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海洋ウイルス遺伝資源化計画:海洋RNAウイルスの探索手法確立と多様性・機能の解明

研究課題

研究課題/領域番号 26892031
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

浦山 俊一  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, ポストドクトラル研究員 (50736220)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード海洋 / ウイルス / 遺伝資源 / RNA / dsRNA / メタゲノム
研究成果の概要

本研究では新たな網羅的RNAウイルス探索手法を確立し、海洋環境中のRNAウイルス組成調査を行った。当該手法は病徴の有無に依存せず、従来手法と比較して高効率かつ高感度に、対象試料中の全ての非レトロRNAウイルスを同定可能である。本手法を用いて、従来手法では実質的に探査不可能だった潮溜り中の珪藻コロニーより多数の新規RNAウイルスを検出した。本結果から、海洋環境には従来の想定以上に多様な未知RNAウイルスが存在することが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件、 招待講演 2件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] FLDS: A Comprehensive dsRNA Sequencing Method for Intracellular RNA Virus Surveillance2016

    • 著者名/発表者名
      Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura.
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 31 号: 1 ページ: 33-40

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME15171

    • NAID

      130005138799

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A New Fractionation and Recovery Method of Viral Genomes Based on Nucleic Acid Composition and Structure Using Tandem Column Chromatography2015

    • 著者名/発表者名
      Urayama S, Yoshida-Takashima Y, Yoshida M, Tomaru Y, Moriyama H, Takai K, Nunoura T
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 30 号: 2 ページ: 199-203

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME14174

    • NAID

      130005077995

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 宿主病徴に依存しない網羅的RNAウイルスゲノム決定手法の確立2016

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一、吉田ゆかり、高木善弘、高井研、布浦拓郎
    • 学会等名
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学 大岡山キャンパス(東京都目黒区)
    • 年月日
      2016-03-05
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 高効率dsRNAシーケンシングによる細胞内RNAウイルスワールドの発見2015

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第30回大会
    • 発表場所
      土浦亀城プラザ(茨城県土浦市)
    • 年月日
      2015-10-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Fractionation of four types of viral nucleic acids by using hydroxyapatite and cellulose chromatography2015

    • 著者名/発表者名
      Syun-ichi Urayama, Yukari Yoshida, Mitsuhiro Yoshida, Ken Takai, Takuro Nunoura
    • 学会等名
      The annual meeting of the American Society for Virology
    • 発表場所
      Western University London ON, Canada
    • 年月日
      2015-07-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ウイルス核酸種4種の同時分画及びdsRNAメタゲノム手法の確立2015

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一、吉田(高島)ゆかり、吉田光宏、高木善弘、高井研、布浦拓郎
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      神戸大学農学部、兵庫県神戸市
    • 年月日
      2015-03-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] いもち病菌弱毒化ウイルス研究が拓くウイルスの遺伝資源利用―ヴァイロコントロール研究者、海で溺れる?―2014

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一
    • 学会等名
      日本植物病理学会 関東部会
    • 発表場所
      宇都宮大学農学部、栃木県宇都宮市
    • 年月日
      2014-09-12
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] バイオサイエンスとインダストリー2016

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一・布浦拓郎.
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      財団法人バイオインダストリー協会
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] 生物の科学 遺伝2015

    • 著者名/発表者名
      浦山俊一・吉田光宏・吉田(高島)ゆかり.
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] JAMSTEC研究者総覧

    • URL

      http://www.jamstec.go.jp/souran/html/Shunichi_Urayama003613-j.html

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 浦山俊一 - 略歴 - jamstec

    • URL

      http://www.jamstec.go.jp/rcmb/j/member/urayama_syunichi.html

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2014-09-09   更新日: 2017-05-10  

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