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ウイルス直接検出法を応用した環境中ポリオウイルスのサーベイランス

研究課題

研究課題/領域番号 26860450
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 衛生学・公衆衛生学
研究機関国立感染症研究所

研究代表者

中村 朋史  国立感染症研究所, その他部局等, 研究員 (90446881)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードポリオウイルス / 環境サーベイランス / レセプター結合型ビーズ / 次世代シークエンス / ポリオ / 直接検出 / サーベイランス
研究成果の概要

陰電化膜およびPVR-MBの併用により、PVを約5000倍に濃縮することが可能であった。また、カプシド全領域増幅法を試したところ、目的断片(約4.0 kbp)の良好な増幅がみられ、その後に行ったリアルタイムPCRおよびNGSにおいてもPVを高感度かつ正確に検出可能であった。本手法を用いてPVの存在が疑われるパキスタンの河川水の解析を行った。NGSを用いることにより、増幅された断片中に含まれるPVおよび非PVエンテロウイルスを一括して検出・解析できることに加え、ウイルス同士のリコンビネーション等も検討可能であった。環境サーベイランスにおける本手法の有用性が強く示唆された。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Environmental surveillance of poliovirus in sewage water around the introduction period for inactivated polio vaccine in Japan2015

    • 著者名/発表者名
      Nakamura T, Hamasaki M, Yoshitomi H, Ishibashi T, Yoshiyama C, Maeda E, Sera N, Yoshida H.
    • 雑誌名

      Appl Environ Microbiol.

      巻: 81 号: 5 ページ: 1859

    • DOI

      10.1128/aem.03575-14

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Construction and characterization of an infectious cDNA clone of rat hepatitis E virus.2015

    • 著者名/発表者名
      Li T.C., Yang T., Yoshizaki S., Ami Y., Suzaki Y., Ishii K., Haga K., Nakamura T., Ochiai S., Wakita T. and Johne R.
    • 雑誌名

      Journal of General Virology

      巻: 96 号: 6 ページ: 1320-1327

    • DOI

      10.1099/vir.0.000072

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of an efficient entire-capsid-coding-region amplification method for direct detection of poliovirus from stool extracts2015

    • 著者名/発表者名
      Arita M, Kilpatrick DR, Nakamura T, Burns CC, Bukbuk D, Oderinde SB, Oberste MS, Kew OM, Pallansch MA, Shimizu H
    • 雑誌名

      J Clin Microbiol

      巻: 53 号: 1 ページ: 73-78

    • DOI

      10.1128/jcm.02384-14

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Development of direct detection method of polioviruses from environmental samples2015

    • 著者名/発表者名
      Tomofumi Nakamura, Minetaro Arita, Hiroyuki Shimizu
    • 学会等名
      第63回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2015-11-22
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] ウイルス受容体特異性を応用した環境水からのポリオウイルス直接検出法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      中村 朋史、有田 峰太郎、清水 博之
    • 学会等名
      第62回日本ウイルス学会学術集会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2014-11-10 – 2014-11-12
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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