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全エクソンシークエンスを用いた新規糖尿病発症原因遺伝子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 26860694
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 代謝学
研究機関京都大学

研究代表者

田中 大祐  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50582904)

連携研究者 小泉 昭夫  京都大学, 大学院医学研究科, 教授 (50124574)
研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2015年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワード糖尿病 / 全エクソンシーケンス / 次世代シークエンス
研究成果の概要

糖尿病罹患者を多数有する家系にて、全エクソンシーケンス(WES)を行い発症原因遺伝子変異を同定することを目的とした。家系内糖尿病罹患者および非罹患者につきゲノムDNAのWESを行い、罹患者に共通し非罹患者にみられず、一般人口において稀な遺伝子変異を絞り込んだ。結果、タンパクアミノ酸配列変化を伴う塩基配列変化は439検出され、SNPデータベースおよび105名の一般非罹患者におけるアレル頻度検討にて1%未満であったのは16個であった。このうち糖尿病との関連がすでに示唆されている遺伝子であるARHGEF11遺伝子のR608H変異について、家系における発症原因である可能性が高いと考えた。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Glycemic variability is associated with quality of life and treatment satisfaction in patients with type 1 diabetes.2015

    • 著者名/発表者名
      17.Ayano-Takahara S, Ikeda K, Fujimoto S, Hamasaki A, Harashima S, Toyoda K, Fujita Y, Nagashima K, Tanaka D, Inagaki N.
    • 雑誌名

      Diabetes Care

      巻: 38(1) 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.2337/dc14-1801

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Whole Exome Sequencing in a Family with Multiple Cases of Type 1 Diabetes Reveals a Candidate Susceptibility Mutation2015

    • 著者名/発表者名
      Byambatseren Jambaljav, Daisuke Tanaka, Kazuaki Nagashima, Norio Harada, and Nobuya Inagaki
    • 学会等名
      The American Diabetes Association's 75th Scientific Sessions
    • 発表場所
      ボストン
    • 年月日
      2015-06-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Whole Exome Sequencing in a Family with Multiple Cases of Type 1 Diabetes Reveals a Candidate Susceptibility Mutation2015

    • 著者名/発表者名
      Byambatseren Jambaljav, Daisuke Tanaka, Kazuaki Nagashima, Norio Harada, and Nobuya Inagaki
    • 学会等名
      The American Diabetes Association’s 75th Scientific Sessions
    • 発表場所
      Boston
    • 年月日
      2015-06-08
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] 1型糖尿病多発家系における、次世代シーケンスを用いた発症原因遺伝子変異同定の試み2015

    • 著者名/発表者名
      田中大祐 Byambatseren Jambaljav 長嶋一昭 原田範雄 小泉昭夫 稲垣暢也
    • 学会等名
      第58回日本糖尿病学会年次学術集会
    • 発表場所
      下関
    • 年月日
      2015-05-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Whole Exome Sequencing in a Japanese Family with Highly Aggregated Type 2 Diabetes Identifies a Candidate Susceptibility Variant2014

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Tanaka, Kazuaki Nagashima, Shin-ichi Harashima, and Nobuya Inagaki
    • 学会等名
      The American Diabetes Association’s 74th Scientific Sessions
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2014-06-16
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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