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クローナル植物の繁殖戦略におけるエピジェネティックス機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26840148
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生態・環境
研究機関立命館大学

研究代表者

荒木 希和子  立命館大学, 生命科学部, 任期制講師 (30580930)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
キーワードクローナル植物 / エピジェネティック変異 / 野生植物 / DNAメチル化 / 生育環境 / 環境応答 / クローン繁殖
研究成果の概要

遺伝的変異を生じないクローン繁殖を行う植物におけるエピジェネティクス機構を明らかにするため、クローナル植物3種のクローン株を光強度もしくは水環境の異なる環境下で栽培し、形態変化とDNAメチル化変異を調べた。その結果、異なる条件間では開花数や葉数,葉の質感などに差異が見られたが、その子孫株には継承されなかった。バイサルファイトシーケンス解析では、条件間でのメチル化差は平均2%(最大40%)であり、DNAメチル化状態が大きく変化しないことがわかった。したがって、実験での継承世代では、子孫株はその経験した環境に迅速に応答する一方、DNAメチル化変異は安定的で変化はほとんど生じないことが確認された。

報告書

(5件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実施状況報告書
  • 2015 実施状況報告書
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (15件) (うち国際共著 1件、 査読あり 15件、 オープンアクセス 11件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Genet-specific DNA methylation probabilities detected in a spatial epigenetic analysis of a clonal plant population2017

    • 著者名/発表者名
      Araki KS, Kubo T, Kudoh H
    • 雑誌名

      PloS ONE

      巻: 12 号: 5 ページ: e0178145-e0178145

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0178145

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 特集にあたって2017

    • 著者名/発表者名
      Araki KS, Fukui S
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 67 号: 2 ページ: 119-122

    • DOI

      10.18960/seitai.67.2_119

    • NAID

      130005893354

    • ISSN
      0021-5007, 2424-127X
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] クローナル植物の繁殖様式と遺伝構造2017

    • 著者名/発表者名
      Fukui S, Araki KS
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 67 号: 2 ページ: 147-159

    • DOI

      10.18960/seitai.67.2_147

    • NAID

      130005893344

    • ISSN
      0021-5007, 2424-127X
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ガン細胞に見るクローン増殖と適応進化2017

    • 著者名/発表者名
      Araki KS, Fukui S, Sugihara H
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 67 号: 2 ページ: 169-180

    • DOI

      10.18960/seitai.67.2_169

    • NAID

      130005893348

    • ISSN
      0021-5007, 2424-127X
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Spatial genetic structure and body size divergence in endangered Gymnogobius isaza in ancient Lake Biwa2017

    • 著者名/発表者名
      Nakazawa T, Liu SYV, Sakai Y, Araki KS, Tsai CH, Okuda N
    • 雑誌名

      Mitochondrial DNA Part A

      巻: 9 号: 5 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1080/24701394.2017.1357708

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] ガン細胞に見るクローン増殖と適応進化-細胞の特殊性とクローン生物との共通性を考える-2017

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・福井眞・杉原洋行
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 印刷中

    • NAID

      130005893348

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] クローン植物の繁殖戦略と遺伝構造-固着性生活をおくる上での空間不均一性への適応-2017

    • 著者名/発表者名
      福井眞・荒木希和子
    • 雑誌名

      日本生態学会誌

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stimulation of soil microorganisms in pesticide-contaminated soil using organic materials2016

    • 著者名/発表者名
      Adhikari D, Perwira YI, Araki KS, Kubo M
    • 雑誌名

      AIMS Bioengineering

      巻: 3 号: 3 ページ: 379-388

    • DOI

      10.3934/bioeng.2016.3.379

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Analysis of chemical and biological soil properties in organically and conventionally fertilized apple orchards2016

    • 著者名/発表者名
      Kai T, Mukai M, Araki KS, Adhikari D, Kubo M
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural Chemistry and Environment

      巻: 5 号: 02 ページ: 92-99

    • DOI

      10.4236/jacen.2016.52010

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparison of soil properties between upland and paddy fields based on the soil fertility index (SOFIX)2016

    • 著者名/発表者名
      Araki KS, Perwira IY, Adhikari D, Kubo M
    • 雑誌名

      Current Trends in Microbiology

      巻: 10 ページ: 85-94

    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Degradation of bioplastics in soil and their degradation effects on environmental microorganisms2016

    • 著者名/発表者名
      D Adhikari, M. Mukai, KS Araki, T Kai, K Kubota, T Kawagoe, M Kubo
    • 雑誌名

      Journal of Agricultural Chemistry and Environment

      巻: 5 ページ: 23-34

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of chemical and biological soil properties in organically and conventionally fertilized apple orchards2016

    • 著者名/発表者名
      T Kai, M Mukai, KS Araki, D Adhikari, M Kubo
    • 雑誌名

      Agricultural Chemistry and Environment

      巻: 5

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Physical and biological properties of apple orchard soils of different productivities2015

    • 著者名/発表者名
      T Kai, M Mukai, KS Araki, D Adhikari, M Kubo
    • 雑誌名

      Open Journal of Soil Science

      巻: 5 ページ: 149-156

    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A new proposal for a soil fertility index (SOFIX) for organic agriculture and development of a SOFIX database for agricultural fields.2015

    • 著者名/発表者名
      D. Adhikari, T. Kai, M. Mukai, K.S. Araki, M. Kubo.
    • 雑誌名

      Current topics in biotechnology

      巻: 印刷中

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Spatial Niche Facilitates Clonal Reproduction in Seed Plants under Temporal Disturbance.2014

    • 著者名/発表者名
      S. Fukui, K. S. Araki
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 12 ページ: e116111-e116111

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0116111

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] 林床植物におけるクローン繁殖様式の個体差と集団構造2017

    • 著者名/発表者名
      辻本典顯・荒木希和子・工藤洋
    • 学会等名
      第64回日本生態学会
    • 発表場所
      早稲田大学早稲田キャンパス(東京都新宿区)
    • 年月日
      2017-03-14
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 地下茎伸長のダイナミクス-クローン成長の推移行列モデル構築-2016

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・島谷健一郎・大原雅
    • 学会等名
      第48回種生物学シンポジウム
    • 発表場所
      キロロトリビュートポートフォリオホテル(北海道余市郡赤井川村)
    • 年月日
      2016-12-03
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] 草本バイオマスを利用したグルコース生産2016

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・久保幹
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-09-28
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of soil environment and microorganisms in agricultural fields農地の土壌環境と微生物叢の解析2016

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・Adhikari Dinesh・向真樹・久保幹
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度札幌大会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-03-30
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] クローン成長の推移行列モデル-地下茎伸長のダイナミクス-2016

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・島谷健一郎・大原雅
    • 学会等名
      第63回日本生態学会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-03-24
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノムワイドSNPによる地域的な遺伝構造と局所適応パターンの解明:コンロンソウを例に2016

    • 著者名/発表者名
      岩崎貴也・荒木希和子・永野惇・Renat Sabirov・Karol Marhold・Valentin Yakubov・Jae-Hong Pak・伊藤元己・工藤洋
    • 学会等名
      日本植物分類学会第15回大会
    • 発表場所
      富山大学(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-03-08
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 疑似一年生クローン植物集団におけるジェネットの分布に依存したラメットサイズの変異2015

    • 著者名/発表者名
      辻本典顯・荒木希和子・工藤洋
    • 学会等名
      第46回種生物学シンポジウム
    • 発表場所
      かんぽの宿岐阜羽島(岐阜県羽島市)
    • 年月日
      2015-12-04
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 空間自己相関をもつ撹乱条件下でのクローン繁殖戦略 -2015

    • 著者名/発表者名
      福井眞・荒木希和子
    • 学会等名
      第 31 回個体群生態学会大会
    • 発表場所
      滋賀県立大学(滋賀県彦根市)
    • 年月日
      2015-10-11
    • 関連する報告書
      2015 実施状況報告書
  • [学会発表] 野生植物集団におけるエピジェネティック・ジェネティック変異の役割2015

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子,工藤洋
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会
    • 発表場所
      一橋大学(東京都)
    • 年月日
      2015-05-25 – 2015-05-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] クローン植物の優占ジェネットにおけるラメット生産様式:自然集団と移植実験による解析2015

    • 著者名/発表者名
      辻本典顯,荒木希和子,八杉公基,本庄三恵,永野惇,工藤洋
    • 学会等名
      第62回日本生態学会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県)
    • 年月日
      2015-03-21
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 網羅的サンプリングとRAD-seq 法を活用した分子系統地理-東アジアに広域分布するコンロンソウを例に2015

    • 著者名/発表者名
      岩崎貴也,荒木希和子,永野惇,Sabirov,R.N.,Marhold, K.,Yakubov, V.V.,Pak, J.-H.,伊藤元己,工藤洋
    • 学会等名
      第62回日本生態学会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県)
    • 年月日
      2015-03-21
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] クローン成長の推移行列2014

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子,島谷健一郎,大原雅
    • 学会等名
      行列モデル研究集会
    • 発表場所
      統計数理研究所(東京都)
    • 年月日
      2014-09-24
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 耕作地における窒素固定細菌の多様性の解析2014

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子,Chalee Kongwichian,竹里駿希,Dinesh Adhikari,向真樹,久保幹
    • 学会等名
      第66回日本生物工学会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2014-09-11
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 地下茎で広がるクローナル植物の 空間パターン―スズランのクローン成長とその伸長方向―2014

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子,島谷健一郎,大原雅
    • 学会等名
      思考力教育養成ワークショップ
    • 発表場所
      統計数理研究所(東京都)
    • 年月日
      2014-08-26
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] エピジェネティクスの生態学―環境に応答して遺伝子を調節するしくみ2017

    • 著者名/発表者名
      荒木希和子・伊藤秀臣・小林一三・佐竹暁子・鈴木俊介・玉田洋介・田中健太・西尾治幾・西村泰介・星野敦
    • 総ページ数
      245
    • 出版者
      文一総合出版
    • 関連する報告書
      2016 実施状況報告書
  • [備考] Kiwako S. Araki's site

    • URL

      https://sites.google.com/site/kiwako89/home

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [備考] 立命館大学生命科学部生物工学科教員 荒木希和子

    • URL

      http://research-db.ritsumei.ac.jp/Profiles/112/0011168/profile.html

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2014-04-04   更新日: 2019-03-29  

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