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遺伝子変異に基づいた肝細胞癌におけるクロマチン構造の網羅的解析

研究課題

研究課題/領域番号 26893045
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分補助金
研究分野 人体病理学
研究機関東京大学

研究代表者

林 玲匡  東京大学, 医学部附属病院, 助教 (40735396)

研究期間 (年度) 2014-08-29 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワード肝細胞癌 / FAIRE / エピゲノム / ゲノム / クロマチン構造 / 網羅的解析 / クロマチン / ARID
研究成果の概要

癌の発生,進展には、遺伝子そのもの変化(変異)だけではなく,それを制御する機構の変化も重要である.本研究では,遺伝子を制御する機構として,DNAとタンパク質の複合体であるクロマチンの構造に注目し,網羅的解析により,癌の発生,進展におけるその変化を捉えようとした.具体的には,肝細胞癌の手術凍結検体を用いて,FAIREという手法と次世代シーケンサーを合わせた実験系により,クロマチン構造の変化を網羅的に解析した.特に,発癌に重要とされる遺伝子の変異によって,どのようにクロマチン構造が変化することに注目し,CTNNB1という遺伝子の変異によって,クロマチン構造が変化する領域の同定に成功した.

報告書

(3件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Distinct clinicopathologic and genetic features of 2 histologic subtypes of intrahepatic cholangiocarcinoma.2016

    • 著者名/発表者名
      Hayashi A, Misumi K, Shibahara J, Arita J, Sakamoto Y, Hasegawa K, Kokudo N, Fukayama M.
    • 雑誌名

      Am J Surg Pathol.

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Clinicopathologic Characteristics of Hepatocellular Carcinoma With Reactive Ductule-like Components, a Subset of Liver Cancer Currently Classified as Combined Hepatocellular-Cholangiocarcinoma With Stem-Cell Features, Typical Subtype.2016

    • 著者名/発表者名
      Shibahara J, Hayashi A, Misumi K, Sakamoto Y, Arita J, Hasegawa K, Kokudo N, Fukayama M.
    • 雑誌名

      Am J Surg Pathol.

      巻: 40(5) 号: 5 ページ: 608-616

    • DOI

      10.1097/pas.0000000000000579

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] β-catenin alteration is rare in hepatocellular carcinoma with steatohepatitic features: immunohistochemical and mutational study.2015

    • 著者名/発表者名
      Ando S, Shibahara J, Hayashi A, Fukayama M.
    • 雑誌名

      Virchows Archiv

      巻: 467(5) 号: 5 ページ: 535-42

    • DOI

      10.1007/s00428-015-1836-2

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Altered expression of AT-rich interactive domain 1A in hepatocellular carcinoma2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi A, Abe H, Kunita A, Sakamoto Y, Hasegawa K, Shibahara J, Kokudo N, Fukayama M
    • 雑誌名

      International Journal of Clinical and Experimental Pathology

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Trans-ancestry mutational landscape of hepatocellular carcinoma genomes.2014

    • 著者名/発表者名
      Totoki Y, Tatsuno K, Covington KR, Ueda H, Creighton CJ, Kato M, Tsuji S, Donehower LA, Slagle BL, Nakamura H, Yamamoto S, Shinbrot E, Hama N, Lehmkuhl M, Hosoda F, Arai Y, Walker K, Dahdouli M, Gotoh K, Nagae G, Gingras MC, Muzny DM, …, Takayama T, Fukayama M, Gibbs RA, Wheeler DA, Aburatani H, Shibata T
    • 雑誌名

      Nat Genet.

      巻: 46 号: 12 ページ: 1267-73

    • DOI

      10.1038/ng.3126

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Distinct Clinicopathologic and Genetic Features of Two Histologic Subsets of Intrahepatic Cholangiocarcinoma2016

    • 著者名/発表者名
      Hayashi A, Misumi K, Shibahara J, Arita J, Sakamoto Y, Hasegawa K, Kokudo N, Fukayama M
    • 学会等名
      The 105th Annual Meeting of the United States and Canadian Academy of Pathology
    • 発表場所
      Seattle, WA, USA
    • 年月日
      2016-03-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Lymphocyte Infiltration is a New Promising Prognostic Factor in Hepatocellular Carcinoma2016

    • 著者名/発表者名
      Hayashi A, Shibahara J, Misumi K, Arita J, Sakamoto Y, Hasegawa K, Kokudo N, Fukayama M
    • 学会等名
      The 105th Annual Meeting of the United States and Canadian Academy of Pathology
    • 発表場所
      Seattle, WA, USA
    • 年月日
      2016-03-12
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 次世代シーケンスによる肝細胞癌のクロマチン構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      牧瀬 尚大, 林 玲匡, 藤田 貴教, 永江 玄太, 緑川 泰, 深山 正久, 油谷 浩幸
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場,愛知県名古屋市
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Multi lesion analysis of alpha fetoprotein producing gastric cancer2015

    • 著者名/発表者名
      田頭 周, 谷内田 真一, 垣内 美和子, 六反 啓文, 林 玲匡, 辰野 健二, 山本 尚吾, 永江 玄太, 阿部 浩幸, 石川 俊平, 柴田 龍弘, 深山 正久, 油谷 浩幸
    • 学会等名
      第74回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場,愛知県名古屋市
    • 年月日
      2015-10-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 肝細胞癌背景肝組織におけるH3K27ac修飾レベルの臨床病理学的検討.2015

    • 著者名/発表者名
      林玲匡, 柴原純二, 山内直子, 木村宏, 阪本良弘, 石川俊平, 國土典宏, 油谷浩幸,深山正久.
    • 学会等名
      第104回日本病理学会総会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場,愛知県名古屋市
    • 年月日
      2015-04-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 東京大学 病理学教室 2015年度 業績

    • URL

      http://pathol.umin.ac.jp/activity/gyoseki2015_1.pdf

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書

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公開日: 2014-09-09   更新日: 2017-05-10  

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