| 研究課題/領域番号 |
26870045
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生命・健康・医療情報学
システムゲノム科学
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| 研究機関 | 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 (2015-2016)
東北大学 (2014) |
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研究代表者 |
村上 洋一 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, プロジェクト研究員 (20548424)
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| 研究期間 (年度) |
2014-04-01 – 2017-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2016年度)
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| 配分額 *注記 |
2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2016年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2015年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
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| キーワード | タンパク質間相互作用 / タンパク質機能 / 機械学習 / 創薬支援 / バイオインフォマティクス / タンパク質間相互作用予測 / アミノ酸保存度 / アミノ酸残基 / 予測 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、研究代表者が開発したタンパク質間の相互作用の可否を予測するPSOPIAを応用して、不均衡かつ大規模な訓練データセットを用いて、ある１つのタンパク質と相互作用をする他のタンパク質を予測する方法を開発した。新たに開発した機械学習モデルは、以前のPSOPIAよりもより高い予測性能を達成することができた。また、ある１つのタンパク質と公共データベースに登録されているヒトの各タンパク質とをペアにして自動的かつ高速に相互作用予測を実行するシステムを構築した。さらに、予測されたタンパク質から創薬標的やバイオマーカーとなりうるタンパク質の絞り込みを支援するためのインターフェースを開発した。
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