和田健彦、高橋聡、鎌形清人
    • 学会等名
      生物物理学会東北支部会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2015-12-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNA結合蛋白質の機能解析のためのDNA整列固定法「DNAガーデン」の開発2015

    • 著者名/発表者名
      五十嵐千裕, 村田崇人, 伊藤優志, 高橋聡, 鎌形清人
    • 学会等名
      アライアンス若手交流会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2015-11-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] DNA結合蛋白質の機能解析のためのDNA整列固定法「DNAガーデン」の開発2015

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      2015アライアンスG3分科会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2015-11-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Observation of the Search Dynamics of p53 Mutants for the Target DNA Sequence by Single-molecule Fluorescence Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Yuji Itoh, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Takehiko Wada, Satoshi Takahasi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2015
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2015-09-16
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Target search process of a tumor suppressor p53 revealed by single-molecule fluorescence microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Observation of the Search Dynamics of p53 Mutants for the Target DNA Sequence by Single-molecule Fluorescence Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Yuji Itoh, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法によるがん抑制蛋白質p53のスライディング運動の解明2015

    • 著者名/発表者名
      村田崇人, 伊藤優志, 五十嵐千裕, Dwiky Subekti Rendra Graha, 高橋聡, 鎌形清人
    • 学会等名
      The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2015-09-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] がん抑制蛋白質p53の標的DNA配列探索運動の単分子蛍光観測2015

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      第3回生体分子サイエンスセミナー
    • 発表場所
      神奈川
    • 年月日
      2015-08-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 単分子蛍光顕微鏡によるがん抑制蛋白質p53の標的DNA探索過程の観察2015

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      金沢大学理工研究域&バイオAFM先端研究センターセミナー
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2015-08-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Target DNA search of a tumor suppressor p53 revealed by single-molecule fluorescence microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Agato Murata, Yuji Itoh, Chihiro Igarasi, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-07-09
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Investigation of the Role of Intrinsically Disordered Region in p53 Using Single Molecule Fluorescence Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Dwiky Rendra Graha Subekti, Agato Murata, Chihiro Igarashi, Yuji Ito, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法によるがん抑制蛋白質p53のスライディング運動の解明2015

    • 著者名/発表者名
      村田崇人, 伊藤優志, 五十嵐千裕, 高橋聡, 鎌形清人
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会,
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 一分子蛍光顕微鏡によるp53変異体の標的配列探索ダイナミクスの観察2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤優志, 村田崇人, 坂本清志, 七谷圭, 和田健彦, 高橋聡, 鎌形清人
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会,
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2015-06-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法によるがん抑制蛋白質p53のスライディング運動の解明2015

    • 著者名/発表者名
      村田崇人・伊藤優志・五十嵐千裕・鹿島理沙・時野隆至・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      船橋市
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 一分子蛍光顕微鏡によるp53変異体の標的配列探索ダイナミクスの観察2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤優志・村田崇人・坂本清志・七谷圭・和田健彦・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      船橋市
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] DNA結合蛋白質の単分子蛍光観察のためのDNA整列技術の開発2015

    • 著者名/発表者名
      五十嵐千裕・村田崇人・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      船橋市
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 単分子蛍光観察によるがん抑制蛋白質の標的配列探索問題2015

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      第3回天然変性蛋白質計算科学セミナー
    • 発表場所
      御殿場市
    • 年月日
      2015-03-10 – 2015-03-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Target search process of a tumor suppressor p53 revealed by single-molecule fluorescence microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      北海道大学電子科学研究所小松崎研究室セミナー
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2015-01-23
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法による癌抑制蛋白質p53の標的配列探索機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      村田崇人、伊藤優志、Dwiky Subekti Rendra Graha、五十嵐千裕、高橋聡、鎌形清人
    • 学会等名
      新学術研究「柔らかな分子系」第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      豊中市
    • 年月日
      2014-11-28 – 2014-11-29
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 単分子蛍光観察による癌抑制蛋白質p53 の標的配列探索機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      広島大学クロマチン動態数理研究拠点
    • 発表場所
      東広島市
    • 年月日
      2014-11-28
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Observation of the Search Dynamics of p53 for the Targent DNA Sequence by Single-molecule Fluorescence Microscopy2014

    • 著者名/発表者名
      Yuji Itoh、Agato Murata, Seiji Sakamoto, Takehiko Wada, Satoshi Takahasi, and Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Investigation of DNA search mechanism of tumor suppressor p532014

    • 著者名/発表者名
      Agato Murata, Yuji Itoh, Dwiky Subekti Rendra Graha, Chihiro Igarashi, Satoshi Takahashi and Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2014-09-25
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 単分子蛍光観察による癌抑制蛋白質p53 の標的配列探索機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      RNAインフォマティックス道場in 札幌
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2014-08-25 – 2014-08-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Observation of the Search Dynamics of p53 for the Targent DNA Sequence by Single-molecule Fluorescence Microscopy2014

    • 著者名/発表者名
      Yuji Itoh, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Takehiko Wada, Satoshi Takahasi, and Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      東北大学化学系サマースクール2014
    • 発表場所
      仙台市
    • 年月日
      2014-08-25 – 2014-08-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 癌抑制蛋白質p53のDNA探索機構の研究2014

    • 著者名/発表者名
      村田崇人・伊藤優志・Dwiky Subekti Rendra Graha・鹿島理沙・時野隆志・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質単分子の構造変化を計測する暗視野顕微鏡の開発2014

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人・間野絵梨子・七谷圭・阿蘇裕樹・井上裕一・小井川浩之・高橋聡
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜市
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Target Search Process of A Tumor Suppressor p53 Revealed by Single-Molecule Fluorescence Microscopy2014

    • 著者名/発表者名
      Murata A., Itoh, Y., Kashima, R., Tokino, T., Takahashi, S., Kamagata, K.
    • 学会等名
      The 16th international p53 workshop
    • 発表場所
      Stockholm, Sweden
    • 年月日
      2014-06-15 – 2014-06-19
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法による癌抑制蛋白質p53のDNA探索機構の研究2014

    • 著者名/発表者名
      村田崇人、伊藤優志、Dwiky Subekti Rendra Graha、高橋聡、鎌形清人
    • 学会等名
      新学術領域「柔らかな分子系」第3回全体会議
    • 発表場所
      北杜市
    • 年月日
      2014-06-03 – 2014-06-05
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 単分子蛍光観測で解き明かすがん抑制タンパク質p53 のターゲット探索問題2014

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      シンポジウム「DNA上のタンパク質の動き」
    • 発表場所
      京都市
    • 年月日
      2014-05-31
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 単分子蛍光計測によるがん抑制蛋白質p53のDNA探索機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      鎌形清人
    • 学会等名
      附置研究所間アライアンスによるナノとマクロをつなぐ物質・デバイス・システム創製戦略プロジェクト 平成25年度 成果報告会
    • 発表場所
      豊中市
    • 年月日
      2014-05-30
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2022-01-27  

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