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土壌細菌と植物細胞の相互作用

研究課題

研究課題/領域番号 62480463
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 分子遺伝学・分子生理学
研究機関京都大学

研究代表者

岡 穆宏  京都大学, 化学研究所, 助教授 (10093212)

研究期間 (年度) 1987 – 1989
研究課題ステータス 完了 (1989年度)
配分額 *注記
6,600千円 (直接経費: 6,600千円)
1989年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
1988年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
1987年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
キーワード植物腫瘍 / 毛根 / クラウンゴ-ル / Riプラスミド / Tiプラスミド / vir遺伝子 / 転写調節因子 / DNA-蛋白質相互作用 / クラウンゴール / 自律増殖 / 転写調節 / 自律増殖能 / 複製開始
研究概要

1.Agrobacterium rhizogenes A4株の保有するRiプラスミド(pRiA4)からT-DNAが植物細胞へ移行し、植物に毛根を誘発するのに必要なvirulence(vir)領域約30,000塩基対のうち17,000塩基対の配列を決定し、その構造解析と突然変異株の解析から、(1)pRiA4のvir遺伝子群の編成はTiプラスミドのそれとほぼ対応しており、一部の遺伝子を除いて各vir遺伝子は互いに非常によく似ているが、遺伝子間のスペ-サ-部分の塩基配列は、転写調節に関与した特徴的な6塩基対配列(2.参照)以外は殆ど保存されておらず長さも変化していること、及び(2)幾つかのvir遺伝子の機能、を明らかにした。2.植物誘導物質の有、無の両条件下での各vir遺伝子の転写開始位置を正確に決定し、植物因子による誘導を転写開始の頻度として測定し、これをもとに誘導型のプロモ-タ-の構造を解析し以下の成果を得た。(1)virAとvirGは植物因子の有無によって転写開始部位が異なり、誘導型と構成型のプロモ-タ-が直列に並んでいる;(2)各誘導型のプロモ-タ-の上流には6塩基対からなる特徴的な配列が1ないし4個存在し、これらは11塩基対を周期とした位相に位置する;(3)この6塩基対配列に転写調節因子VirG蛋白質が結合する;(4)6塩基対配列の位相はRNAポリメラ-ゼがプロモ-タ-と相互作用する-10及び-35領域とほぼ反対の位相に相当する;(5)これらの事実をもとに、誘導型プロモ-タ-領域において、VirG蛋白質が上の6塩基配列を認識してDNAの片側に協調的に結合し、その結果-35領域が活性化されRNAポリメラ-ゼがVirG蛋白質とは反対側からDNAに結合するという3者の相互結合様式のモデルを提唱した。3.Agrobacterium菌を用いた遺伝子解析(相補性テスト等)のための厳密制御型プラスミドベクタ-を、Ri及びTiプラスミドの複製開始領域を同定し、それぞれからミニプラスミドを分離することによって構築した。

報告書

(4件)
  • 1989 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1988 実績報告書
  • 1987 実績報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (33件)

  • [文献書誌] R.Nishiguchi et al.: "Characterization and sequence determination of the replicator region in the hairy-root-inducing plasmid pRiA4b." Molecular and General Genetics. 206. 1-8 (1987)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Hirayama et al.: "Organization and characterization of the virCD genes from Agrobacterium rhizogenes." Molecular and General Genetics. 213. 229-237 (1988)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Asada et al.: "Cloning and sequencing of a ligninase gene from a lignin-degrading basidiomycete,Phanerochaete chrysosporium." Applied Microbiology and Biotechnology. 29. 469-473 (1988)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Tabata et al.: "Sequence determination and characterization of the replicator region in the tumor-inducing plasmid pTiB6S3." Journal of Bacteriology. 171. 1665-1672 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Aoyama et al.: "Putative start codon TTG for the regulatory protein VirG of the hairy-root-inducing plasmid pRiA4." Gene. 78. 173-178 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Aoyama et al.: "Signal structure for transcriptional activation in the upstream regions of virulence genes on the hairy-root-inducing plasmid A4." Nucleic Acids Research. 17. 8711-8725 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Hirayama&A.Oka: "The virE and virD3 genes are nonessential for induction of hairy roots on plants by Agrobacterium rhizogenes A4." Bulletin of the Institute for Chemical Research,Kyoto University(印刷中).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Aoyama&A.oka: "A common mechanism of transcriptional activation by the three positive regulators,VirG,phoB,and OmpR." FEBS Letters(印刷中).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 日本微生物学協会編(分担): "微生物学辞典" 技報堂出版, 1405 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Aoyama et al.(分担): "Nucleic Acids,Symposium Series No.21" Oxford University Press,New York, 142 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 平山隆志,岡穆宏(分担): "蛋白質・核酸・酵素" 共立出版,

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    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Nishiguchi: "Characterization and sequence determination of the replicator region in the hairy-root-inducing plasmid pRiA4b." Mol. Gen. Genet. 206, 1-8 (1987).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Hirayama: "Organization and characterization of the virCD genes from Agrobacterium rhizogenes." Mol. Gen. Genet. 213, 229-237 (1988).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Asada: "Cloning and sequencing of a ligninase gene from a lignin-degrading basidiomycete, Phanerochaete chrysosporium." Applied Microbiol. Biotechnol. 29, 469-473 (1988).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Tabata: "Sequence determination and characterization of the replicator region in the tumor-inducing plasmid pTiB6S3." J. Bacteriol. 171, 1665-1672 (1989).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Aoyama: "Putative start codon TTG for the regulatory protein VirG of the hairy-root-inducing plasmid pRiA4." Gene 78, 173-178 (1989).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Aoyama: "Signal structure for transcriptional activation in the upstream regions of virulence genes on the hairy-root-inducing plasmid A4." Nucl. Acids Res. 17, 8711-8725 (1989).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Hirayama: "The virE and virD3 genes are nonessential for induction of hairy roots on plants by Agrobacterium rhizogenes A4." Bull. Inst. Chem. Res. Kyoto Univ.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Aoyama: "A common mechanism of transcriptional activation by the three positive regulators, VirG, Phob, and OmpR." FEBS Lett.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1989 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Tabata: "Sequence determination and characterization of the replicator region in the tumor-inducing plasmid pTiB6S3." J.Bacteriol.171. 1665-1672 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] T.Aoyama: "Putative start codon TTG forthe regulatory protein virG of the hairy-root-inducing plasmid pRiA4." Gene. 78. 173-178 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] T.Aoyama: "Signal structure for transcriptional activation in the upstream regions of virulence genes on the hairy-root-inducing plasmid A4." Nucleic Acids Res.17. 8711-8725 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] T.Harayama: "The virE and virD3 genes are nonessential for induction of hairy roots on plants by Agrobactorium rhizogenes A4." Bull.Inst.Chem.Res.Kyoto Univ.(1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] T.Aoyama: "A common mechanism of transcriptional activation by the three positive regulators,VirG,PhoB and OmpR." FEBS Letters. (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] 日本微生物学協会編(分担): "微生物学辞典" 技報堂出版, 1405 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] 平山隆志: "蛋白質・核酸・酵素(特集号)トランスポゾンによる遺伝子のクロ-ニング" 共立出版, (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] R.Nishiguchi: Molecular and General Genetics. 206. 1-8 (1987)

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] T.Hirayma: Molecular and General Genetics. 213. 229-237 (1988)

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] S.Tabata: Journal of Bacteriology. 171. (1989)

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] T.Aoyama: Gene. (1989)

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] T.Aoyama: Nucleic Acids Reserch.

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] R.Nishiguchi: Molecular and General Genetics. 206. 1-8 (1987)

    • 関連する報告書
      1987 実績報告書
  • [文献書誌] T.Hirayama: Molecula and General Genetics.

    • 関連する報告書
      1987 実績報告書

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公開日: 1987-04-01   更新日: 2016-04-21  

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