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Travelling DNA: a study in DNA dispersal and connectivity between marine ecosystem

研究課題

研究課題/領域番号 26870917
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 水圏生産科学
環境影響評価
研究機関琉球大学 (2015)
独立行政法人海洋研究開発機構 (2014)

研究代表者

フレデリック シニゲル  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 研究員 (10625940)

研究期間 (年度) 2014-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2015年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードMetabarcoding / Marine Biodiversity / Environmental DNA / metabarcoding / sedimentary DNA / eDNA / coral reef / hydrothermal vent
研究成果の概要

異なる環境中の環境DNA(eDNA)を比較することで、環境中の遊離DNA断片がどのように海中を移動するのかを推定することができる。そこで、深海から浅海にわたる幅広い水環境より得た堆積物中のeDNAを、メタバーコーディング手法により解析し、堆積物中の生物多様性を推定した。異なる環境間での遊離DNA断片の流動を示唆する結果は現時点では得られていないが、未知の生物のシーケンスが深海の堆積物中より大量に得られ、未知の深海生態系の存在が示唆された。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件)

  • [学会発表] From specimens to environmental DNA, perspectives and challenges in biodiversity studies2016

    • 著者名/発表者名
      Frederic Sinniger
    • 学会等名
      5th JAMBIO Forum
    • 発表場所
      Tsukuba University, Tokyo Campus
    • 年月日
      2016-02-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Mesophotic corals in Okinawa: a case of deep reef refugia?2015

    • 著者名/発表者名
      Frederic Sinniger
    • 学会等名
      Joint meeting of the Japanese Association of Benthology and the Plankton Society of Japan in 2015
    • 発表場所
      Hokkaido University, Sapporo
    • 年月日
      2015-09-03
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] From coral samples to eDNA, perspectives and challenges in mesophotic biodiversity2014

    • 著者名/発表者名
      Sinniger F, Prasetia R, Harii S
    • 学会等名
      2nd International Workshop on Mesophotic Coral Reef Ecosystems
    • 発表場所
      Interuniversity Institute for Marine Science, Eilat, Israel
    • 年月日
      2014-10-27
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Metazoan Environmental DNA as a tool in deep-sea environmental impact assessment2014

    • 著者名/発表者名
      Sinniger F, Oshima K, Harii S, Takami H, Yamamoto H
    • 学会等名
      3rd World Conference on Marine Biodiversity
    • 発表場所
      Qingdao, China
    • 年月日
      2014-10-14
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [学会発表] Environmental DNA survey of metazoan biodiversity: A case study in hydrothermal vent sediments.2014

    • 著者名/発表者名
      Sinniger F, Yamamoto H, Harii S, Oshima K, Takami H
    • 学会等名
      Unraveling Biodiversity from DNA International Symposium
    • 発表場所
      National Institute for Environmental Studies, Tsukuba, Japan
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書

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公開日: 2014-04-04   更新日: 2017-05-10  

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