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環境核酸の分析による生物量推定法の高精度化および代謝量推定への応用に向けた新展開

研究課題

研究課題/領域番号 26840152
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 生態・環境
研究機関龍谷大学

研究代表者

山中 裕樹  龍谷大学, 理工学部, 講師 (60455227)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2015年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2014年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワード生物量 / 代謝量 / 環境核酸 / 環境評価 / 測定精度 / 遺伝子 / 水棲生物
研究成果の概要

本研究では、水棲生物が環境中へと放出している環境DNAおよび環境RNAを分析する技術の高精度化と非接触での代謝量測定への展開を試みた。試料水中の環境DNAは輸送中に急激に分解し、分析の精度低下をもたらす。これを回避するため車内で利用可能なろ過システムを新規に開発し、採水後速やかに濾過を行って、フィルターを冷凍保存するという系を確立した。一方、環境RNAについては測定値のばらつきが想定以上に大きく、その回避策を十分確立できなかった。ただし、コイを対象として代謝関連遺伝子を水中から種特異的に検出できること、そして、定量可能な濃度の環境RNAが比較的長く水中に残存することを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] The use of environmental DNA of fishes as an efficient method of determining habitat connectivity2016

    • 著者名/発表者名
      Yamanaka, H. and Minamoto, T.
    • 雑誌名

      Ecological Indicators

      巻: 62 ページ: 147-153

    • DOI

      10.1016/j.ecolind.2015.11.022

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of water pH and proteinase K treatment on the yield of environmental DNA from water samples2016

    • 著者名/発表者名
      Tsuji, S., Yamanaka, H., Minamoto, T.
    • 雑誌名

      Limnology

      巻: 印刷中 号: 1 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1007/s10201-016-0483-x

    • NAID

      40021062363

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 魚類からの環境RNA放出速度と温度依存性2016

    • 著者名/発表者名
      垣見直希, 河野吉将, 山中裕樹
    • 学会等名
      第63回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 種特異的プライマーセットとリアルタイムPCRによる魚類の分布推定2016

    • 著者名/発表者名
      山中裕樹,櫻井翔,本澤大生,本郷真理,辻冴月
    • 学会等名
      第63回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNA分析におけるリアルタイムPCRとデジタルPCRの検出率の比較2016

    • 著者名/発表者名
      十河勇樹,土居秀幸,山中裕樹
    • 学会等名
      第63回日本生態学会大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] On site filtration of water samples for environmental DNA analysis to avoid DNA degradation during transportation.2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Yamanaka, Hiromu Motozawa, Satsuki Tsuji, Ryohei C Miyazawa
    • 学会等名
      British Ecological Society 2015 Annual Meeting
    • 発表場所
      Edinburgh, Scotland
    • 年月日
      2015-12-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] Yamanaka's Web Site

    • URL

      http://www.est.ryukoku.ac.jp/est/yamanaka/index.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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