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5S rRNAの塩基配列に基づくコリネフォルムおよび類縁細菌の系統分類学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 63480057
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学・発酵学
研究機関東京大学

研究代表者

杉山 純多 (1989-1990)  東京大学, 応用微生物研究所, 教授 (80142256)

駒形 和男 (1988)  東京大学, 応用微生物研究所, 教授 (70013331)

研究分担者 鈴木 健一朗  理化学研究所, ライフサイエンス培養生物部, 研究員
杉山 純多  東京大学, 応用微生物研究所, 助教授 (80142256)
研究期間 (年度) 1988 – 1990
研究課題ステータス 完了 (1990年度)
配分額 *注記
5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
1990年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
1989年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1988年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
キーワードコリネフォルム細菌 / ノカルディオフォルム細菌 / Mycobacterium / 系統分類 / 分子進化 / 化学分類 / 系統分類学 / 化学分類学 / 5S rRNA / Rhodococcus / Arthrobacter / Tsukamurella / 5S rRNA塩基配列
研究概要

コリネフォルム細菌は、その属レベルの分類が主に化学分類学的性状を基準になされている。特に細胞壁のペプチドグリカン構造、メナキノン組成、菌体脂肪酸組成、DNAのGC含量が重要な分類指標となっている。コリネフォルム細菌について、属以上のレベルの分類体系を遺伝子の面から評価する手法として、保存性の高いリボソ-ムRNA(rRNA)の中でも最も低分子の5S rRNAの塩基配列の解析を試みた。堀と大沢の方法に従い、朴らのデ-タを踏まえ、11株のコリネフォルム細菌及び類縁細菌の5S rRNAの塩基配列を決定し、分類学的評価を行った。朴らはコリネフォルム細菌を5S rRNAで4つのサブグル-プに分けているが、本質的にはそれに沿った結果が得られた。その結果、 Rhodococcus、Nocardia、Mycobacteriumは、細胞壁がメソジアミノピメリン酸、アラビノガラクタン、ミコ-ル酸を含有するということで化学分類的にはCorynebacterium属との近縁性が示唆されていたにもかかわらず、すべてがCellulomonas、Arthrobacterなど、非メソジアミノピメリン酸の細胞壁のコリネフォルム細菌のサブグル-プに含まれ、Corynebacteriumは、1属で独立したサブグル-プとなることがわかった。また、Brevibacteriumは属の特徴として特異な塩基配列を有することが確認さ
れた。
コリネフォルム細菌の分類体系が混乱してきた原因の一つは、分類学研究に供試されている確実な(authentic)菌株の数が少ないことである。そこで本研究では未分類のコリネフォルム細菌を収集して化学分類学的特徴づけを行い、Tsukamurella属やArthrobacter nicotianae グル-プといった今までに分離例の少ない細菌群を見いだすことができた。これらは今後本細菌群の系統分類の研究を進める上で大いに役に立つものと考えられる。

報告書

(4件)
  • 1990 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1989 実績報告書
  • 1988 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (10件)

  • [文献書誌] J.S.Park,H.Horiand K.Komagata: "Nucleotede sequensces of 5S ribosomal RNAs Planococcus citreus, Planoccus kocurii and Sporosarcina ureae" Nucleic Acid Research. 16. 10358- (1988)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F.Yanagida,H.Hori,K.Suzuki,M.Kosaki and K.Komagata: "Nucleotide sequence of 5S ribosomal RNAs from sporeーforming lactic acid bacteria and Lactobacillus plantarum" Nucleic Acid Research. 16. 10938 (1988)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F.Yanagita,Y.Niimura,E.Koh,K.Suzuki,M.Kozaki andK.Komagata: "Nucleotide sequence of 5S ribosomal RNAs of ′Amphibacillus xylanus′ and Clostridium carnis" Nucleic Acid Research. 17. 443- (1989)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.H.Park,H.Hori,K.Suzuki,J.Sugiyama and K.Komagata: "Further phylogenetic analysis of some coryneform and nocardioform bacteria by 5S rRNA" Journal of General and Applied Microbiology,in preparation.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J. S. Park, H. Hori and K. Komagata.: "Nucleotide sequences of 5S ribosomal RNAs of Planococcus citreus, Planococcus kocurii and Sporosarcina ureae" Nucleic Acid Research. 16 :. 10358 (1988)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F. Yanagida, H. Hori, K. Suzuki, M. Kozaki and K. Komagata: "Nucleotide sequence of 5S ribosomal RNAs from sporeforming lactic acid bacteria and Lactobacillus plantarum" Nucleic Acid Research. 16 :. 10938 (1988)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] F. Yanagida, Y. Niimura, E. Koh, K. Suzuki, M. Kozaki and K. Komagata: "Nucleotide sequence of 5S ribosomal RNAs of 'Amphibacterium xylianus' and Clostridium carnis" Nucleic Acid Research. 17 :. 443 (1989)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. H. Park, H. Hori, K. Suzuki, J. Sugiyama and K. Komagata: "Further phylogenetic analysis of some coryneform and nocardioform bacteria by 5S rRNA" Journal of General and Applied Microbiology,.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Jin-sook,Park: Nucleic Acids Research. 16. 10358 (1988)

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書
  • [文献書誌] Jin-sook,Park: J.Gen.Appl.Microbiol.

    • 関連する報告書
      1988 実績報告書

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公開日: 1988-04-01   更新日: 2016-04-21  

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