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新興病原生物の進化における宿主個体群の遺伝的構造の役割

研究課題

研究課題/領域番号 26881007
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 環境影響評価
研究機関大阪大谷大学

研究代表者

内井 喜美子  大阪大谷大学, 薬学部, 助教 (90469619)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード新興感染症 / コイヘルペスウイルス / 環境DNA
研究成果の概要

コイヘルペスウイルス(CyHV3)感染症をモデルとし、宿主個体群遺伝構造と新興病原体の相互作用を評価するための解析手法の確立と基礎的知見の取得を行った。まず、宿主個体群の遺伝的構造を迅速に明らかにするための環境DNA手法を開発した。この手法を野外に適用し、各地のコイ個体群の遺伝的構造を迅速に評価することに成功した。また、自然水域から採取したCyHV3の遺伝子解析より、CyHV3が日本に導入された数年後には、複数の遺伝子型が出現したことを明らかとした。日本には単一系統のCyHV3が導入されたことより、導入後に遺伝的変異が生じたことが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] A novel environmental DNA approach to quantify the cryptic invasion of non-native genotypes2016

    • 著者名/発表者名
      Uchii, K., Doi, H. and Minamoto, T.
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Resources

      巻: 16 号: 2 ページ: 415-422

    • DOI

      10.1111/1755-0998.12460

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Use of droplet digital PCR for estimation of fish abundance and biomass in environmental DNA surveys2015

    • 著者名/発表者名
      DOI Hiedeyuki ; UCHII Kimiko ; TAKAHARA Teruhiko ; MATSUHASHI Saeko ; YAMANAKA Hiroki ; MINAMOTO Toshifumi
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 10 号: 3 ページ: e0122763-e0122763

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0122763

    • NAID

      120006220783

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] SNPの定量的解析による遺伝子型頻度の推定2016

    • 著者名/発表者名
      内井喜美子, 土居秀幸, 源利文, 山中裕樹
    • 学会等名
      第63回日本生態学会
    • 発表場所
      仙台国際センター(仙台)
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] コイヘルペスウイルスの野外における増殖/潜伏サイクル2015

    • 著者名/発表者名
      酒井涼, 内井喜美子, 谷佳津治
    • 学会等名
      第65回日本薬学会近畿支部総会・大会
    • 発表場所
      大阪大谷大学(富田林)
    • 年月日
      2015-10-17
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNA分析によるコイの季節移動の推定2015

    • 著者名/発表者名
      内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文
    • 学会等名
      日本陸水学会第80回大会
    • 発表場所
      北海道大学(函館)
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 環境DNA手法を用いた在来および外来コイの生息地利用の推定2015

    • 著者名/発表者名
      内井喜美子, 土居秀幸, 山中裕樹, 源利文
    • 学会等名
      第62回日本生態学会大会
    • 発表場所
      鹿児島市
    • 年月日
      2015-03-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [図書] コイヘルペスウイルス. 川端善一郎他 (編) "感染症の生態学" pp. 241-2532016

    • 著者名/発表者名
      内井喜美子, 川端善一郎
    • 総ページ数
      356
    • 出版者
      共立出版
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-09-09   更新日: 2017-05-10  

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