部分最小二乗回帰を用いたシステム創薬戦略データベースの構築

• 研究課題/領域番号: 26870175
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 消化器外科学; 腫瘍治療学
• 研究機関: 順天堂大学
• 研究代表者: 茂櫛 薫 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (60569292)
• 研究期間 (年度): 2014-04-01 – 2017-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2016年度)
• 配分額: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2016年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2015年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: 肝細胞癌 / 遺伝子発現解析 / バイオインフォマティクス / 部分最小二乗回帰 / 多変量解析 / シグナル伝達 / マイクロアレイ

研究成果の概要

肝細胞癌は国内および世界的な統計でも、癌死の原因として上位に位置している。本研究では、網羅的遺伝子発現データに加え、臨床病理学的因子をはじめとするさまざまなデータを融合し、システム創薬の実現に向けたデータベースを構築することを目指した。多変量データ同士の回帰を行うことができる部分最小二乗法(partial least square regression: PLSR)を用い、臨床病理学的因子などの付随情報を目的変数群、遺伝子発現データを説明変数に取り、これらの相関関係をデータベースとして活用することを目的とした。

研究成果

• [雑誌論文] ARID2 modulates DNA damage response in human hepatocellular carcinoma cells. (2017)
  • 著者名/発表者名: Oba A, Shimada S, Akiyama Y, Nishikawaji T, Mogushi K, Ito H, Matsumura S, Aihara A, Mitsunori Y, Ban D, Ochiai T, Kudo A, Asahara H, Kaida A, Miura M, Tanabe M, Tanaka S.
  • 雑誌名: Journal of Hepatology 巻: in press 号: 5 ページ: 942-951
  • DOI: 10.1016/j.jhep.2016.12.026
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Acquired resistance with epigenetic alterations under long-term anti-angiogenic therapy for hepatocellular carcinoma. (2017)
  • 著者名/発表者名: Ohata Y, Akiyama Y, Shimada S, Mogushi K, Nakao K, Matsumura S, Aihara A, Mitsunori Y, Ban D, Ochiai T, Kudo A, Tanabe M, Tanaka S.
  • 雑誌名: Molecular Cancer Therapeutics 巻: in press 号: 6 ページ: 1155-1165
  • DOI: 10.1158/1535-7163.mct-16-0728
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] CD73 as a therapeutic target for pancreatic neuroendocrine tumor stem cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Katsuta, E., Tanaka, S., Mogushi, K., Shimada, S., Akiyama, Y., Aihara, A., Matsumura, S., Mitsunori, Y., Ban, D., Ochiai, T., Kudo, A., Fukamachi, H., Tanaka, H., Nakayama, K., Arii, S., Tanabe, M.
  • 雑誌名: Int. J. Oncol. 巻: 48 号: 2 ページ: 657-669
  • DOI: 10.3892/ijo.2015.3299
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] CD73 as a therapeutic target for pancreatic neuroendocrine tumor stem cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Katsuta E, Tanaka S, Mogushi K, Shimada S, Akiyama Y, Aihara A, Matsumura S, Mitsunori Y, Ban D, Ochiai T, Kudo A, Fukamachi H, Tanaka H, Nakayama K, Arii S, Tanabe M.
  • 雑誌名: International Journal of Oncology 巻: 48 号: 9 ページ: 657-69
  • DOI: 10.1007/s00535-015-1159-8
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Distinct clinicopathological phenotype of hepatocellular carcinoma with EOB-MRI hyperintensity: association with gene expression signature (2015)
  • 著者名/発表者名: Miura T, Ban D, Tanaka S, Mogushi K, Kudo A, Matsumura S, Mitsunori Y, Ochiai T, Tanaka H, Tanabe M.
  • 雑誌名: Am J Surg. 巻: 210 号: 3 ページ: 561-569
  • DOI: 10.1016/j.amjsurg.2015.03.027
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prognostic significance of Traf2-and Nck- interacting kinase (TNIK) in colorectal cancer. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takahashi H, Ishikawa T, Ishiguro M, Okazaki S, Mogushi K, Kobayashi H, Iida S, Mizushima H, Tanaka H, Uetake H, Sugihara K.
  • 雑誌名: BMC Cancer 巻: 15 号: 1 ページ: 794-794
  • DOI: 10.1186/s12885-015-1783-y
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] CHCHD2 mutations in autosomal dominant late-onset Parkinson’s disease: a genome-wide linkage and sequencing study. (2015)
  • 著者名/発表者名: Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Yuanzhe L, Ogaki K, Ando M, Yoshinon H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
  • 雑誌名: Lancet Neurol 巻: 14 号: 3 ページ: 274-282
  • DOI: 10.1016/s1474-4422(14)70266-2
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Age-related clinicopathological and molecular features of patients received curative hepatectomy for hepatocellular carcinoma. (2014)
  • 著者名/発表者名: Katsuta E, Tanaka S, Mogushi K, Matsumura S, Ban D, Ochiai T, Irie T, Kudo A, Nakamura N, Tanaka H, Tanabe M, Arii S.
  • 雑誌名: American Journal of Surgery 巻: 208(3) 号: 3 ページ: 450-456
  • DOI: 10.1016/j.amjsurg.2014.01.015
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Involvement of MAP3K8 and miR-17-5p in poor virologic response to interferon-based combination therapy for chronic hepatitis C (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsubota A, Mogushi K, Aizaki H, Miyaguchi K, Nagatsuma K, Matsudaira H, Kushida T, Furihata T, Tanaka H, Matsuura T.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9 号: 5 ページ: e97078-e97078
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0097078
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mitochondrial metabolism in the noncancerous liver determine the occurrence of hepatocellular carcinoma: a prospective study. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kudo A, Mogushi K, Takayama T, Matsumura S, Ban D, Irie T, Ochiai T, Nakamura N, Tanaka H, Anzai N, Sakamoto M, Tanaka S, Arii S.
  • 雑誌名: J Gastroenterol. 巻: 49 号: 3 ページ: 502-10
  • DOI: 10.1007/s00535-013-0791-4
  • 査読あり
• [学会発表] Gene expression analysis and cancer signaling networks (2017)
  • 著者名/発表者名: Kaoru Mogushi
  • 学会等名: International Symposium on BioComplexity
  • 発表場所: B-Conプラザ (別府)
  • 年月日: 2017-01-18
  • 国際学会
• [備考] 順天堂大学 研究者情報データベース
  • URL: http://www.juntendo.ac.jp/graduate/kenkyudb/search/achievement.php?MID=5240
• [備考] 順天堂大学 研究者情報データベース
  • URL: https://www.juntendo.ac.jp/graduate/kenkyudb/search/researcher.php?MID=5240