GISTにおけるnoncoding RNAのエピジェネティック制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 26860514
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 消化器内科学
• 研究機関: 札幌医科大学
• 研究代表者: 新沼 猛 札幌医科大学, 医学部, 助教 (60708113)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2015年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2014年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 消化管間質腫瘍 / エピジェネティクス / noncoding RNA / GIST

研究成果の概要

GISTにおいてエピジェネティックに不活化されるnoncodigRNAの探索目的に遺伝子サイレンシングの解除のためGIST-T1細胞株に５aza-dCおよび4 -PBAによる薬剤処理を行った後にnoncodingRNAの発現変化、ChIP シークエンス解析を行った。
エピジェネティックな機序で転写抑制を受けると考えられるnoncoding RNAを抽出し、臨床検体のメチル化状態を解析し高頻度にメチル化されるmiR-34a,miR-335を見出した。また、tumor suppressiveに働くと考えられているlncRNAのCpG island高メチル化が予後不良と相関することが確認された。

研究成果

• [雑誌論文] A Screen for Epigenetically Silenced microRNA Genes in Gastrointestinal Stromal Tumors. (2015)
  • 著者名/発表者名: Isosaka M, Niinuma T, Nojima M, Kai M, Yamamoto E, Maruyama R, Nobuoka T, Nishida T, Kanda T, Taguchi T, Hasegawa T, Tokino T, Hirata K, Suzuki H, Shinomura Y
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 7 ページ: e0133754-e0133754
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0133754
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 消化管間質腫瘍の再発に関連するmicroRNAの解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛
  • 学会等名: 第74回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-08
• [学会発表] 消化管間質腫瘍におけるmicroRNA遺伝子のエピジェネティックな制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛
  • 学会等名: 第9回日本エピジェネティクス研究会
  • 発表場所: 学術総合センター一橋講堂（東京都千代田区）
  • 年月日: 2015-05-25
• [学会発表] 消化管間質腫瘍の再発に関連するmicroRNAの解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 消化管間質腫瘍における microRNA 遺伝子のエピジェネティックな 制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛
  • 学会等名: 日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-27
• [学会発表] 消化管間質腫瘍における microRNA 遺伝子のエピジェネティックな制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新沼 猛
  • 学会等名: 日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-05-27