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染色体異数性による転写調節異常機構の解明:パリスターキリアン症候群をモデルとして

研究課題

研究課題/領域番号 26870139
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ゲノム医科学
人類遺伝学
研究機関東京大学

研究代表者

泉 幸佑  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (40383707)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2015年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード染色体異常 / モザイク / デジタルPCR / エピゲノム / モザイク染色体異常 / 遺伝子発現解析 / ゲノムワイド解析 / エピゲノム解析
研究成果の概要

パリスターキリアン症候群(PKS)は12番短腕染色体重複により発症するモザイク染色体異常症である。本研究では、PKSの病態メカニズム解明のため、次世代シーケンサーを用いた遺伝子発現検討・エピゲノム修飾検討を行った。その結果として、PKSに特徴的と考えられる遺伝子発現異常、そして、その遺伝子発現異常に関与していると考えられるエピゲノム修飾変化を同定した。これらの知見はPKSの病因を解明する上で、有用な情報となる上に、他の染色体異常症の発症原因解明にも有用な知見と考えられた。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 1件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)

  • [国際共同研究] フィラデルフィア小児病院(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Mosaic Ratio Quantification of Isochromosome 12p in Pallister-Killian syndrome using Droplet Digital PCR2016

    • 著者名/発表者名
      •Fujiki K., Shirahige K., Kaur M., Deardorff MA., Conlin LK., Krantz ID., Izumi K
    • 雑誌名

      Mol Genet Genomic Med

      巻: in press 号: 3 ページ: 257-261

    • DOI

      10.1002/mgg3.200

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Elevation of Insulin-Like growth Factor Binding Protein-2 Level in Pallister-Killian Syndrome: Implications for the Postnatal Growth Retardation Phenotype2015

    • 著者名/発表者名
      Izumi K., Kellogg E., Fujiki K., Kaur M., Tilton RK., Noon S, Wilkens A., Shirahige K., Krantz ID
    • 雑誌名

      Am J Med Genet A.

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genome-Wide Expression Analysis in Fibroblast Cell Lines from Probands with Pallister Killian Syndrome2014

    • 著者名/発表者名
      Kaur M., Izumi K., Wilkens AB., Chatfield KC., Spinner NB., Conlin LK., Zhang Z., Krantz ID
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 号: 10 ページ: e108853-e108853

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0108853

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pallister-Killian Syndrome2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi K., Krantz ID
    • 雑誌名

      Am J Med Genet C

      巻: 166C 号: 4 ページ: 406-413

    • DOI

      10.1002/ajmg.c.31423

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 12p microRNA expression in Fibroblast Cell Lines from Probands with Pallister-Killian Syndrome2014

    • 著者名/発表者名
      Izumi K., Kaur M, Zhang Z., Krantz ID
    • 雑誌名

      Chromosome Res

      巻: 22 号: 4 ページ: 453-461

    • DOI

      10.1007/s10577-014-9431-y

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cardiac Manifestations of Pallister-Killian Syndrome2014

    • 著者名/発表者名
      Tilton R., Wilkens A., Krantz ID., Izumi K
    • 雑誌名

      Am J Med Genet A

      巻: 164A 号: 5 ページ: 1130-5

    • DOI

      10.1002/ajmg.a.36413

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Mosaic Ratio Quantification of Isochromosome 12p in Pallister-Killian syndrome using Droplet Digital PCR2016

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Izumi
    • 学会等名
      International Congress of Human Genetics
    • 発表場所
      Kyoto International Conference Center (京都府京都市))
    • 年月日
      2016-04-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2022-01-27  

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