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サケ科魚類の回遊多型における遺伝的基盤と進化的起源

研究課題

研究課題/領域番号 26840136
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生態・環境
研究機関北海道大学

研究代表者

小泉 逸郎  北海道大学, 地球環境科学研究科(研究院), 准教授 (50572799)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2014年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワード生活史多型 / 表現型可塑性 / 進化 / 遺伝的基盤 / サケ科魚類 / 回遊型 / 残留型 / 降海型 / 平行進化
研究成果の概要

本研究では、顕著な表現型多型を示すサケ科魚類を用いて、回遊二型(降海型と河川残留型)の遺伝的基盤と進化的起源を明らかにした。サクラマス、アメマス合計384個体においてゲノム全域から約8,000万塩基サイトの配列を決定した。ゲノムワイド関連分析(GWAS)を行ったところ、降海型と残留型を区別できる遺伝子領域はわずか1-4遺伝子座のみであり、効果もそれほど強くなかった。候補遺伝子領域をニジマスのドラフトゲノムと比較したところ、ニジマスにおける候補領域とは異なっていた。これらのサケ科魚類は似たような回遊特性を持つが、各種で異なる遺伝的変異を用いて降海/残留の表現型多型を達成していると考えられた。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] UC Davis(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Absolute vs. relative assessments of individual status in status-dependent strategies under stochastic environments.2016

    • 著者名/発表者名
      Tachiki Y. and Koizumi I.
    • 雑誌名

      The American Naturalist

      巻: 187

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Rapid life history change after habitat fragmentation caused genetic homogeneity in freshwater salmonid2015

    • 著者名/発表者名
      Itsuro Koizumi
    • 学会等名
      日本生態学会第62回大会
    • 発表場所
      鹿児島大学
    • 年月日
      2015-03-18 – 2015-03-22
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 小泉研究室HP

    • URL

      http://noah.ees.hokudai.ac.jp/envmi/koizumilab/

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2022-01-27  

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