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“乗り物を持たない遺伝子”としての細胞外プラスミドの機能解明

研究課題

研究課題/領域番号 26892024
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学
研究機関富山県立大学

研究代表者

高橋 裕里香  富山県立大学, 工学部, 助教 (30732698)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード細胞外DNA / プラスミド / 富山湾
研究成果の概要

海水と海底堆積物それぞれから細胞外DNAのみを抽出する手法を確立した。富山湾の複数地点より得られた細胞外DNAの塩基配列を解析し、細胞外DNAにはその場に細胞として存在しない生物のDNAも含まれていること、さらに海水中では細胞内DNAとの組成の差が大きく地点間の差が小さい(=流動性が高い)のに対し、海底堆積物中では細胞内DNAとの差が小さく地点間の差が大きい(流動性が低い)ことを明らかにした。細胞外DNA中で既知プラスミドと相同性を示す配列は1%未満であったため、細胞外プラスミドを解析するためには、抽出された細胞外DNAから環状DNAのみを濃縮するステップが必要であることも確認された。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 学会発表 (5件) (うち招待講演 1件) 備考 (2件)

  • [学会発表] 遺伝子水平伝播への細胞外プラスミドの寄与の可能性2016

    • 著者名/発表者名
      高橋裕里香, 中野椋太, 宮西謙弥, 畠俊郎, 西田洋巳
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 富山湾海水中の微生物相・遺伝子多様性の評価のための細胞内DNA抽出方法の確立2016

    • 著者名/発表者名
      宮西謙弥, 中野椋太, 磯貝泰弘, 畠俊郎, 西田洋巳, 高橋裕里香
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 富山湾海底堆積物中の微生物相・遺伝子多様性の評価のための細胞内DNA抽出方法の確立2016

    • 著者名/発表者名
      中野椋太, 宮西謙弥, 磯貝泰弘, 畠俊郎, 西田洋巳, 高橋裕里香
    • 学会等名
      日本農芸化学会2016年度大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 細胞外プラスミド研究の展望2015

    • 著者名/発表者名
      高橋裕里香
    • 学会等名
      第2回東京大学・富山県立大学生物工学セミナー
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2015-11-25
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 富山湾底泥中の細胞外プラスミドの分離2015

    • 著者名/発表者名
      中野椋太, 宮西謙弥, 高橋裕里香, 畠俊郎, 西田洋巳
    • 学会等名
      第9回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2015-03-06
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://researchmap.jp/yurikatakahashi

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://researchmap.jp/yurikatakahashi

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-09-09   更新日: 2017-05-10  

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