ニューカレドニアにおけるヒノキ科2属の平行的な生態的種分化の解明

• 研究課題/領域番号: 26850098
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 森林科学
• 研究機関: 京都大学 (2015-2016); 東京大学 (2014)
• 研究代表者: 阪口 翔太 京都大学, 人間・環境学研究科, 助教 (50726809)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2016年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2015年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円); 2014年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
• キーワード: 針葉樹 / ニューカレドニア / 蛇紋岩 / 進化 / ニューカドニア / 適応進化 / 集団遺伝 / 景観遺伝 / 個体数減少 / 保全遺伝 / RNA-seq

研究成果の概要

本研究ではニューカレドニア島に侵入した後に，蛇紋岩土壌と乾性低木林への適応進化が共通して起きたヒノキ科2属に着目し，RNA-seq解析に基づいてそれらの種分化に関わったと考えられる適応遺伝子を特定した．その結果，2属で共通して検出された遺伝子はなかったが，本島の貧栄養土壌への適応に関係すると考えられる遺伝子がCallitris属で見つかった．また，Callitris sulcataについて集団遺伝解析を実施し，河川沿いの低地湿性林に分布する本種の集団分化には，複雑な山地地形が隔離要因として重要であったことを明らかにした．

研究成果

• [国際共同研究] Agronomic Institute of New Caledonia(ニューカレドニア)
• [雑誌論文] Application of a simplified method of chloroplast enrichment to small amounts of tissue for chloroplast genome sequencing (2017)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S., Ueno, S., Tsumura, Y., Setoguchi, H., Ito, M., Hattori, C., Nozoe, S., Takahashi, D., Nakamasu, R., Sakagami, T., Lannuzel, G., Fogliani, B., Wulff, A.S., L’Huillier, L. and Isagi, Y.
  • 雑誌名: Applications in Plant Sciences 巻: 印刷中
  • NAID: 120007129090
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Fire is a major driver of the genetic diversity of two co-occurring Tasmanian palaeo-endemic conifers (2016)
  • 著者名/発表者名: James R. P. Worth, Gregory J. Jordan, James R. Marthick, Sakaguchi, S., Eric A. Colhoun, Grant J. Williamson, Motomi Ito and David J.M.S Bowman
  • 雑誌名: Journal of Biogeography 巻: － 号: 6 ページ: 1254-1267
  • DOI: 10.1111/jbi.12919
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Gondwanan conifer clones imperilled by bushfire (2016)
  • 著者名/発表者名: James R. P. Worth, Sakaguchi, S., Karl D. Rann, Clarence J. W. Bowman, Motomi Ito, Gregory J. Jordan, David M. J. S. Bowman
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: － 号: 1
  • DOI: 10.1038/srep33930
  • NAID: 120005997853
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transient hybridization, not homoploid hybrid speciation, between ancient and deeply divergent conifers (2016)
  • 著者名/発表者名: Worth, J.R.P, Larcombe, M.J., Sakaguchi, S., Marthick, J.R., Bowman, D.M.J.S., Ito, M. and Jordan, G.J.
  • 雑誌名: American Journal of Botany 巻: 103 号: 2 ページ: 246-259
  • DOI: 10.3732/ajb.1500433
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Development of nuclear and chloroplast microsatellite markers for the endangered conifer Callitris sulcata (Cupressaceae) (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S., Lannuzel, G., Fogliani, B., Wulff, A. S., L’Huillier, L., Kurata, S., Ueno, S., Isagi, Y., Tsumura, Y., Ito, M.
  • 雑誌名: Applications in Plant Sciences 巻: 3 号: 8 ページ: 1-3
  • DOI: 10.3732/apps.1500045
  • NAID: 120007136128
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] High-throughput linkage mapping of Australian white cypress pine (Callitris glaucophylla) and map transferability to related species (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S., Sugino, T., Tsumura, Y., Ito, M., Crisp, M.D., Bowman, D.M.J.S., Nagano, A.J., Honjo, M.N., Yasugi, M., Kudoh, H., Matsuki, Y., Suyama, Y. and Isagi, Y.
  • 雑誌名: Tree Genetics & Genomes 巻: 11 号: 6 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1007/s11295-015-0944-0
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Development of nuclear microsatellite markers for the Tasmanian endemic conifer Diselma archeri Hook. F. (Cupressaceae) (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S., Worth, J., Jordan, G., Thomas, P. and Ito, M.
  • 雑誌名: Conservation Genetics Resources 巻: なし 号: 2 ページ: 369-372
  • DOI: 10.1007/s12686-014-0368-4
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Development of nuclear and mitochondrial microsatellite markers for the relictual conifer genus Athrotaxis (Cupressaceae) (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S., Worth, J., Jordan, G., Thomas, P. and Ito, M.
  • 雑誌名: Conservation Genetics Resources 巻: なし 号: 2 ページ: 477-481
  • DOI: 10.1007/s12686-014-0400-8
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Environmental niche modelling fails to predict Last Glacial Maximum refugia: niche shifts, microrefugia or incorrect palaeoclimate estimates? (2014)
  • 著者名/発表者名: Worth, J., Williamson, G., Sakaguchi, S., Nevill, P., Jordan, G.
  • 雑誌名: Global Ecology and Biogeography 巻: 23 号: 11 ページ: 1186-1197
  • DOI: 10.1111/geb.12239
  • 査読あり
• [雑誌論文] 地理情報システム技術を用いた歴史生物地理学的解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岩崎貴也・阪口翔太・横山良太・高見泰興・大澤剛士・池田紘士・陶山佳久
  • 雑誌名: 日本生態学会誌 巻: 64 ページ: 183-199
  • 査読あり
• [学会発表] ニューカレドニア産希少針葉樹Callitris sulcataの保全遺伝解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 阪口翔太, Guillaume Lannuzel, Bruno Fogliani, Adrien Wulff, LʼHuillier Laurent, 上野真義 , 津村義彦, 伊藤元己, 井鷺裕司
  • 学会等名: 日本森林学会第127回大会
  • 発表場所: 神奈川県藤沢市
  • 年月日: 2016-03-27
• [学会発表] RAD-sequencing as a tool for unravelling the population dynamics of ecologically diverse plant lineages (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, S.
  • 学会等名: Workshop of Young Scientists on Biodiversity and Conservation Biology in Southwest China: Advances in Conservation Genetics
  • 発表場所: 中国雲南省昆明市
  • 年月日: 2015-07-07
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ニューカレドニア産ヒノキ科樹木の遺伝子における自然選択の痕跡 (2015)
  • 著者名/発表者名: 阪口翔太, 上野真義, 津村義彦, 伊藤元己, James Worth, Bruno Fogliani, 井鷺裕司
  • 学会等名: 第62回日本生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2015-03-19
• [学会発表] 歴史的な景観変化が地域集団の分布・デモグラフィに及ぼす影響 (2015)
  • 著者名/発表者名: 阪口翔太, David Bowman, Lynda Prior, Michael Crisp, Linde Celeste, 津村義彦, 伊藤元己, 井鷺裕司
  • 学会等名: 第62回日本生態学会大会
  • 発表場所: 鹿児島大学（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2015-03-19
  • 招待講演
• [学会発表] 高密度連鎖地図上でのヒノキ科Callitris属のゲノム分化推定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 阪口翔太, 杉野壮, Michael Crisp, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 津村義彦, 伊藤元己, 井鷺裕司
  • 学会等名: 日本植物分類学会第14回大会
  • 発表場所: 福島大学（福島県福島市）
  • 年月日: 2015-03-07
• [学会発表] Plant demographic responses to the past environmental changes: lessons to predict the future population consequences (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Sakaguchi
  • 学会等名: Contribution of Genetics to Plant Conservation, FAPESP-JSPS Joint Research Workshop 2015
  • 発表場所: Piracicaba, Brazil
  • 年月日: 2015-02-03
  • 招待講演
• [学会・シンポジウム開催] 蛇紋岩地帯における植物多様化に迫る ―自然史・生物地理・適応― (2017)
  • 発表場所: 東京（早稲田大学）