狂犬病ウイルス野外株のRNAによる新規複製・転写制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 26850187
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 獣医学
• 研究機関: 日本大学
• 研究代表者: 鈴木 由紀 日本大学, 生物資源科学部, 助教 (30712492)
• 研究協力者: 井上 智
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2016年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 狂犬病ウイルス / 複製・転写制御 / 3' UTR / RNAモチーフ / N遺伝子 / 高度保存領域 / 複製・転写調節 / RNA結合蛋白質 / UTR

研究成果の概要

本研究は、狂犬病ウイルス(RABV)のRNA による新規複製・転写制御機構を明らかにすることを目的に研究を行った。RABV野外株119検体の間で保存されているRNAモチーフを探索した結果、N遺伝子 CDSの5’側とM遺伝子の3’UTRにRNAモチーフが同定された。RABVの3’UTR挿入したluciferase RNAを用いてレポーターアッセイを行った結果、MとG の3’UTRがmRNAの分解を促進することが明らかになった。また、ミニゲノムレポーターアッセイと組換えウイルスを用いた実験により、N CDSの高度保存領域はRABVの複製に必要なモチーフ配列をコードすることが明らかになった。

研究成果

• [雑誌論文] An RNA-dependent RNA polymerase gene in bat genomes derived from an ancient negative-strand RNA virus. (2016)
  • 著者名/発表者名: Horie M, Kobayashi Y, Honda T, Fujino K, Akasaka T, Kohl C, Wibbelt G, Muhldorfer K, Kurth A, Muller MA, Corman VM, Gillich N, Suzuki Y, Schwemmle M, Tomonaga K.
  • 雑誌名: Sci Rep. 巻: 6 号: 1 ページ: 25873-25873
  • DOI: 10.1038/srep25873
  • NAID: 120005822794
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular epidemiological study of adenovirus infecting western lowland gorillas and humans in and around Moukalaba-Doudou National Park (Gabon). (2016)
  • 著者名/発表者名: Nze-Nkogue C, Horie M, Fujita S, Ogino M, Kobayashi Y, Mizukami K, Masatani T, Ezzikouri S, Matsuu A, Mizutani T, Ozawa M, Yamato O, Ngomanda A, Yamagiwa J, Tsukiyama-Kohara K
  • 雑誌名: Virus Genes 巻: 52 号: 5 ページ: 671-678
  • DOI: 10.1007/s11262-016-1360-8
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Computational and molecular analysis of conserved influenza A virus RNA secondary structures involved in infectious virion production (2016)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, Y.(新姓：鈴木), Dadonaite, B., Doremalen, N., Suzuki, Y., Barclay, W., and Pybus, O.G.
  • 雑誌名: RNA Biology 巻: 13 号: 9 ページ: 883-894
  • DOI: 10.1080/15476286.2016.1208331
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Exaptation of Bornavirus-Like Nucleoprotein Elements in Afrotherians. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Y, Horie M, Nakano A, Murata K, Itou T, Suzuki Y.
  • 雑誌名: PLoS Pathog. 巻: 12 号: 8 ページ: e1005785-e1005785
  • DOI: 10.1371/journal.ppat.1005785
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Molecular epidemiological tracing of a cattle rabies outbreak lasting less than a month in Rio Grande do Sul in southern Brazil. (2016)
  • 著者名/発表者名: Itou T, Fukayama T, Mochizuki N, Kobayashi Y, Deberaldini ER, Carvalho AA, Ito FH, Sakai T.
  • 雑誌名: BMC Res Notes. 巻: 9(1) 号: 1 ページ: 87-87
  • DOI: 10.1186/s13104-016-1898-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and Expression Profiles of microRNA in Dolphin (2015)
  • 著者名/発表者名: Takao Segawa, Yuki Kobayashi, Satoko Inamoto, Miwa Suzuki, Tomoko Endoh, Takuya Itou
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 33 号: 1 ページ: 92-97
  • DOI: 10.2108/zs150090
  • NAID: 40020738767
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Establishing conditions for the storage and elution of rabies virus RNA using FTA^® cards (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakai T, Ishii A, Segawa T, Takagi Y, Kobayashi Y, Itou T
  • 雑誌名: Ｔｈｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 77 号: 4 ページ: 461-465
  • DOI: 10.1292/jvms.14-0227
  • NAID: 130005067018
  • ISSN: 0916-7250, 1347-7439
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Origin of an endogenous bornavirus-like nucleoprotein element in thirteen-lined ground squirrels (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshiyuki Suzuki, Yuki Kobayashi, Masayuki Horie, Keizo Tomonaga
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 89 号: 3 ページ: 143-148
  • DOI: 10.1266/ggs.89.143
  • NAID: 130004703733
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Easy-to-use rapid gene amplification method for direct detection of RNA and DNA viruses in sera and feces from various animals (2014)
  • 著者名/発表者名: Segawa T, Kobayashi Y, Sase Y, Itou T, Suzuki M, Endoh T, Nakanishi T, Sakai
  • 雑誌名: J Virol Methods. 巻: 201C ページ: 31-37
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2014.01.019
  • 査読あり
• [学会発表] Molecular analysis of conserved RNA secondary structures predicted in the packaging signals of influenza A virus M segment (2016)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, Y.(新姓：鈴木), Dadonaite, B., Dorenalan, N., Suzuki, Y., Barclay, W., and Pybus O.G.
  • 学会等名: 第64回日本ウイルス学会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
  • 年月日: 2016-10-23
• [学会発表] Unexpected broad distribution of endogenous orthomyxovirus-like elements in arthropod genomes (2016)
  • 著者名/発表者名: Horie, M., and Kobayashi, Y.(新姓：鈴木)
  • 学会等名: 第64回日本ウイルス学会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
  • 年月日: 2016-10-23
• [学会発表] Establishment of L gene-deficient rabies virus and its utility for functional studies on L protein (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, K., Ito, N., Kobayashi, Y.(新姓：鈴木), Okada, K., and Sugiyama, M.
  • 学会等名: 第64回日本ウイルス学会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
  • 年月日: 2016-10-23
• [学会発表] ハンドウイルカの肺由来細胞株の樹立と性状解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 彦部京助, 瀬川太雄, 鈴木美和, 小林由紀(新姓：鈴木), 前田健, 伊藤琢也
  • 学会等名: 第22回日本野生動物医学会大会
  • 発表場所: 宮崎市民プラザ(宮崎県・宮崎市)
  • 年月日: 2016-09-16
• [学会発表] ンドウイルカにおける肺培養細胞の作製 -鯨類の遺伝資源保存に向けて (2016)
  • 著者名/発表者名: 瀬川太雄, 彦部京助, 鈴木美和, 小林由紀(新姓：鈴木), 前田健, 伊藤琢也
  • 学会等名: 平成28年度日本水産学会秋季大会
  • 発表場所: 近畿大学農学部(奈良県・奈良市)
  • 年月日: 2016-09-08
• [学会発表] アフリカ獣上目ゲノムに内在化したボルナウイルス核蛋白質由来エレメント(EBLN)の蛋白質発現解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中野亜由美, 小林由紀(新姓：鈴木), 堀江真行, 鈴木善幸, 伊藤琢也
  • 学会等名: 第159回日本獣医学会学術会
  • 発表場所: 日本大学生物資源科学部(神奈川県・藤沢市)
  • 年月日: 2016-09-06
• [学会発表] エチオピアにおける狂犬病ウイルスの分子系統解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 伊藤優真, 日高侑也, Dressa, F., 小林由紀(新姓：鈴木), 伊藤琢也
  • 学会等名: 第159回日本獣医学会学術会
  • 発表場所: 日本大学生物資源科学部(神奈川県・藤沢市)
  • 年月日: 2016-09-06
• [学会発表] L遺伝子欠損型狂犬病ウイルスを活用したL蛋白質保存領域の機能解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 中川賢人, 小林由紀(新姓：鈴木), 伊藤直人, 岡田和真, 杉山誠
  • 学会等名: 第159回日本獣医学会学術会
  • 発表場所: 日本大学生物資源科学部(神奈川県・藤沢市)
  • 年月日: 2016-09-06
• [学会発表] ハンドウイルカにおけるMRPの発現解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 新田野乃, 小林由紀(新姓：鈴木), 小林淳也, 瀬川太雄, 猪島康雄, 前田健, 鈴木美和, 鯉江洋, 伊藤琢也
  • 学会等名: 第159回日本獣医学会学術会
  • 発表場所: 日本大学生物資源科学部(神奈川県・藤沢市)
  • 年月日: 2016-09-06
• [学会発表] A型インフルエンザウイルスセグメントに予測される高度保存RNA二次構造はパッケージングに寄与するのか？ (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林由紀
  • 学会等名: 日本遺伝学会第87回大会
  • 発表場所: 東北大学(川内北キャンパス)(宮城県・仙台市)
  • 年月日: 2015-09-24
• [学会発表] アフリカ獣上目ゲノムに内在化したボルナウイルス核蛋白質由来エレメントの機能獲得をもたらした進化メカニズム (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林由紀、村田浩一、堀江真行、伊藤琢也、鈴木善幸
  • 学会等名: 第158回日本獣医学会学術集会
  • 発表場所: 北里大学獣医学部(青森県・十和田市)
  • 年月日: 2015-09-07
• [学会発表] ボルナウイルス由来エレメントの機能獲得メカニズム (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林由紀
  • 学会等名: 第17回日本進化学会
  • 発表場所: 中央大学後楽園キャンパス(東京都・文京区)
  • 年月日: 2015-08-20
  • 招待講演
• [学会発表] ブラジルの吸血および食果コウモリ由来狂犬病ウイルスの分子系統解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 日下部美帆、小林由紀、Fumio H Ito、酒井健夫、伊藤琢也
  • 学会等名: 第１５７回日本獣医学会学術集会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2014-09-09 – 2014-09-12
• [学会発表] ハンドウイルカmicroRNAの同定と発現解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 稲本理子、瀬川太雄、小林由紀、鈴木美和、遠藤智子、伊藤琢也
  • 学会等名: 第１５７回日本獣医学会学術集会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2014-09-09 – 2014-09-12
• [学会発表] 内在性ボルナ病ウイルス様エレメントと宿主の進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林由紀
  • 学会等名: 第１６回日本進化学会
  • 発表場所: 大阪高槻現代劇場
  • 年月日: 2014-08-21 – 2014-08-24
  • 招待講演
• [備考] 日本大学生物資源科学部
  • URL: http://kenkyu-web.cin.nihon-u.ac.jp/Profiles/110/0010955/profile.html
• [備考] 日本大学生物資源科学部HP
  • URL: http://kenkyu-web.cin.nihon-u.ac.jp/Profiles/110/0010955/profile.html